Експеримент по перетворенню собаки в людину, яка проводить всесвітньо відомий професор Преображенський, і вийшов, і немає. Вийшов, тому що професор Преображенський був найкращим хірургом в Європі і йому вдалося випередити свого часу. Чи не вийшов, так як результат цього експерименту не тільки перевершив усі сподівання професора, а й нажахав, налякав, змусив повернути все на круги своя. Відбулися ці події в розпал побудови в Росії нового суспільства і нової людини. Жив на світі симпатичний і кмітливий пес, що страждає від людської жорстокості: «Але ось тіло моє поламане і бите, поглумилися над ним люди досить ... Не били вас по заду чоботом? Били. Цеглою по ребрах отримували? Доволеньки досить ». Останньою краплею, що переповнила чашу страждань Шарика, стало те, що йому окропом обварили лівий бік: «Розпач повалило його. На душі у нього було до того боляче і гірко, до того самотньо і страшно, що дрібні собачі сльози, як пухирці, вилазили з очей і тут же засихали ».
Порятунок прийшов у вигляді професора Преображенського, який нагодував Шарика і привів його до себе додому. Бідний пес не розуміє, що відбувається в цій квартирі, але його ситно годують, і цього псу досить. Але ось приходить день, коли над Шариком ставлять страшний експеримент. Булгаков, описуючи операцію з пересадки гіпофіза людини собаці, ясно показує своє негативне ставлення до всього того, що відбувається: перш симпатичні і вселяють повагу професор Преображенський і доктор Борменталь різко змінюються: «Пот з Борменталя повз потоками, і обличчя його стало м'ясистим і різнобарвним. Очі його бігали від рук професора до тарілки на інструментальному столі. А Пилип Пилипович став позитивно страшний. Сипіння виривалося з його носа, зуби відкрилися до ясен ». Думаючи про досягнення науки, герої забувають про найголовніше - про людяність, про те, які муки припали на частку нещасного пса, про ті наслідки, до яких призведе цей експеримент. Гіпофіз, який пересадили Шарику, належав вбитому в бійці Клима Чугункіна, злодію-рецидивісту, засудженому на каторгу. Професор не врахував тих генів, які перейшли до Шарику, в результаті чого, як сказав Пилип Пилипович, наймиліший пес перетворився «в таку мразь, що волосся дибки стає». Шарик став Поліграфом Поліграфовичем Кульковим, його першими словами стали нецензурну лайку. Він переродився в неосвіченого, злобного, агресивного хама, який просто отруїв життя всіх оточуючих в будинку професора. Виховання, яке йому намагаються прищепити професор і доктор Борменталь, повністю знищується впливом Швондера, що вміє натиснути на найбільш ниці інстинкти Шарикова. Інтелігентність професора виявляється безсилою перед неприкритим хамством, нахабністю і жадібність получеловека-напівсобаки. Професор розуміє свою помилку: «Ось, доктор, що виходить, коли дослідник замість того, щоб йти паралельно і навпомацки з природою, форсує питання і піднімає завісу: на, отримуй Шарикова і їж його з кашею». Відкриття, яке скоїв Преображенський, на ділі виявляється зовсім не потрібним: «Поясніть мені, будь ласка, навіщо потрібно штучно фабрикувати Спіноза, коли будь-яка баба може його народити коли завгодно. Доктор, людство саме піклується про це і в еволюційному порядку щороку наполегливо, виділяючи з маси всякої мерзоти, створює десятками видатних геніїв, що прикрашають земну кулю ».
Коли Шариков перетворив життя професора в справжнє пекло, вчені роблять ще одну операцію: Шариков стає тим, ким був спочатку - симпатичним хитруватим псом. Тільки головні болі нагадували йому про тих метаморфози, які з ним відбувалися: «Так звезли мені, так звезли, - думав він, задремивая, - просто неймовірно звезли. Утвердився я в цій квартирі ... Правда, голову мою всю пошматували чогось, але це до весілля заживе ». Історія Шарика завершилася щасливо, але той величезний ризикований експеримент щодо перетворення величезної країни закінчився трагічно: Шарикови розплодилися в неймовірних кількостях, і ми до сих пір пожинаємо плоди цього експерименту. Не можна форсувати історію, не можна проводити експерименти над живими людьми, не можна не думати про ті наслідки, до яких призводить марнолюбне бажання перетворити людську природу і створити «ідеальної людини», «ідеальне суспільство», не змінюючи його душі, свідомості і моральності - ось той підсумок , до якого приходить читач, розмірковуючи про перетвореннях Шарика в повісті «Собаче серце».