Далі, на основі складеного плану, розробляється програма аудиторської перевірки, яка є переліком аудиторських процедур по кожному виду аудиторських робіт, і проводиться перевірка.
Розглянувши питання, пов'язані з видами внутрішнього фінансово-економічного контролю, можна зробити деякі висновки.
Важливим для кожного економічного суб'єкта є функції внутрішнього фінансово-економічного контролю. Внутрішній контроль організовується керівництвом підприємства і визначає законність здійснення господарських операцій, їх економічну доцільність.
У здійсненні внутрішнього контролю найважливіше місце займають працівники бухгалтерії, крім головних бухгалтерів. Функцію контролю головний бухгалтер виконує окремо через апарат бухгалтерії. На великих же підприємствах є фахівці, на яких покладено обов'язки контролерів.
Наявність внутрішнього контролю посилить контрольну функцію самого підприємства, причому його результати можуть бути базою для проведення як державного, так і аудиторського контролю, які є зовнішніми для підприємства.
В сучасних умовах свого рішення вимагає законодавче забезпечення внутрішнього фінансово-економічного контролю, нинішній стан якого дозволяє говорити лише про його створення, а не про розвиток. Слід законодавчо закріпити основи функціонування служб внутрішнього контролю і встановити основи їх взаємодії з іншими органами фінансового контролю.
Важливим напрямком удосконалення системи внутрішньогосподарського контролю є розробка і реалізація найбільш раціональних форм, методів його здійснення, що сприяють зниженню зловживань посадових осіб, збереження і раціонального використання фінансових ресурсів, зниження трудомісткості контрольної роботи (наприклад, впровадження бюджетування, орієнтованого на результат) [5, с. 162].