Жива природа - це складне поєднання організмів, популяцій і співтовариств, що існують в різноманітному і невпинно мінливому світі. Стійкість природних систем - здатність зберігатися в умовах потужних антропогенних впливів - визначається запасами рослинної маси і її щорічним відтворенням природним рослинним покривом. Порівняння енергетичних еквівалентів сучасної господарської діяльності людини і природних екосистем. проведене в попередньому розділі, показало, що в Центрі і на півдні Європейської частини Росії рівні впливу на природне середовище перевищують пороги стійкості природних комплексів. При цьому мова йшла про сучасні впливу, а реальний стан екосистем в значній мірі визначається і минулою історією господарського освоєння. в ході якої чоловік зруйнував значну частину природних екосистем, часом, маючи в своєму розпорядженні набагато нижчою, ніж зараз енергооснащеністю, але направляючи свої зусилля безпосередньо на "перетворення природи".
Найбільш кардинально змінені природні екосистеми на урбанізованих територіях [1].
Територія, де максимальна площа повністю зруйнованих природних екосистем (більше 7%) в Росії збігається з розміщенням максимуму перевищення антропогенного енергопотоків над енергією первинної продуктивності рослинного покриву. Тобто зростання енергоозброєності господарської діяльності об'єктивно веде до руйнування природи. Оскільки немає технічних засобів, здатних використовувати енергію зі 100-відсотковим ККД, значна частина енергії перетворюється в різні форми впливу на природу. Коли потужність впливів перевищує продукционную можливість екосистем, природа виявляється фізично позбавленої можливості протистояти впливу.
У той же час для повністю знищених екосистем формально ні де на території Росії не подолана позначений у вступному розділі кордон 10%. Здавалося б, ситуацію можна вважати відносно благополучною. Однак, крім урбанізації існують і інші форми перетворення природи людиною, які хоча і зберігають процеси природного функціонування екосистем, але кардинально їх змінюють. В першу чергу сказане відноситься до землеробства, в ході якого складні природні співтовариства степу, луків і навіть лісів замінюються штучно підтримуваної монокультури, яка не так робить внесок в глобальну стійкість біосфери, скільки перешкоджає її реалізації. Хоча енергетична продуктивність агроценозів може перевищувати продукцію природного рослинного покриву, вироблена агроценозами біомаса не бере участі в природних біогеохімічних циклах, вивозиться з полів, а компенсація втрат біогенних елементів в основному виробляється мінеральними добривами.
Ще більші втрати стійкості пов'язані з втратою адаптивності за рахунок спрощення структури в агроценозах, збіднення видового складу організмів, що беруть участь в їх функціонуванні. Не дарма підтримку продуктивного рослинництва вимагає постійних енергетичних вкладень у вигляді переорювання, прополки, пестицидів для боротьби з бур'янами та шкідниками. Порушення природної стійкості вимагає додаткових витрат енергії на підтримку нестійкого ценоза, яке народжує додаткове руйнування природних систем і черговий цикл зниження стійкості.
До антропогенно - трансформованим можна віднести екосистеми меліорованих боліт, затоплені водосховищами заплави і долини річок, луки і пасовища на місці лісів [2].
Аналіз факторів впливу показує, що найбільший внесок у трансформацію природних екосистем дає їх аграрне використання. Природний рослинний покрив найбільше постраждав в степовій і лісостеповій зонах країни. Саме трав'яні екосистеми були втрачені в Росії більше, ніж будь-які інші. Найбільш характерною особливістю європейських степів зараз є їх фрагментарність. Решта ділянок степової рослинності продовжують використовуватися в якості кормових, головним чином пасовищних угідь. В даний час надзвичайно швидко скорочуються площі і деградує природна лугова рослинність. З трав'яних екосистем більше інших постраждали високо продуктивні і мають специфічну структуру лугові комплекси річкових заплав
У лісовій частині країни найбільша трансформація пов'язана з рубками лісів. Сучасні обсяги рубок і загальна їх площа проаналізовані в окремих розділах цього Атласу. Зміни лісистості починаючи з періоду Давньої Русі було проаналізовано нами в спеціальному виданні [3]. На даний момент максимальне вилучення деревної фітомаси з одиниці лісової площі відбувається в лісах Європейської частини і особливо в ряді областей лісостепової зони. Необхідно звернути увагу на важливу просторову кореляцію показника сумарних втрат фітомаси і сучасного вилучення деревини при рубках лісів.
З найбільш стійких екосистем найбільші деформації властиві южнотаежной і лісостеповій зонах Російської рівнини, передгір'я Кавказу і Кемеровській області (обезлесивание, розвиток аграрного виробництва або видобутку сировини). Різниця областей Уралу пов'язано з більшою аграрної трансформацією Башкирії і Челябінської області. Пермська і Свердловська області при більш високому рівні промислового впливу зберегли свій лісовий потенціал. В цілому аграрна трансформація природного середовища і масовані рубки лісів знижують потенціал самовідновлення біоти в більшій мірі, ніж промислова діяльність.
З видів сільськогосподарських впливів найменшим трансформирующим ефектом володіє пасовищне скотарство. Небезпеку становлять лише значні перевищення пасовиську навантаження в періоди сухих кліматичних циклів. Рослинність деградованих пасовищ швидко відновлюється при скороченні поголів'я худоби, особливо якщо воно збігається з прохолодно-вологого фазою клімату.