Мікробом, або мікробіота, або мікрофлора людини складається з усього набору мікроорганізмів, які живуть в організмі і на тілі. Насправді, всередині нашого організму в 10 разів більше бактерій, ніж на шкірі. Вивчення мікробіома людини охоплює сукупність всіх мікробів і геноми мікробних спільнот організму людини.
Ці мікроби знаходяться в різних місцях екосистеми людського тіла і виконують важливі функції, необхідні для нашого здоров'я. Наприклад, кишкові бактерії дозволяють нам правильно перетравлювати і поглинати поживні речовини з продуктів, які ми вживаємо в їжу.
Генна активність корисних мікробів, які колонізують організм, впливає на фізіологію людини і захищає від патогенних бактерій. Порушення належної активності мікробіома пов'язано з розвитком ряду аутоімунних захворювань, включаючи діабет і фіброміалгию.
мікробом людини
Мікроскопічні організми, які мешкають в організмі, включають археї, бактерії, гриби, Найпростіші і віруси. Мікроби починають колонізувати наш організм з моменту народження. Мікробіота людини змінюється за кількістю і типом мікроорганізмів протягом усього життя, причому число видів збільшується з народження до дорослого віку і зменшується в літньому віці. Ці мікроби унікальні від людини до людини і можуть бути порушені певними видами діяльності, такими як миття рук або прийняття антибіотиків. Бактерії є найчисленнішими мікроорганізмами в мікробіома людини.
- Археї - одноклітинні екстремофільних прокаріоти, здатні жити в самих екстремальних умовах. Вони колись вважалися бактеріями, але було виявлено, що археї відрізняються від бактерій структурою клітинної стінки і типом рРНК. Археї, такі як метаногени, які потребують вільних від кисню умовах, щоб вижити можна знайти в кишечнику людини.
- Бактерії - одноклітинні прокаріоти, що розрізняються за видами і формами. Ці різноманітні мікроорганізми здатні жити в різних умовах і можуть бути виявлені в різних областях тіла, в тому числі на шкірі, всередині травного тракту і всередині жіночого репродуктивного тракту.
- Гриби - одноклітинні (дріжджі і цвілі) і багатоклітинні (гриби), що містять спороутворюючі плодові тіла для розмноження. Грибкові спільноти тіла також називають мікобіомом. Одноклітинні дріжджі колонізують різні області тіла, такі як шкіра, піхву і шлунково-кишковий тракт.
- Найпростіші - різноманітна група одноклітинних і багатоклітинних еукаріот. Багато Найпростіші не мають загальних характеристик, але групуються разом, так як не є тваринами, рослинами або грибами. Прикладами протистов є амеби і парамеции. У той час як багато Найпростіші паразитують на своїх господарів, інші існують в комменсальних (один вид отримує вигоду без шкоди іншій) або взаємовигідних відносинах (обидва види корисними один одному). Найпростіші, які зазвичай знаходяться в кишечник людини, включають Бластоцисти (Blastocystis) і Ентеромонади (Enteromonas hominis).
- Віруси - частки, що складаються з генетичного матеріалу (ДНК або РНК), укладеного в шар білка, званий капсидом. Ряд вірусів є частиною людського мікробіома і включають віруси, що заражають різні типи клітин організму. наприклад, бактеріофаги - віруси, які інфікують бактерій, і сегменти вірусного гена вбудовані в хромосоми людини. Віріони (неактивні вірусні частинки) можуть зустрічатися в декількох областях тіла, включаючи шлунково-кишковий тракт, рот, дихальні шляхи і шкіру.
Мікробом людини також включає мікроскопічних тварин, таких як кліщі. Ці крихітні членистоногі зазвичай колонізують шкіру.
мікробом шкіри
Шкіра людини заселена поруч різних мікроорганізмів, які живуть на поверхні шкіри, а також в залозах і волоссі. Наша шкіра знаходиться в постійному контакті з зовнішнім середовищем і є першою лінією захисту організму від потенційних патогенів. Мікробіота шкіри допомагає запобігти колонізацію шкіри патогенами. Вона також допомагає тренувати нашу імунну систему, попереджаючи імунні клітини про наявність патогенів та ініціюючи імунну відповідь.
Екосистема шкіри людини дуже різноманітна, з різними верствами шкіри, рівнями кислотності, температурою, товщиною і впливом сонячного світла. Таким чином, мікроби, які живуть в певному місці на шкірі або всередині неї, відрізняються від мікробів в інших частинах тіла. Наприклад, мікроорганізми, що населяють вологі і гарячі частини тіла (під пахви), відрізняються від тих, які колонізують сухі, більш холодні поверхні шкіри на руках і ногах. Комменсальние мікроорганізми, які зазвичай населяють нашу шкіру, включають бактерій, віруси, гриби та мікроскопічних тварин, таких як кліщі.
Бактерії, що колонізують шкіру, процвітають в одному з трьох типів шкіри: жирної, вологою і сухою. Три основних види бактерій, що населяють ці типи шкіри включають: пропіоновокислі бактерії (Propionibacterium) - виявлені переважно на жирних ділянках; коринебактерии (Corynebacterium) - виявлені у вологих областях; стафілококи (Staphylococcus) - населяють сухі ділянки.
Хоча більшість цих видів бактерій не є небезпечними, вони можуть стати шкідливими для людини при певних умовах. Наприклад, пропіонібактеріі акне (Propionibacterium acnes) живуть на жирних поверхнях шкіри, таких як особа, шия і спина. Коли організм виробляє надлишкову кількість жиру, ці бактерії розмножуються дуже швидко, що може привести до розвитку акне. Інші види бактерій, наприклад, золотистий стафілокок (Staphylococcus aureus) і стрептокок піогенес (Streptococcus pyogenes), можуть викликати більш серйозні проблеми, такі як септицемія і ангіна.
Не так багато відомо про комменсальних віруси шкіри, оскільки дослідження в цій області поки нечисленні. Було виявлено, що віруси знаходяться на поверхнях шкіри, сальних залозах і всередині бактерій шкіри.
Види грибків, які колонізують шкіру людини, включають кандидоз (Candida), Малассеза (Malassezia). криптококком (Cryptocoocus), дебаріоміцес (Debaryomyces) і мікроспорія (Microsporum). Як і у випадку з бактеріями, грибки розмножуються з надзвичайно високою швидкістю і можуть викликати проблемні стану і захворювання. Грибки Малассеза здатні викликати лупа і атопічний екзему.
Мікроскопічні тварини, що населяють шкіру, включають кліщів. Наприклад, кліщі демодекс (Demodex) колонізують особа і живуть всередині волосяних фолікулів. Вони харчуються шкірним жиром, мертвими клітинами і навіть деякими бактеріями.
мікробом кишечника
Мікробом кишечника людини відрізняється різноманітністю і чисельністю. Він включає трильйони бактерій з тисячами різних видів. Ці мікроби процвітають в суворих умовах кишечника і активно беруть участь в підтримки травлення, нормального метаболізму і належної імунної функції. Вони допомагають у перетравленні неперетравлюваних вуглеводів, метаболізмі жовчних кислот і ліків, а також в синтезі амінокислот і багатьох вітамінів.
Кілька кишкових мікроорганізмів продукують протимікробні речовини, які захищають нас від патогенних бактерій. Склад кишкової мікробіоти унікальний для кожної людини і постояно змінюється. Він змінюється з такими факторами, як вік, зміна раціону, вплив токсичних речовин (антибіотики) і зміни в стані здоров'я. Відхилення в складі комменсальних мікроорганізмів кишечника пов'язують з розвитком шлунково-кишкових захворювань, таких як запальні захворювання кишечника, целіакія і синдром подразненої товстої кишки.
Переважна більшість бактерій (близько 99%), які мешкають в кишечнику, в основному складаються з двох типів: бактероїди (Bacteroidetes) і фірмікути (Firmicutes). Приклади інших типів бактерій, виявлених в кишечнику, включають протеобактерии (наприклад, ешерихії (Escherichia), сальмонели (Salmonella) і вібріони (Vibrio)), ак-ти-но-бак-ті-рії (Actinobacteria) і мелаінабактеріі (Melainabacteria).
Мікробом кишечника також містить археї, гриби і віруси. Самі поширеними археями в кишечнику є метаногени Methanobrevibacter smithii і Methanosphaera stadtmanae. Види грибків, що мешкають в кишечнику людини, включають кандидоз (Candida), сахароміцети (Saccharomyces) і кладоспоріі (Cladosporium). Зміни в нормальному складі кишкових грибків були пов'язані з розвитком таких захворювань, як хвороба Крона і виразковий коліт. Найбільш поширені віруси в мікробіома кишечника - це бактеріофаги, які інфікують кишкові бактерії.
Мікробом ротової порожнини
Мікробом ротової порожнини налічує мільйони мікроорганізмів, що існують, як правило, в взаємовигідних відносинах з господарем. У той час як більшість мікробів є корисними, запобігаючи ротову порожнину від колонізації шкідливими мікроорганізмами, деякі з них можуть стає патогенними при певних умовах.
Бактерії є найбільш численними з мікроорганізмів ротової порожнини і включають стрептококи (Streptococcus), актиноміцети (Actinomyces), лактобактерії (Lactobacterium), стафілококи (Staphylococcus) і пропіонібактеріі (Propionibacterium). Бактерії захищають себе від стресових умов в роті, справляючи липке речовина, зване біоплівки. Біоплівка захищає бактерії від антибіотиків, інших мікроорганізмів, хімічних речовин, чищення зубів або речовин, небезпечних для мікробів. Біоплівки різних видів бактерій утворюють зубну бляшку, яка прилипає до поверхонь зубів і може викликати їх руйнування.
Ротові мікроби часто взаємодіють в інтересах один одного. Наприклад, бактерії і грибки іноді співіснують у відносинах, які можуть завдати шкоди господареві. Бактерія стрептокок мутанс (Streptococcus mutans) і грибок кандида альбіканс (Candida albicans), що працюють в зв'язці, викликають серйозні проблеми з зубами, що найчастіше зустрічаються у дошкільнят.
Археї в ротовій порожнині, включають метаногени Methanobrevibacter oralis і Methanobrevibacter smithii. Найпростіші, що живуть в порожнині рота, включають ротову амебу (Entamoeba gingivalis) і ротова трихомонада (Trichomonas lenax). Ці комменсальние мікроорганізми харчуються бактеріями або харчовими частинками і зустрічаються в набагато більшій кількості у людей із захворюванням ясен. Ротові віруси переважно складаються з бактеріофагів.