Найбільш популярний спосіб використання гармонайзера полягає в тому, що сигнал злегка засмучують відносно початкової висоти. Тим самим виходить ефект, схожий на "хорус".
Якщо гармонайзер має два виходи, на кожен з яких надходить окрема гармонія, то зазвичай роблять так: один із сигналів трохи підвищують (на 5-10 центів), другий знижують на таку ж величину. Потім сигнали панорамує вправо і вліво, "сухий" сигнал залишається в центрі. В результаті виходить хороший хор по всій стереобазу. Такий прийом часто наспіл для обробки вокалу, струнних та духових інструментів. Ефект "хорус", який виходить на виході гармонайзера, звучить набагато більш натурально, ніж сигнал з виходу модульованого DDL або пристрою "хорус", так як гармонайзер не вносить модуляції висоти звуку (хвилеподібного зміни). Сигнал з виходу гармонайзера завжди трохи вище або трохи нижче, ніж "сухий" сигнал, як це часто буває, коли два інструменти, які відіграють один і той же, трохи засмучені один щодо одного.
Про те, як створити штучний дабл-трек, вже було розказано в главі про лініях цифрової затримки. Можна зробити те ж саме за допомогою гармонайзера, застосувавши затримку змінених сигналів від 20 до 100 мс, причому для кожного сигналу повинна бути своя величина часу затримки. Перевага цього способу полягає в тому, що навіть дешевий гармонайзер впорається з цим завданням без проблем (расстройка занадто мала, щоб виникли побічні ефекти). Підвищення на кілька півтонів дозволить створити паралельні гармонії, але це мало використовується в музиці, крім тих випадків, коли ці інтервали - октави, кварти або квінти. Більш складні гармонії можуть бути створені за допомогою гармонайзера, керованого МИДИ-секвенсером або МИДИ-клавіатурою.
Нове покоління "розумних" гармонайзера з вбудованим пристроєм стеження за висотою вхідного сигналу можуть автоматично створювати правильні гармонії. Але вони можуть працювати тільки з моно-сигналом на вході. Якщо на вхід такого гармонайзера надходить сигнал зі складною формою обвідної, вони можуть не справлятися зі своїм завданням. Єдина перевага такого гармонайзера полягає в тому, що при роботі з ним не потрібно особливого музичної освіти. Потрібно тільки поставити тональність і тип гами. В іншому ж ефективність роботи обмежена гаммами, наявними в пам'яті, і тим фактом, що гармонізація все ж виходить не зовсім така, як це зробив би живий музикант.
Інтервали в октаву можуть бути змішані з вихідним сигналом, причому їх рівень повинен бути менше, - щоб додати басів в область низьких частот, або високих частот в верхній край діапазону. У випадку з вокалом рівень гармоній повинен бути дуже малий, інакше голос буде звучати штучно.
Додавання октави знизу - дуже популярний засіб для обробки електрогітари. Це звучить так, як якщо б бас-гітара грала рифи разом з лідер-гітарою. Додавання октави зверху дає ефект електронної 12-струнної гітари. Але рівень обробленого сигналу повинен бути набагато меншим рівня "сухого", інакше расстройка буде чутна. Тільки дуже складні гармонайзера не мають побічних ефектів, але вони дорого коштують.
Додавання паралельних квінт і кварт до партії духових інструментів звучить цікаво. Краще це робити з різкими звуками, а не з чистими, триваючими.
Область, де застосування гармонайзера повністю виправдало себе, - обробка ударних. Метод був винайдений Тоні Вісконті в роботі над альбомом Девіда Боуї "Let's Dance". За допомогою гармонайзера був створений глибокий звук малого барабана: в мікс додавалася гармонія, зрушена вниз відносно початкової висоти сигналу, після чого на слух підбиралася точна настройка (зрушення). Деякий час обробки (processing delay) гармонайзера надає щільність сигналу. Це можна застосовувати також для обробки бас-барабанів і томів.