Хімія і хімічна технологія
Репрессор регулює активність трьох промоторів фага, з котори.х два, рям і Рр, розташовуються поруч. Транскрипція з промоторів Рк.ц і Рн йде в протилежних направ-домлення. Між стартовими точками цих промоторів розташовуються три ділянки зв'язування репрессора Ок. Ор. і Ор, (рис. 88). Ділянка Ор, перекривається з ділянкою зв'язування РНК-полімерази з промотором Ррм. тому зв'язування репрессора з Ой, заважає зв'язування РНК-полімерази з Рк.м н тим самим пригнічує транскрипцію. [C.145]
Серцевина містить, зокрема, багато десятків молекул вірус -специфічні ДНК-залежною РНК-полімерази. Цей великий багатокомпонентний фермент розпізнає промотори ранніх генів. Промотори сильно збагачені А-Т-парами і віддалені від стартової точки транскрипції приблизно на 30 п. Н, клітинні РНК-полімерази ці промотори не впізнають. Регуляторні елементи типу енхансером в геномі вірусу осповакціни не описані. [C.307]
Найбільш просте пояснення цих спостережень полягає в наступному. У разі одноцепочечной ДНК РНК-полімераза може використовувати для зв'язування і початку транскрипції будь-яку ділянку ланцюга. Однак вона практично не має спорідненості з більшої частини нативной подвійний спи-рали ДНК. Нечисленні ж стартові точки на подвійної спіралі ДНК, спорідненістю до яких має РНК-полімераза, являють собою. мабуть, специальн ті ділянки з особливою послідовністю пуринових і піримідинових основ. яка дозволяє полімеразі розкривати подвійну спіраль ь ДНК. Розкривши цю спіраль, РНК-полімераза може приєднатися до однієї з двох комплементарних ланцюгів і почати використовувати її в якості матриці для транскрипції. Ця особлива послідовність підстав стартової точки повинна бути такою, що послідовність у неправильній ланцюга в межах цієї точки буде повністю виключати можливість використання РНК-полімераза цієї неправильної ланцюга для початку синтезу РНК. [C.403]
Після того як на стартовій точці почалася транскрипція. РНК-полімераза продовжує просуватися [c.139]
Схожі результати можуть бути отримані в експериментах з використанням екзонуклеаза. Цей фермент діє на кінцевий ділянку ДНК і послідовно його деградує. Якщо з ДНК пов'язаний білок. то при зіткненні з ним дію нуклеази припиняється. В даному випадку також можна визначити межі промотора, т. Е. Точки, розташовані по обидва боки від нього, далі яких екзонуклеаза не може просунутися. Таким чином. ще раз підтвердилося, що послідовність, що пов'язується з РНК-полімерази, розташована приблизно на 44 п. н. лівіше стартової точки транскрипції. [C.143]
У сукупності ці результати показують, що РНК-полімераза зв'язується, причому асиметрично, з ділянкою ДНК розміром близько 44-50 п. Н. якщо рахувати від стартової точки проти ходу транскрипції, і близько 20п. н.-по ходу транскрипції. Останні 25-30 п. П. В сполучному ділянці, розташовані проти ходу транскрипції, менш міцно взаємодіють з ферментом. Ця область зв'язується з ферментом досить добре, щоб бути екранованої при м'якій обробці ендо- або екзонуклеаза, але не може витримувати більш жорсткі умови обробки, що використовуються для отримання цілих фрагментів пов'язаного ферментом ділянки. Наведені дані добре узгоджуються з моделлю, згідно з якою існує єдиний зв'язує сайт для РНК-полімерази, в якому (як ми побачимо) деякі точки контакту мають більш важливе значення. чим інші. [C.143]
Основний елемент промотора -. місце зв'язування РНК-полімерази, яке вона займає перед початком синтезу РНК До складу промоторів можуть входити також ділянки зв'язування білків -Регулятор. Розмір ділянки зв'язування РНК-па1і.мерази відповідає її довжині і становить приблизно 70 п. Н. Розташовується ця ділянка щодо стартової точки несиметрично по ходу транскрипції його межа відстоїть від стартової точки на 20 п. Н. а проти ходу - прі.мерно на 50 п. н. (Рнс. 85). [C.140]
Стартова точка транскрипції відстоїть у різних промоторів на 6-9 п. Н. від послідовності Прібнова (рис. 85). Початковим нуклеотидом РНК найчастіше є диктуються матрицею А чи Q. Перевага пуринів, однак, неабсолютно, і є кілька промоторів, на яких транскрипти починаються з С або U, незважаючи на наявність на відстані одного-двох нуклеотидів потенційного пуринового початку. У деяких промоторів стартова точка не строго фіксована ініціація відбувається з двох-трьох сусідніх нуклеотидів матриці. [C.141]
Оператор лактозного оперона розташовується відразу за стартовою точкою транскрипції. Довгий час вважалося, що приєднання лактозного репрессора до про.мотору стерически заважає приєднанню РНК-полімерази. Однак недавно отримані дані, що свідчать про те, що репрессор н РНК-полімерази можуть розташуватися на промоторі поруч один з одним. Тому доводиться ду.мать про більш витончених механізмах репресії. включають специфічні контакти репрессора з РНК-полімерази. У лактозна оперон є два псевдооператор, подібних за нуклеотидноїпослідовності з оператором, але що володіють [c.150]
Стартові точки транскрипції промоторів Рс і Рову про знаходяться на відстані 147 п. Н. Репресуючи Рс, білок агаси зв'язується оператором araOi, перекриваються з ділянкою зв'язування РНК-полімерази. Перебуваючи в стані активатора. Агаси-білок зв'язується з ділянкою ara. безпосередньо прилягає до ділянки зв'язування РНК-полі.мерази з промотором. Можна думати, що активація відбувається за рахунок контакту з РНК-полімерази. [C.152]
Синтез первинних транскриптів. Ініціація синтезу обох класів первинних транскриптів відбувається в сусідніх ділянках генома - в області, яка насичена регуляторними елементами транскрипції, а також включає ділянку оП реплікації ДНК (рис. 158). Обидва класи транскриптов не мають єдиної, строго фіксованою стартовою точки тому 5-кінців молекул мРНК всередині кожного класу не однакові по довжині (особливо сильно така мікрогетерогенність виражена у пізніх транскриптів). Проте можна сказати, що промотор ранніх мРНК має [c.300]
Всі ці регуляторні елементи дозволяють хазяйської РНК-полімерази II здійснити ефективну транскрипцію ранніх генів незабаром після попадання ДНК цього вірусу в клітинне ядро. В результаті процесингу ранніх транскриптів (див. С. 302) утворюються мРНК для ранніх білків, а потім і самі ці білки. Один з них - Т-антиген - грає центральну роль в подальшій розбудові транскрипції вірусного генома. Він викликає ряд ефектів. По-перше, взаємодіє з ділянками вірусної ДНК, що зв'язують Т-антиген (найсильніше з ділянкою і слабкіше за все з ділянкою] 11 см. Рис. 158). В результаті пригнічується транскрипція ранніх генів. в тому числі і гена, що кодує Т-антиген, Таким чином. Т-антиген проявляє тут властивості репрессора. синтез якого підпорядковується транскрипционной аутогенного регуляції. Втім, транскрипція ранніх генів на пізній стадії припиняється в повному обсязі. Вона триває, хоча і зі значно. меншою ефективністю, але при цьому стартова точка транскрипції помітно зміщується, так що ТАТА-елемент виявляється тепер всередині транскрибируемой послідовності (рис. 158). Механізм, що забезпечує пізню транскрипцію ранньої області з новою стартовою точки, не розшифрований. [C.301]
Промоторні елементи провируса розташовані в районі з таким чином. можливість транскрипції провируса виникає після появи району з попереду вірусного ДНК-генома, т. е. після виникнення LTR. Приблизно за 25 п. І. до стартової точки транскрипції (до л) є характерний ТАТА-елемент, за 75 п. і.- Саат -Елемент і за 100-300 п. н.- енхансер. У різних ретровірусів енхансер має різну силу. а у онкогенних ретровірусів сила енхансера може корелювати зі здатністю вірусу викликати злоякісну транс (юрмацію клітин-мішеней. Для активування енхансера необхідно його взаємодія з клітинними білками -Регулятор в деяких випадках, наприклад у мишачого вірусу раку молочних залоз. ефективність енхансера регулюється гормонами (за посередництвом білків - рецепторів гормонів). [c.314]
Регульовані термінатори бактерій називають аттенюаторами (ослабітель). Вперше виявлений і краще за інших вивчений атенюатор триптофанового оперона Е. сої. Цей оперон складається з п'яти генів, що кодують ферменти біосинтезу триптофану. Регуляцію здійснюють дві системи, які відчувають потребу клітини в триптофану. Перша система впливає на ефективність ініціації на промоторі оперона. Репрессор триптофанового оперона в комплексі з триптофаном приєднується до оператора, розташованому перед стартовою точкою транскрипції в районі -10. і стерически перешкоджає РНК-полімерази приєднуватися до промотор. Таким чином. при надлишку триптофану оперон репресований. За відсутності триптофану репрессор втрачає здатність зв'язуватися з оператором, в результаті чого оперон індукується. Цю систему доповнює регуляція в аттенюатор, расгГоложенном на відстані 180 п. Н. від стартової точки транскрипції всередині Дивитися сторінки де згадується термін Транскрипція стартова точка. [C.149] [c.152] [c.158] [c.301] [c.149] [c.152] [c.301] [c.308] [c.404] [c.491] [c.21] [c.140] [c.140] [c.141] [c.143] Гени (1987) - [c.139. c.140]