При відкачці мед а частинки віск а, перги і просто сміття потрапляють в мед. Їх необхідно видаляти з меду.
У невеликих бджільницьких господарствах це відбувається при зливі меду з медогонки за допомогою подвійного сита. Воно складається з великого верхнього сита зі стандартним розміром осередку (1,8x0,7 мм) і дрібного нижнього сита (0,2x0,12 мм), які вставляються одне в інше і можуть закріплюватися на ємностях будь-якого діаметру.
При покупці сита слід звернути увагу на те, щоб сита були виготовлені з нержавіючого матеріалу, так як вони служать довше і краще відмиваються, ніж сита з лудженого матеріалу. Осередки подвійного сита дуже швидко забиваються частинками воску. Щоб не доводилося зупиняти процес відкачування меду, доцільно мати два сита. Для очищення подвійне сито розбирається. Застряглі частинки воску і мед видаляються скребком в ще одне сито, щоб залишки меду могли повністю стекти. Окремі сита промивають холодною водою і просушують, перш ніж їх знову з'єднати.
Щось більш зручне представляють собою наявні в продажі воронки з ситом. Перекривається нижній отвір дозволяє контролювати рівень заповнення ємності, а плоске подвійне сито на всю площу верхнього діаметра воронки запобігає потраплянню в ємність сторонніх часток.
Для більших бджільницьких господарств ці пристосування вже не підходять, оскільки їх продуктивність мала. Щоб мати можливість прискорити процес відкачування, у багатьох господарствах сьогодні відмовляються від фільтрації меду при відкачці. Її проводять після завершення відкачування.
Для фільтрації великої кількості меду добре підходить сито Лунцера. Воно складається з двох циліндричних сит, внутрішнього «грубого» і зовнішнього «тонкого». Обидва сита вставляються в більшу ємність з двома зливними кранами, розташованими на різній висоті. Мед наливають в грубе сито; пройшовши через тонке сито, мед потрапляє в ємність, з якої його можна зливати через крани. Легкі частинки воску спливають на поверхню меду і періодично повинні віддалятися з неї. Закупорювання вертикальних сит, що дістають до самого дна ємності, статися не може. Для фільтрації верескового або мелецітозного меду сито Лунцера використовувати не можна, так як важкі кристали цукру опускаються на дно і швидко закупорюють всю площу сита.
Останнім часом в торгівлі з'явилися великі сита у вигляді воронок, які працюють за описаним вище принципом. У великих господарствах мед очищають за допомогою спеціально призначених для цього центрифуг, які використовуються для очищення забруса, або за допомогою сітчастих барабанів, що вставляються в звичайні медогонки. Під дією відцентрових сил легко фільтруються навіть дуже в'язкі меди, такі як лісовий і вересковий, особливо в тому випадку, коли мед перед фільтрацією зберігався при кімнатній температурі або навіть був підігрітий. Так як в сітчастий барабан входить до 25 кг меду, а підігрітий мед фільтрується легко і швидко, то наявність двох спускних кранів в баку має певну перевагу. Щоб підтримувати продуктивність центрифуги на належному рівні, слід періодично обережно зчищати відклався на внутрішніх стінках барабана віск Після закінчення роботи барабан слід вийняти з бака, промити холодною водою і просушити. Що залишився в баку мед зливають через подвійне сито, нахиливши медогонку. Недоліком автоматизованого способу фільтрації можна вважати те, що в мед потрапляє велика кількість бульбашок повітря, в результаті чого мед довше відстоюється.