Дивує озеро ще й кількістю розташованих на ньому островів, яких налічується близько 169 штук. Багато з них не такі вже й великі за площею (близько 10 метрів діаметром), але найбільшим вважається острів Хачін, на якому розташувалося 13 власних невеликих озер.
Про дивну озері Селігер з його різноманіттям островів була складена не менше дивовижна і прекрасна легенда. Оповідає легенда про те, що в дуже давні часи на землі жили брати-озера Ільмень і Селігер. У братів була Волга-сестра, яку вони дуже любили. І ось попросила якось Волга показати їй Каспійське море, про чиєму велич вона чула. Чи не могли відмовити їй брати і пообіцяли виконати бажання. Зібралися вони в похід, але домовилися йти всім разом і тільки вдень, щоб не заблукати і не загубитися. Так і було зроблено, йшли кілька днів вони. Але ось одного разу вночі прокинувся Ільмень брат і побачив, що брат Селігер його обдурив і пішов разом з сестрою потайки. Розгнівався брат Ільмень за таке зрада. і прокляв його за обман такими словами: «О, яка зрадила мене брат Селігер, проклинаю тебе за невірність! Так нехай на спині твоїй виявиться сто горбів! »Боги почули його і за те, що Селігер порушив клятву, виконали прокляття брата. З тих пір і носить Селігер на собі таку кількість островів-горбів.
Сьогодні озеро має берегову лінію протяжністю в 590 кілометрів. Площа води 260 квадратних кілометрів. Має Селігер великі і маленькі плеса, які з'єднані між собою протоками. Плесо - це відносно велика за площею водний простір озера, розташоване між островами.
Має озеро так само і протоки, вузькі з них називають межтокамі, великі називають річками. Загальна кількість проток становить 23 штуки. Озеро має піщане дно. Через безліч мілин, розташованих на озері, плавати по ньому можуть тільки невеликі судна, проте є велика впадина, глибина якої становить 30 метрів.
Саме озеро і навколишні його пейзажі наповнені чарівною красою, тому варто відвідати це місце.