Дослідженню травної системи повинен передувати ретельний збір анамнезу: з'ясовують склад раціону, режим годування, кількість і якість кормів, час захворювання тварини і т.д.
Дослідження здійснюють в наступному порядку: досліджують процес прийому корму і води, порожнину рота і глотки, стравохід, шлунок, кишечник, печінку, акт дефекації. При необхідності проводять ректальну пальпацію доступних органів черевної порожнини. У ряді випадків використовують додаткові методи - зондування стравоходу і шлунка, прокол черевної стінки, дослідження рубцевого і шлункового вмісту, калу і т.д.
На апетит і поедаемость корми можуть впливати якість кормів і поживність раціону. Розлад в прийомі корму та води може виникати на ґрунті ураження язика, губ, зубів, жувальних м'язів, щелепи і глотки.
Перекручення апетиту - поїдання забрудненої підстилки, дернини, жування шматків дерева, гуми, облизування стін і т.д. служить симптомом порушення мінерального і вітамінного обміну.
При огляді порожнини рота звертають увагу на стан слизової оболонки губ, щік, ясен, мови. Особливо важливо оцінити стан зубів, їх будова, прикус, правильність стирання.
Хиткість зубів у дорослих тварин вказує на патологію кісткової системи (остеодистрофія у дорослих і рахіт у молодняку). Стан глотки (її чутливість і болючість) визначають пальпацією верхній області шиї (верхнього краю яремного жолоба).
Стравохід досліджують методами спостереження за прохідністю харчового кома, оглядом і пальпацією, при необхідності - його зондуванням. При закупорці і дивертикулі стравоходу в шийної області спостерігається припухлість.
У жуйних тварин важливе значення має дослідження передніх камер багатокамерного шлунка окремо: рубця, сітки, книжки і сичуга. При дослідженні жуйного процесу звертають увагу на час появи жуйки (в нормі 20 - 30 хв після прийому корму), кількість жуйних періодів (6 -8 протягом доби), тривалість кожного періоду (30 - 40 хв), активність процесу жування.
При хворобах камер шлунка, кишечника, печінки, а також інфекційних, інвазійних та інших хворобах відзначають сповільнену, рідкісну, коротку, мляву, хворобливу жуйку аж до се повного припинення.
Рубець досліджують у всій лівій половині черевної порожнини (ліва голодна ямка). Кількість скорочень рубця підраховують протягом 2 або 5 хв. У здорових тварин протягом 2 хв відбувається 3 - 5 скорочень, у овець і кіз - від 2 до 6. Сітку досліджують внизу діафрагми в області мечоподібного хряща способом глибокої пальпації. У здорових тварин, як правило, глибока пальпація не викликає болю. Больова реакція з'являється при травматичному пошкодженні сітки. Книжку аускультіруют в правому підребер'ї (7 -9-е міжреберні проміжки), нижче плече-лопаткового зчленування. Ослаблення шумів або повне їх зникнення може свідчити про її закупорці. Сичуг досліджують в правому підребер'ї (він прилягає до черевної стінки) уздовж реберної дуги (від мечоподібного хряща до XII ребра). При запаленні сичуга і виразках реєструють його напруженість і болючість.
Кишечник у жуйних тварин аускультіруют в правому подвздохе середнього відділу черевної порожнини: вгорі - дванадцятипалу і пряму, в середині - сліпу, подвздошную і ободову, внизу - худу кишки.
Вислуховування кишечника дозволяє встановити наявність, силу і характер його перистальтичних шумів. Посилення шумів спостерігається при запаленні кишечника, скупченні в ньому газів, поїданні легкобродящіх кормів. Ослаблення шумів або повна їх відсутність свідчить про атонії шлунково-кишкового тракту або повної кишкової непрохідності.
Дослідження шлунка. У коня шлунок лежить в передньому черевному відділі і звичайними методами дослідження недоступний у зв'язку з дуже об'ємним товстим відділом кишечника. У свині і м'ясоїдних він прилягає до нижньої черевної стінки, розташований більше в лівому підребер'ї. Він доступний для пальпації, аускультації і перкусії.
Дослідження кишечника. У коня тонкий відділ кишечника розташований переважно в лівій половині черевної порожнини (верхня частина лівого подвздоха), товстий відділ кишечника займає майже всю праву половину.
У свині тонкий відділ кишечника розташований між печінкою і конусом ободової кишки. Його досліджують переважно в області правої і лівої нижньої третини живота.
У собаки петлі тонких кишок досліджують в нижній частині подвздоха, у верхній частині досліджують товстий відділ кишечника.
Ректальне дослідження можливо у коня і великої рогатої худоби. При дослідженні травної системи звертають увагу на стан калових мас і акт дефекації. Кал у різних видів тварин має певні консистенцію, колір і запах. Дефекація у великої рогатої худоби відбувається через кожні 1,5 - 2 год, за добу виділяється до 50 кг калу; у коня - через 2 -5 ч - до 20 кг калу; у собаки - 1 - 2 рази на добу.
При патологічних станах відзначають пронос, запор, мимовільну, хворобливу, напружену дефекацію. Різкий гнильний запах кал набуває при гнильних процесах в кишечнику.
У калі можна виявити пісок, кров, гній, кишкових паразитів і т.д.
Для функціональної оцінки органів травлення проводять дослідження вмісту рубця, шлункового соку, іноді лапаро- і гастроскопію, румінографію, прокол рубця і т.д.