У цитоплазмі клітин розташовані так звані енергетичні органели - мітохондрії. Мітохондрії видно в світловий мікроскоп. Форма мітохондрій різна, вони можуть бути овальними, паличкоподібними, ниткоподібними. Число мітохондрій в клітині залежить від функціональної активності клітини.
Внутрішня будівля мітохондрій вивчена за допомогою електронного мікроскопа. На електронних мікрофотографіях видно, що мітохондрії зовні обмежені зовнішньою мембраною, яка в основному має ту ж будову, що і плазматична мембрана. Під зовнішньої мембраною розташовується внутрішня мембрана, яка утворює численні складки - Крісті. Усередині мітохондрій знаходяться окислювальні ферменти, РНК, ДНК і рибосоми, що відрізняються від цитоплазматических. В її мембрани вбудовані специфічні ферменти, за допомогою яких в мітохондрії відбувається перетворення енергії харчових речовин в енергію АТФ, необхідну для життєдіяльності клітини і організму в цілому.
Пластида. Це органели, властиві тільки клітинам рослин. За своєю будовою пластиди схожі з мітохондріями, так як мають двухмембранной будова. Існують три види пластид: хлоропласти, хромопласти і лейкопласти.
Хлоропласт за формою нагадує диск або куля діаметром 4 - 6 мкм з подвійною оболонкою - зовнішньої і внутрішньої. Всередині хлоропласта є ДНК, рибосоми і особливі мембранні структури - -гранная, пов'язані між собою і з внутрішньою мембраною хлоропласта. У мембранах гран знаходиться хлорофіл. Завдяки хлорофілу в хлоропластах відбувається перетворення енергії сонячного світла в хімічну енергію АТФ. Енергія АТФ використовується в хлоропластах для синтезу вуглеводів з вуглекислого газу повітря.
Хромопласти. Пігменти червоного і жовтого кольору, що знаходяться в хромопласти, надають різним частинам рослин червону і жовту забарвлення. Корінь моркви, плоди томатів пофарбовані завдяки пігментів, що містяться в хромопласти. Поєднання хромопластов, що містять різні пігменти, створює велику різноманітність забарвлень квіток і плодів рослин.
Лейкопласти є місцем накопичення запасного живильного речовини - крохмалю. Особливо багато лейкопластов в клітинах бульб картоплі. На світлі лейкопласт можуть перетворюватися в хлоропласти (в результаті чого бульби картоплі зеленіють). Восени хлоропласти перетворюються в хромопласти і зелене листя і плоди жовтіють і червоніють.
Постійний рух клітини. Органоідидвіженія. Багато клітини одноклітинних і багатоклітинних організмів мають здатність до руху. Під цим розуміється і рух клітини в просторі, і внутрішньоклітинний рух її органоїдів. У рослин, тварин і грибів рух клітин необхідно для взаємодії між собою. У рідкому середовищі переміщення клітин здійснюється рухом джгутиків і війок.
Так пересуваються багато одноклітинні, наприклад евглена зелена, туфельки і ін. Деякі види бактерій також рухаються за допомогою джгутиків, довгих і гнучких, які швидко обертаються, забезпечуючи просування клітини. Амеби і деякі інші найпростіші організми, а також спеціалізовані клітини багатоклітинних (наприклад, лімфоцити) пересуваються за допомогою виростів, які виникають на поверхні клітин.
Клітка знаходиться в постійному русі. При фагоцитозі і піноцитозу відбувається впячивание плазматичноїмембрани всередину клітини, пересуваються лізосоми, бульбашки комплексу Гольджі, мітохондрії, нарешті, рухається сама цитоплазма.
Клітинне рух забезпечується структурами, званими мікротрубочками і мікрониток. Микротрубочки - це довгі порожнисті циліндри, стінки яких складаються з білків. З мікротрубочок складаються джгутики і війки всіх вивчених клітин. Микронити - дуже тонкі структури, які в основному з білка. В м'язових клітинах вони створюють структури, що забезпечують скоротливу функцію цих клітин.
У цитоплазмі клітин усіх організмів близько ядра розташовується клітинний центр, який бере участь в діленні клітини. До складу клітинного центру клітин тварин і нижчих рослин входить центриоль. Центриоль - парне освіту. Вона містить дві подовжені гранули, що складаються з мікротрубочок і розташовані перпендикулярно один до одного.
Клітинні включення. Нарешті, слід сказати про численні включених в цитоплазмі. Включеннями називають непостійні структури цитоплазми, які на відміну від органоїдів то виникають, то іс.чезают в процесі життєдіяльності клітини. Щільні у вигляді гранул включення містять запасні поживні речовини (крохмаль, білки, цукру, жири) або продукти життєдіяльності клітини, які з тієї чи іншої причини не можуть бути відразу видалені. Здатністю синтезувати і накопичувати запасні поживні речовини мають всі пластиди рослинних клітин.
У рослинних клітинах накопичення запасних поживних речовин відбувається і в вакуолях, які часто займають майже весь обсяг клітини, відсуваючи ядро і цитоплазму до плазматичної мембрани.