На сьогоднішній день центр є унікальним закладом, який виконує російські та міжнародні фундаментальні і прикладні наукові проекти в галузі ядерної медицини, який займається підготовкою кадрів із забезпечення радіаційних технологій, який надає спеціалізовану та високотехнологічну медичну допомогу з використанням рентгенохірургіческіх, радіонуклідних, позитронного і протонних методів діагностики і терапії.
Стаціонар центру має багатопрофільної клінічної базою на 260 ліжок. Застосовуються унікальні методики обстеження та лікування хворих з різними захворюваннями. Проводиться активна робота по впровадженню та реалізації новітніх технологій в області інтервенційної радіології, технологій трансплантації донорської спорідненої і трупної печінки. У центрі є 6 операційних, повністю оснащених обладнанням для проведення унікальних онкологічних, серцево-судинних операцій та трансплантації органів, в тому числі в умовах штучного кровообігу.
Основним напрямком наукової та практичної діяльності відділення рентгеноендоваскулярної і оперативної хірургії є розробка і впровадження нових методів хірургічного та комплексного лікування дифузних і вогнищевих захворювань печінки, злоякісних новоутворень підшлункової залози та інших органів шлунково-кишкового тракту.
Відділення рентгеноендоваскулярної і оперативної онкоурології є підрозділом відділу інтервенційної радіології та оперативної хірургії РНЦРХТ, організовано в 1985 році. У відділенні одночасно отримують лікування 40 пацієнтів. У штаті відділення 4 наукових співробітника і 3 лікаря. Оснащення відділення дозволяє проводити обстеження і лікування пацієнтів урологічного профілю в повному обсязі. Застосовувані методи діагностики і лікування урологічних та онкоурологіческіх захворювань відповідають сучасним світовим стандартам. Лікувальна діяльність відділення успішно поєднується з науковою роботою і викладацькою діяльністю.
Відділення радіохірургічною гінекології займається лікуванням хворих на рак яєчників, шийки та тіла матки, поєднуючи в рамках одного підрозділу хірургічне лікування з хіміо- та променевою терапією. При лікуванні хворих використовуються сучасні методи комбінованої та комплексної терапії. Застосовуються сучасні методи діагностики і моніторингу: комп'ютерна, магнітно-резонансна, позитронно-емісійна томографія, тривимірне ультразвукове дослідження, пухлинні маркери, імуногістохімічне дослідження і т.п.У поліклінічному відділенні надається консультативна допомога та здійснюється відбір хворих для стаціонарного лікування. Для цієї роботи залучаються провідні фахівці РНЦРХТ.