Успіхи мікробіології були настільки очевидні, що друга половина 19 - початок 20 ст. увійшли в історію медицини як бактеріологічна ера, ера відкриття нового світу мікроорганізмів і розуміння їх ролі в патології людини. Захоплення бактериологией захопило широке коло практичних лікарів майже всіх спеціальностей.
Розвиток медицини в 20 в. ознаменувався не тільки вражаючими успіхами в лікуванні багатьох хвороб, але і початком масових заходів по їх профілактиці. В першу чергу вони були спрямовані проти інфекційних хвороб. Профілактичні щеплення, хіміопрофілактика та інші заходи попередження інфекцій і поєднанні з методами ранньої діагностики та ефективної антибактеріальної терапії, розробленими клінікою інфекційних хвороб, яка виділилася в 20 в. в самостійну клінічну дисципліну, сприяли тому, що в другій половині століття епідемічні та інші інфекційні хвороби перестали бути основною загрозою здоров'ю населення економічно розвинених країн.
Профілактичний напрям розвитку клінічної медицини 20 ст. не обмежилася областю інфекційних хвороб. Воно набуло особливого розмаху і стало визначальним у медицині СРСР і ряду інших країн, де набув широкого поширення метод диспансеризації населення. Розробка методів масової профілактики серцево-судинних, онкологічних та інших захворювань у другій половині 20 ст пов'язана з розвитком неінфекційної епідеміології як нового важливого розділу медичної науки.
Друга половина 19 ст. ознаменувалася розвитком нової галузі природознавства і медицини - бактеріології, або, як її стали називати пізніше, мікробіології. Наукові експериментальні основи цієї галузі знань були закладені класичними дослідженнями Л. Пастера, Р. Коха, І.І. Мечникова та ін.
До другої половини 19 ст. відноситься розвиток мікробіології і в Росії. Видатні російські вчені Л.С. Ценковського, І.І. Мечников, Г.Н. Габричевский, Н.Ф. Гамалія, Д.К. Заболотний, Л.А. Тарасевич та багато інших внесли великий вклад в розвиток мікробіології та епідеміології і увійшли в історію не тільки вітчизняної, а й світової науки.
Лев Семенович Ценковський. з відзнакою закінчив Петербурзький університет, в 22 роки захистив магістерську, а незабаром і докторську дисертацію «Про нижчих водоростях і інфузорій», відзначену Демидівської премії. В університеті Одеси він проявив неабиякі здібності педагога і організатора. Поряд з викладацькою діяльністю Ценковського розгорнув і наукові дослідження, вивчаючи морські форми найпростіших тварин. «Відкрив дуже важливе схожість між нижчими тваринами і нижчими рослинами Вчений був новатором в науці і працював в широкому діапазоні. Ще за три роки до виходу відомого праці Ч. Дарвіна «Походження видів» він довів, що між нижчими тваринами і рослинними організмами не існує різких граней. Л.С. Ценковського висунув ідею еволюції: переходу нижчих форм живих істот до вищих. У зв'язку з цим тоді писали, що професор Ценковського підійшов до мікробіології як натураліст з широким біологічним кругозором. Він вказав на близьку спорідненість бактерій з нижчими водоростями - на відміну від багатьох вчених, які шукали спорідненість бактерій з грибами.
Першу школу вітчизняних мікробіологів відкрив Л.С.Ценковскій, він описав понад 40 видів мікроорганізмів, виготовив вакцину проти сибірської виразки і розробив метод вакцинації.
Визначну роль зіграв І.І. Мечников, який створив велику школу мікробіологів та епідеміологів. Розвиток мікробіології та епідеміології в Україні відбувалося в різних напрямках. Для періоду, що послідував за відкриттями Л. Пастера і Р. Коха, характерні численні відкриття нових мікроорганізмів - збудників інфекційних хвороб: в 1875 р Ф.А. Леш відкрив збудника амебної дизентерії, А.В. Григор'єв в 1891 р - один з видів дизентерійної палички і ін.
Російським вченим належить ряд великих відкриттів, які послужили основою імунології, вірусології та інших розділів мікробіології, які в другій половині 20 ст. стали самостійними медико-біологічними науками.
Важливе значення для розвитку мікробіології та імунології мали і інші відкриття вітчизняних учених.
Гамалія М.Ф. (1859-1949), мікробіолог і епідеміолог, почесний член АН СРСР, академік АМН Відкрив бактеріолізини (1898), збудника холери птахів. Обгрунтував значення дезінфекції для ліквідації висипного і поворотного тифів. Праці з профілактики сказу, холери, віспи та ін. Інфекційних захворювань. Лауреат Державної премії СРСР (1943).
У 1898 р Н.Ф. Гамалія описав явище бактеріолізіса, що стало прообразом розвиненого згодом вчення про бактеріофаги. Він же описав бактерійні отрути - токсини. Н.Ф. Гамалія удосконалив метод щеплень проти сказу і метод приготування оспенной вакцини.
У 1894 р був відкритий холерний бактеріолізіс (Ісаєва - Пфейффера феномен). Ф.Я. Чистовіч відкрив (1899) явище преципітації, Г.П. Сахаров - явище сироваткової анафілаксії. В.К. Високович поклав початок вченню про ретикулоендотеліальної системі.
Найбільшим досягненням вітчизняної науки, які мають світове значення, є відкриття та вивчення Д.І. Ивановским фільтруються вірусів, що поклала початок нової галузі знань - вірусології.
Істотний внесок внесли вітчизняні лікарі в вивчення мікробіології та епідеміології окремих бактеріальних і паразитарних інфекцій і в розробку методів боротьби з ними. Велике місце у вітчизняній мікробіології займають роботи Г.Н. Мінха і Мочутковского, вивчаючи поворотний тиф, проводили досліди на собі, вливаючи собі кров хворого поворотним тифом для з'ясування епідеміології хвороби. В результаті численних експериментів прийшли до висновку, що поворотний і висипний тиф передаються комахами. Крім цього Мінх вивчав чуму і сибірську виразку.
Дослідження Д.К. Заболотного, М.М. Клодніцкого, І.А. Демінського лягли в основу теорії природу осередків чуми і зіграли найважливішу роль в науковому обґрунтуванні системи державних заходів по її ліквідації.
Габричевский Г.Н. - першим почав викладати бактеріологію. Розробив метод виготовлення протидифтерійної сироватки і метод щеплення проти дифтерії. Розробив вакцинацію проти скарлатину, відстоював думку про передачу малярії комаром. Створив бактеріологічний інститут.
Г.Н. Габричевский першим в Росії почав виготовлення протидифтерійної сироватки і спільно з Н.Ф. Філатовим в 1894 р успішно застосував її для лікування дифтерії. З іменами Г.Н. Габричевского і Л.А. Тарасовича пов'язана організація сироватково-вакціонного справи в Росії. Л.А. Тарасович був ініціатором і пропагандистом масового застосування вакцинації проти кишкових інфекцій в роки першої світової війни. П.Ф. Боровський відкрив і вивчив збудника пендинской виразки (1898). У 1879 р В.І. Афанасьєв (1849-1904) описав патолого-анатомічну картину коматозної малярії, висловив припущення про паразитарному походження малярійного пігменту. У 1884 р В.Я. Данилевський вперше описав збудника малярії птахів, а в 1889-1891 рр. Н.А. Сахаров - збудника тропічної малярії. Велику роль для практичного вивчення будови збудника малярії зіграв запропонований в 1891 р Д.Л. Романовським метод забарвлення крові і кровепаразітов.
Вітчизняні мікробіологів, епідеміологів і інфекціоністи вписали чимало героїчних сторінок в історію М. піддаючи своє життя небезпеці не тільки під час боротьби з епідеміями, а й в ході досліджень, постановкою експериментів на собі. Г.Н. Мінх і О.О. Мочутковского вводили собі кров хворих поворотним і висипний тиф. Д.К. Заболотний і І.Г. Савченко імунізували себе прийомом убитих культур холерного вібріона з подальшою перевіркою прийняттям живих культур. Г.Н. Габричевский зробив собі пробну щеплення приготовленої їм скарлатинозной вакцини, яку він потім широко застосовував у московських лікарнях. В.А. Хавкін вводив собі протихолерні і протичумну вакцини. Н.Ф. Гамалія перевіряв на собі безпеку щеплень проти сказу. В.В. Фавр піддавав себе зараженню за допомогою укусу малярійного комара. Багато чудових російських лікарів загинуло при виконанні свого лікарського обов'язку на посаді епідеміолога (І.А. Демшіжій, В.І. Турчинович-Вижнікевіч, М.Ф. Шрейбер і ін. - при експериментальних дослідженнях чуми). Героїзм, відвагу і самовідданість проявили вітчизняні лікарі, беручи участь в ряді експедицій по боротьбі з епідеміями за кордоном.