Гру можна пройти за трьох персонажів: Пітер Блад, Ян Стейсі і Дієго Еспіноза, кожен зі своєю унікальною сюжетною лінією.
Сюжетна лінія за Пітера Блада
Ви з'явитеся в таверні на наступний день. Містера Вакера немає. Запитайте у господаря таверни, де Вам знайти доктора Вакера. Прямуйте в кімнату таверни. Там Ви знайдете доктора Вакера, який пообіцяє дати Вам позику на двадцять тисяч піастрів в допомогти організації Вашого втечі. Повертайтеся на плантації і знайдіть Джеремі Пітта. Скажіть йому, що він - єдиний штурман і від нього залежить доля втечі. Після того, як він погодиться, Вам потрібно буде знайти трьох рабів: Хагторпа, Огла і Ніколаса Дайка.
Ніколас Дайк скаже Вам, що полковник Бішоп хоче продати його. Поговоріть з полковником Бішопом. Ви знайдете його в його резиденції на плантації. Прямуйте в таверну і випийте разом з одним з п'яниць. Він розповість Вам, що в місто недавно прибув важливий купець, пріятедь полковника Бішопа. Ймовірно це і є Вернон. Знайдіть його будинок. З таверни вийдіть направо, пройдіть повз будинок лихваря, потрібний Вам до - наступний. Дочекайтеся поки Вернон підніметься верх по сходах і обшукайте скриню, який знаходиться прямо під нею. Візьміть все, що в ньому знаходиться, і виходьте на вулицю. Поговоріть з Ніколасом Дайк і повідомте йому, що угода не відбудеться і він може спокійно готується до втечі.
Знайдіть також раба в плямистої бандані - Левайс Моуйера. Він поскаржиться на головний біль і попросить Вас принести йому ліки. Повертайтеся в місто в будинок містера Дена. Його самого зараз немає. Пройдіть на другий поверх і в скриньці поруч з вагами візьміть ліки. Повертайтеся і віддайте ліки Левайс. Натомість він дасть Вам легкий кинджал, який не зможуть виявити стражники.
Тепер знайдіть в одному з будинків одноокого раба Неда Огла. Повертайтеся в місто, знайдіть будинок лихваря і віддайте йому борг 5000 піастрів.
Поговоріть з Піттом і повідомте, що знайшли зброю і команду.
Ви опинитеся на наступний день в своїй хатині. Відправляйтеся в таверну і поговоріть з доктором ВАКЕР. Замість обіцяних 25000 піастрів він дав Вам тільки 18000. Решта потрібно десь роздобути. Зайдіть до лихваря, у нього є для Вас справу. Поговоривши з ним повертайтеся в трактир і поговоріть з його господарем. Дайте йому 500 піастрів інакше він відмовиться говорити. Прямуйте на верф. Поговоріть з самозванцем. Скажіть йому, що він Ваш старий боржник.
Він злякається і віддасть замість 30000 піастрів 55000, хоча це і вплине на Вашу репутацію негативно. Тепер Ви можете або благородно повернути гроші лихваря, або залишити їх для своїх потреб. Тепер, коли у Вас на руках є потрібна сума, повертайтеся в таверну і поговоріть з теслею за одним із столиків. Вийдіть з таверни. До Вас підійде солдатів і накаже відправлятися на плантацію. Повертайтеся на плантацію. По дорозі Вас витратах Натаніель Хагторп і повідомить, що Пітта схопили стражники. Після розмови Ви опинитеся вночі біля воріт міста.
Біжіть на плантацію. Вам потрібно буде непомітно пробратися повз варти до краю плантації і взяти з скрині зброю. Зверніть увагу, у кожного стражника своя зона патрулювання. Зона видимості в темряві маленька, тому головне не проходити прямо на шляху їх слідування. Доберіться до найдовшого білого будівлі. У ближньому від нього кутку плантації побачите купу колод і дощок. Серед них і знаходиться скриня зі зброєю. На жаль, задовольнятися доведеться лише шаблею і декількома лікувальними зіллям. Боротися з охороною майже марно. біля будинку полковника Ви побачите схопленого Пітта і двох охоронців біля нього. Побачите охоронців куди-небудь за ріг і розправтеся з ними. Потім поговоріть з Піттом. Він скаже, що на Вашому шлюпі втік Неталл.
Тепер йдіть з плантації повз охоронців, намагаючись не вступати з ними в бій. Увійдіть в місто. перебейте всіх іспанських гвардійців, виманюючи їх по одному, і до Вас підійде одна леді, подякувати за її порятунок. Вона розповість Вам, що іспанці захопили місто. Прямуйте до верфі. Опливи верф збоку по морю і знайдете своїх товаришів. Пливіть до корабля. Заберіть на нього і перебити охорону. Потім зайдіть в каюту і бийтеся один на один з капітаном. Корабель Ваш. Вийдіть з каюти і поговоріть з Піттом. Поговоріть з командою. Лише Огл погодиться служити Вам вірою і правдою, інші попросяться, щоб Ви їх висадили в першому ж порту. На цьому унікальність сюжетної лінії Блада закінчується.
Щоб почати національну сюжетну лінію в грі, потрібно отримати каперський патент (якщо ви хочете проходити піратську лінію, Вам потрібно поговорити з Морганом в Порті-Рояль). Для цього потрібно виконати близько 10 дрібних доручень у губернатора міста, що належить потрібної Вам лінійки. Нижче описані можливі варіанти цих завдань.
1) Знищити в джунглях банду головорізів. Побігайте по джунглях, знайдете пару головорізів, знищивши їх, незабаром Ви натрапите на главу банди. Убивши його, можна повертатися до губернатора за винагородою.
2) Пошук ворожого шпигуна в місті. Шукати його потрібно в будинках. Як тільки зайдете в потрібний будинок, відразу відбудеться розмова з ним, після якого почнеться битва. Убивши лазутчика, можна повертатися до губернатора за винагородою.
3) Знищити контрабандистів.
4) Пробратись у ворожий форт (місто) і взяти документи у зв'язкового. Завдання не з легких. Пробиратися доведеться під покровом темряви, від найближчого пляжу по джунглях. Солдати в темряві бачать тільки перед собою і не дуже далеко. Тому шанси пробратися непоміченим у Вас є.
Голландська національна сюжетна лінія.
Генерал-губернатор Голландії, у якого Ви будете брати завдання, знаходиться в місті Віллемстад.
5) П'яте завдання - супроводжувати три флейта до поселення піратів Ла Вега і назад. Пливіть до Ла-веге, висаджують. З'ясується, що на поселення напали іспанці і вбили Мансілда. Закупити провіант і виходите в море. Чим більше буде жити кораблів, тим більше буде винагорода. Якщо вціліють всі кораблі, воно складе 60 000 піастрів.
9) Дев'яте завдання - захопити чотири лінійних корабля першого класу, а саме Мановар. Зазвичай вони зустрічаються у великих торгових каравани, військових ескадрах і золотих каравани. За кожен корабель Вам дадуть 50 000 піастрів.
10) Десяте завдання - оборона Кюрасао від нападу іспанської ескадри, що складається з 8 кораблів, включаючи Мановар. Ідіть в порт і виходите в море, там вже форт веде боротьбу із загарбниками, допоможіть йому розгромити іспанців, Після того, як останній іспанець піде під воду, місія по захисту Кюрасао буде виконана. Поверніться в резиденцію за нагородою, яка складе 200 000 піастрів.
12) Дванадцяте завдання - захоплення Маракайбо. Форт там не такий вже і потужний і рознести його праці не складе. Після захоплення колонії для Голландії Ви отримаєте 300 000 піастрів нагороди і можливість захоплення для себе або Голландії англійських і іспанських колоній.