Для роботи з мікроскопом необхідний хороший джерело світла. При природному освітленні рекомендується працювати у вікон, звернених на північ. Мікроскоп беруть за середню частину тубу-власника і ставлять на стіл, протирають м'якою серветкою окуляр і об'єктив, ставлять об'єктив на мале збільшення і за допомогою дзеркала направляють світло так, щоб він потрапив через отвір столика в тубус мікроскопа. Вивчається, повинен бути тонким, щоб світло проходило крізь нього, інакше в мікроскоп буде видно тільки контури препарату. В окуляр дивляться по черзі одним оком, потім іншим, так як очі швидко втомлюються. Спочатку препарат розглядають при малому збільшенні. Чи не дивлячись в окуляр, за допомогою макровінта до предметного скла наближають об'єктив приблизно на 0,5 см, потім дивляться в окуляр, піднімають тубус мікроскопа до появи зображення препарату і, злегка обертаючи мікрогвинт вправо і вліво, встановлюють тубус так, щоб вийшло виразне зображення. Якщо треба розглянути, матеріал при великому збільшенні, то, не дивлячись у окуляр, повільно піднімають тубус мікроскопа макровінтом. Легко повертаючи мікрогвинт отримують виразне зображення препарату. Інтенсивність освітлення регулюють за допомогою діафрагми або в кільце під конденсором вставляють матове скло.
При роботі з мікроскопом слід сидіти зручно, не нагинаючись близько до окуляра. Після кожної години роботи необхідно 10 хв відпочинку. При засміченні внутрішніх частин об'єктивів і окулярів мікроскопи здають для чищення в спеціальні майстерні. Під час роботи треба стежити за станом об'єктивів не допускаючи попадання рідини на лінзу об'єктива. Не можна торкатися пальцями до поверхні лінз, так як при цьому залишаються жирні сліди, що заважають чіткому зображенню. Після закінчення роботи піднімають тубус високо вгору і тільки після цього знімають препарат зі столика. Всі частини мікроскопа слід протерти сухою м'якою серветкою. При виконанні зазначених правил усувається небезпека зіпсувати об'єктив і розчавити скло. Зберігають мікроскоп в спеціальному ящику або під полкетіленовим футляром.
Крім біологічного мікроскопа є і інші мікроскопи: бінокулярний, люмінесцентний і електронний, які (за винятком бінокулярного) через складність конструкції в середніх навчальних закладах не застосовуються.
Для продовження скачування необхідно зібрати картинку: