Без перебільшення можна визнати, що АПК є основною життєдіяльності країни, адже саме в АПК входять галузі народного господарства, які відповідають за підсумкове виробництво продуктів харчування. Саме від ефективності функціонування АПК залежить забезпеченість країни продовольством, кормами для тваринництва і сировиною.
На жаль, протягом багатьох років АПК Росії переслідує постійні проблеми, що заважають ефективній діяльності і планомірного розвитку.
В першу чергу це слабка забезпеченість сільськогосподарської техніки та переробний галузі АПК. Слід враховувати, що більшість підприємств досі експлуатують морально застарілу сільськогосподарську техніку та обладнання, при цьому ступінь зносу часто становить понад 50%. Варто зазначити, що забезпеченість технікою на одиницю оброблюваної площі в Росії на дуже низькому рівні і складає не більше 60% від необхідних за технологічно потреб. Це призводить до підвищеного навантаження на техніку і збільшення коефіцієнта вибуття техніки через вихід з ладу. В результаті переробки досі характерні досить високі втрати. Наприклад, втрати зібраного зерна можуть становити до 30% врожаю, а овочів до 40%. При цьому на сучасне обладнання та техніку у більшості підприємств просто немає коштів. Хоча на сьогоднішній день більшість вітчизняних компаній виробляють цілком добротну сільськогосподарську техніку за прийнятними цінами і готові забезпечити високий рівень сервісного обслуговування та технічного забезпечення техніки.
По-друге, величезною проблемою АПК Росії є довгострокова практика скорочення обсягів виробництва, яка характерна для останніх десятиліть. В результаті скоротилися до мінімуму посівні площі і поголів'я худоби в тваринництві. Це стало прямим наслідком діяльності держави - посилення інфляції, порушення господарських зв'язків, скорочення державного співфінансування та надання пільгових кредитів, зниження купівельної спроможності населення. На сьогоднішній день інфраструктура земельного ринку знаходиться в стагнації, величезні потенційно родючі площі земель простоюють. Щорічно з сільськогосподарського обороту виводяться тисячі га земель, а роботи по осушенню, зрошенню і меліорації землі практично припинені.
По-третє, дуже повільно розвивається інформаційне забезпечення і економічна інфраструктура в секторі АПК при загальному низькому рівні фінансової освіти в секторі. В результаті сектор АПК характеризується сезонністю надходження грошових коштів і нестачею власних оборотних активів при високій кредиторської заборгованості (левову частку яких становлять штрафи і пені за прострочені виплати). Банківський сектор і система оподаткування не враховують сезонний характер виробництва, чим створюють додаткові складності для аграріїв.
У сукупності ці проблеми призводять до того, що в Росії дуже низький рівень врожайності сільськогосподарських культур.
По-четверте, сектор АПК абсолютно незахищений перед іншими галузями. Проблеми пошуку ринку збуту, і агресивна політика посередників привели до багаторазового зниження частки виробників сільськогосподарської продукції в роздрібній ціні готового продукту. При цьому варто відзначити, що проблема збуту для вітчизняного виробника значно ускладнена високою конкуренцією з боку іноземних виробників, які крім виробництва випереджають вітчизняні компанії в плані маркетингу і технологій продажів. Погіршує становище нерозвиненість аграрних ринків і штучне регулювання цін на продукцію.
По суті, вибудувана ланцюжок руху товару перешкоджає контактам між споживачем і виробником тим самим обмежуючи можливість вітчизняним підприємствам реалізовувати продукцію за прийнятними цінами.
По-шосте, проблемою АПК є неоднорідність галузей. В АПК є сусідами відносно стабільна харчова промисловість, націлена на кінцевого споживача, і що знаходиться в складній ситуації сільське господарство.
В цілому, незважаючи на цілий ряд позитивних моментів, АПК Росії перебуває в стані глибокої системної кризи, для виходу з якого власних сил недостатньо і необхідна підтримка з боку держави. Саме державне регулювання і підтримка АПК на сьогоднішній день є основним моментом вирішення існуючих проблем. Для збереження ефективності в секторі АПК державне регулювання і державна підтримка не просто необхідні, а неминучі.
Для ефективної діяльності і планомірного розвитку АПК необхідно формування програми державної підтримки сектора з метою залучення інвестицій та інновацій. При грамотному підході всі проблеми можна вирішити, але для цього потрібен тривалий час і планомірне вирішення всієї сукупності проблем. Саме сьогодні, коли Росія знаходиться в лещатах європейських санкцій, саме час звернути свій погляд на АПК - сектор здатний забезпечити продовольчу безпеку країни і стати основним сегментом реалізації політики імпортозаміщення.