Гриби в залежності від будови поділяються на: вищі нижчі.
У вищих грибів міцелій розділений перегородками на окремі клітини, що містять одне, два або багато ядер.
У деяких грибів, наприклад дріжджів, вегетативне тіло представлено поодинокими нирки клітинами.
У нижчих грибів клітини міцелій неклітинний, він позбавлений перегородок і являє собою як би одну гігантську клітину з великим числом ядер.
Нижчу групу (іноді її поділяють на кілька класів) входить близько тисячі видів з нечленістие, одноклітинним міцелієм. Іноді гіфи у нижчих грибів не утворюються, а виникає плазмодій - розростання цитоплазми з багатьма ядрами. Диплоидное стан тільки в зиготі, все життя проходить в гаплофазе.
Всім відомий представник цієї групи - мукор - утворює білу цвіль на кінському гної і харчових продуктах. При зустрічі гіф різного знака їх кінці зливаються і утворюється зигота (стадія діплофази). З зиготи виростає довгий спорангіеносец з бурим кулястим спорангієм на кінці. У цьому спорангії утворюється до 10 тисяч (початок гаплофази), які розносяться вітром і, потрапивши в сприятливі умови, утворюють новий міцелій.
Інші нижчі гриби не нешкідливі. Один з найнебезпечніших шкідників картоплі та томатів - фітофтора. Вона вражає бадилля і бульби картоплі, від чого вони чорніють і відмирають. У дощове літо відбувається масовий розвиток зооспор, які проникають в грунт і заражають бульби, чому урожай гине.
Настільки ж небезпечний інший грибок - сінхітріум, збудник раку картоплі. Бульби при цьому покриваються горбистими розростаннями і містять мало крохмалю.
Не менш відомий ольпідій капустяний, "чорна ніжка" капусти. Вже у капустяної розсади він викликає почорніння кореня, потім чорнота розповзається по стеблу і рослина гине.
Зигоміцети (лат. Zygomycota) - відділ грибів, який об'єднує 10 порядків, 27 родин, близько 170 пологів і понад 1000 видів. Відрізняються розвиненим ценоцітним міцелієм непостійній товщини, в якому септи утворюються тільки для відділення репродуктивних органів.
Зооспорангії Batrachochytrium dendrobatidis на прісноводому рачків (a) і на водорості (b)
Хитридиомицетов (лат. Chytridiomycota) - відділ царства грибів (Fungi). Об'єднує більше 120 пологів і близько 1000 видів. Міцелій слаборазвіт, основна маса таллома є т.зв. полум'яне тіло, з якого виростають різоідние гіфи.
Хитридиомицетов тісно пов'язані з водним середовищем, де паразитують на водоростях і безхребетних. Можуть викликати масову загибель водних організмів аж до амфібій. Можуть розвиватися у вологих ґрунтах і викликати хвороби вищих рослин: чорну ніжку капусти (Olpidium brassicae), рак картоплі (Synchytrium endobioticum) і ін. Проте не такі небезпечні як ооміцети. Менша кількість хитридиомицетов сапротрофи.
Вишіе. Ця група ділиться на кілька класів. Клас Сумчасті гриби (близько 25 тисяч видів) названий так тому, що статевий процес у його представників завершується в особливому мішкоподібної органі - аске (сумці). Саме там кінчається діплофаза і утворюються гаплоїдні спори. Сумки можуть виникати прямо на міцелії. У вдруге спрощених дріжджових грибків клітини просто зливаються і зигота утворює сумку з чотирма гаплоїдний суперечками. У інших сумки розвиваються в особливих плодових тілах.
Серед сумчастих грибів відомі небезпечні паразити. Такі мучнеросние - збудники борошнистої роси багатьох рослин. Борошнистий наліт на уражених стеблах і листках утворюють конідії - спори, що виникають на кінцях гіф.
Паразит жита, рідше інших злаків, ріжки утворює в уражених колосках склероции ( "ріжки") - чорні щільні сплетіння гіф. Вони містять сильну отруту ерготін, що викликає різке скорочення гладких м'язів.
До сумчастих грибів належить і рід Penicillium. Його цвіль часто можна виявити на залежаний хлібі і овочах. Вона спочатку біла, потім набуває блакитний і зелений відтінок. У цю ж групу входять сморчки та рядки. Їх плодові тіла, з'являються ранньою весною, їстівні і смачні.
Базидіомікотові (лат. Basidiomycota), базидіоміцети, або базидіальних гриби - відділ царства грибів, що включає види, що виробляють суперечки в булавоподібних структурах, що іменуються базидии. Міцелій базидиомицетов септірованного, кожна клітина містить по два гаплоїдних ядра. Зазвичай ядра розташовані поруч посередині клітини, їх пара зветься дикаріон. Біля септи у гифов базидиомицетов формується пряжка, що бере участь при діленні клітини. Пряжка - тонкий виріст з однієї клітини гриба, що підходить, але не зливається з іншої сусідньої кліткою. При розподілі клітини ядра синхронно подвоюються і пряжка дозволяє виявитися в одній клітці ядер, сформованим з різних вихідних.
Дейтероміцети (лат. Deuteromycota), або Недосконалі гриби (лат. Fungi imperfecti) - нетаксономіческая група грибів, що раніше вважалася відділом. Їх тіло складається з розчленованих прозорих або забарвлених багатоклітинних гіф і іноді з нирки клітин. Розмножуються виключно безстатевим шляхом, при якому утворення конідій відбувається на ізольованих або розташованих групами конидиеносцах або спеціальних утвореннях, які називаються пікнідами.
До дейтероміцетів відносяться три порядки: Sphaeropsidales, Melanconiales і Hyphomycetales (Moniliales), представники яких широко поширені в грунті.
Glomeromycota - гломероміцети (Glomeromycota) - відділ грибів з єдиним класом Glomeromycetes. У класі описано близько 200 видів. Представники гломероміцети утворюють арбускулярную мікоризу з наземними рослинами, в тому числі з деякими мохоподібних.
Neocallimastigomycota - Неокаллімастіговие (лат. Neocallimastigales) - порядок анаеробних грибів, що відноситься до однотипної класу Neocallimastigomycetes монотипного відділу Neocallimastigomycota. Містить, в свою чергу, єдине сімейство - Neocallimastigaceae, з шістьма пологами. Ці грибки зустрічаються в основному в травній системі травоїдних ссавців. У неокаллімастігових немає мітохондрій, в замін цього вони використовують гідрогеносоми для окислення NADH в NAD +, і виділяють водень H2.
Ще один відділ, перенесений в царство грибів, раніше відносили до найпростіших (Protozoa):
Microspora - мікроспоридій (лат. Microsporidia) - відділ спороутворюючих одноклітинних паразитичних грибів. Раніше вважався типом царства простешйіх (Protozoa). Описано понад 1300 видів і близько 170 пологів. Представники є паразитами тварин. Більшість видів вражають комах, але вони також є збудниками звичайних захворювань у ракоподібних і риб. Зазвичай ці грибки вражають окремий вид або групу споріднених видів. Деякі види також є паразитами людини, вони відносяться до умовно-патогенних.
Дані групи об'єднують клітинна стінка з хітину, будова внутрішньоклітинних структур та інше.