Анімус переносить Дезмонда в 1754 рік у спогади англійської дворянина Хейтема Кенуея. Хейтем відправляється в Ковент-Гарден, щоб роздобути медальйон, за допомогою якого він і його соратники зможуть дізнатися про «Ті, хто були до». Пробравшись по балконах і за лаштунками, Хейтем добирається до своєї жертви Міко. Забравши медальйон і убивши його прихованим клинком, він залишає оперу. Пізніше, на зборах лідерів ордена Хейтем доручають відправитися в Америку і знайти Храм. Також йому дається список з п'яти імен, яких він повинен буде завербувати.
Добравшись до Америки, попутно запобігши бунт на кораблі і «скинувши хвіст», Хейтем прибуває в Бостон. Спершу він повинен знайти п'ять чоловік, які можуть йому допомогти: Чарльз Лі, Вільям Джонсон, Томас Хики, Бенджамін Черч і Джон Піткерн. Розшукавши цих людей, вони вбивають работорговця по імені Сайлас Тетчер і звільняють групи американських індіанців-рабів, що належать племені могавков. Одна з цих могавков, Гадзідзіо (або Дзіо), погоджується допомогти Хейтем за умови, що він уб'є генерала Едварда «Бульдога» Бреддока. Після відстеження його руху, Хейтем вбиває Бреддока, коли він відступає в Форт Дюкен. Хейтем і Гадзідзіо відправляються в Великий Храм, проте Хейтем розчаровується тим, що медальйон не відчиняє дверей. У цей момент, пара розкриває свої романтичні наміри по відношенню один до одного, і незабаром після цього, Чарльз Лі і Хейтем повертаються в Бостон, де Кенуей присвячує Лі в тамплієри.
1760 рік. Розповідь перемикається на Радунхагейду - сина Хейтема. Після гри в хованки з його друзями в лісі недалеко від його села, Радунхагейду зустрічає армію колоністів на чолі з Чарльзом Лі. Чи б'є хлопчика і повідомляє про свої наміри «поговорити» зі старійшиною, після чого хлопчика приголомшують і він втрачає свідомість. Прокинувшись, герой виявляє, що його село спалена, а мати гине у нього на очах в пожежі.
Дев'ять років по тому, вже підліток Радунхагейду дізнається від Матері Роду, що він не може залишати прилеглі долини, щоб захистити Великий Храм, і та показує йому скляне Яблуко, яке активізується від його дотику і дозволяє йому спілкуватися з Юноной. Юнона повідомляє йому, що він і його плем'я є хранителями Великого Храму, і те, що якщо він піде, його село буде знищена і його люди будуть вбиті. Після Юнона просить індіанця знайти ассасина Ахіллеса Девенпорта, щоб він навчив юнака.
Герой знаходить старого ассасина, але той велить йому забиратися. Нарешті, коли герой допомагає йому відбитися від бандитів, Ахіллес погоджується стати його наставником. Після, Радунхагейду разом з Ахіллесом відправляються в Бостон, щоб знайти необхідні ресурси для лагодження особняка. У Бостоні, Ахіллес дає герою нове ім'я для місцевих жителів - Коннор. Тут же Коннор вступає в контакт з Семюелом Адамсом. В особняку Ахіллес розповідає Коннору про тамплієрів і тому, що всі вони повинні померти, навіть його батько - великий магістр Ордена Тамплієрів.
Після повернення в маєток, Ахіллес показує Коннору «Аквіли», корабель, який він може використовувати для патрулювання Східного американського узбережжя. Так Коннор отримує звання ассасина і приховані клинки. Після герой вирішує вбити всіх змовників. Спочатку Коннор знищує чай в бостонському порту, щоб послабити сили Тамплієрів. Вільяма Джонсона герой вбиває першим, так як він хотів придбати землю, на якій живе народ Коннора, потім Джонатана Піткерна в битві при Банкер-Хіллі. У Нью-Йорку знаходить Томаса Хики і дізнається, що він готується до замаху на Джорджа Вашингтона.
Коннор вистежує Хики, однак, після короткої бійки обох кидають до в'язниці. Однак, Хики не затримали надовго, так як він звільнився за допомогою Хейтема і Лі. Коннора звинувачують в змові з метою вбивства Вашингтона, і він засуджений до повішення, але Ахіллес з учнями рятують Коннора, і герой вбиває Хікі. Побоюючись, що Тамплієри як і раніше хочуть вбити Вашингтона, Коннор зустрічається з ним, який повідомляє йому, що були якісь сліди у старій церкві. Коннор приходить до церкви, але там зустрічає батька, який спочатку хотів убити сина, проте домовляється з Коннором разом знайти і вбити зрадника Бенджаміна Черча. Після подорожі на Кариби, Хейтем і Коннор знаходять його, і герой вбиває тамплієра.
Розповідаючи Вашингтону останні новини, Хейтем виявляє лист, в якому Вашингтон наказав знищення всіх корінних племен. У листі, одне з племен належить Коннору. Після прибуття на допомогу, Коннор дізнається що Лі «підмовив» могавков зупинити наступ. Коннор нейтралізує одноплемінників, щоб уникнути конфлікту, проте йому довелося вбити свого близького друга дитинства, Ганадогона, якого підмовив Лі.
Після цього Коннор стає ще більш стрімким, розмірковуючи, що необхідно вбити і Лі, і Хейтема. Коннор придумує план, згідно з яким американці атакують Нью-Йорк і форт з Лі і тоді він зможе проникнути в форт. План спрацьовує, і герой входить в форт, але виявляє Хейтема, який зберіг Лі. Коннор вступає в сутичку з Хейтемом і вбиває його.
В даний момент, час від часу, Шон знаходить джерела енергії, необхідні Храму, щоб відкрити прохід. Спочатку Дезмонд відправляється на вежу в Нью-Йорку, а потім на стадіон в Бразилії. І там і там, його переслідує Деніел Крос - вбивця Абстерго і один з «кротів». Під час огляду Храму, Юнона розповідає Дезмонд про події, які привели до першої катастрофи. Під час однієї з таких лекцій Дезмонд розповідає, що Люсі померла від його руки, що Яблуко відкрило йому, що вона була подвійним агентом і мала намір принести Яблуко в Абстерго.
У минулому Коннор переслідує Лі. Після підслуховування на кораблі про зустріч, Коннор знаходить Лі в Бостоні і вступає в погоню за палаючого корабля. Нарешті, Коннор і Лі падають через вибух вниз, Коннор отримує поранення, і Чарльз запитує Коннора, чому він продовжує стояти на своєму, адже тамплієрів не що знищити, і його батько тому приклад. Коннор відповідає: «Тому що більше нікому», і стріляє Лі в груди. Тяжко поранений Лі збігає під Фронтір.
Коннор знаходить Лі в барі, і, випивши ковток з пляшки, пронизує своїм ножем груди Лі. Герой бере медальйон Хейтема з тіла Лі і повертається до свого племені в село, але нікого там не знаходить. Потім він знаходить кришталеве Яблуко, і в баченні Юнона доручає йому заховати медальйон, де ніхто не буде його шукати. Після чого Яблуко руйнується. Герой ховає медальйон в могилі Коннора Девенпорта, сина Ахіллеса (в честь нього Ахіллес і дав ім'я Радунхагейду).
З отриманою інформацією, Дезмонд знаходить медальйон і відкриває ворота. Там героїв зустрічає Юнона, яка хоче щоб Дезмонд віддав своє життя для порятунку світу. Однак, що з'явилася Мінерва показує, що, роблячи так, він мимоволі випустить Юнону, що дозволить їй почати завоювання світу. Вона пояснює, що Юнона була вирішена давно, під час війни між Першою Цивілізацією і людством, коли вона була частиною змови.
Мінерва показує Дезмонд, що буде якщо він не «врятує» світ. Вважаючи, що світ буде стояти, якщо в цьому допоможе Юнона, Дезмонд наказує іншим залишити його. Після того, як вони йдуть, Дезмонд активує п'єдестал, який приймає його життя для порятунку світу. Світ врятований. В кінці з'являється Юнона і звертаючись до лежачого Дезмонд, каже що він отримав своє, і тепер настав час їй отримати своє, після чого йде.
У фінальних титрах звучить місцями обриваються голос ведучого новин, який говорить, що найгірше позаду, але збиток нанесений людству ще не оцінено.
В епілозі Ахіллес вмирає, і Коннор ховає його поруч з його сином і дружиною. У підвалі він спалює портрети вбитих ним тамплієрів, потім дізнається, що його народ пішов на захід, так як земля, на якій стоїть село, була "кому-то продана". У Нью-Йорку Коннор стає свідком відходу британських військ, а також бачить як в порту на аукціоні продають рабів і розуміє, що його боротьба за свободу і справедливість ще не закінчена.
Персонажі в сучасності
Персонажі в минулому
Гра зроблена на новій версії движка Anvil Engine. Буде можливість володіти двома речами і виконувати ланцюг вбивств. Рухи ударів будуть повністю змінені, через що Коннор буде схожий на «хижака». У Коннора буде велика різноманітність зброї, включаючи томагавк, пістолет з ударно-кремнієвим замком, лук і стріли, роупдарт (дротик на мотузці, що дозволяє підвішувати ворогів) і, звичайно ж, прихований клинок, який може обернутися і перетворитися в кинджал.
Гравець зможе забиратися на дерева та інші природні елементи на додаток до звичайних міських структур. Будуть загадки, подібні Істині, але вони будуть не від Об'єкту 16. Будуть присутні контекстно-залежні дії, такі як використання ворогів як живі щити. Прибрали систему захоплення на противника. Її замінили на автоматизований вибір ворогів, що змінює бойову динаміку.
Дезмонд знову буде переживати «значні події», але вже на анімусом 3.0. У завданнях будуть контрольні точки, що дозволить не проходити заново все завдання, щоб отримати 100% синхронізації. Карта світу буде включати Бостон, Нью-Йорк і велику сільську місцевість. У сільській місцевості буде проходити приблизно 30% гри і вона буде місцем розташування багатьох подій в грі. Сільська місцевість за площею буде приблизно в 1.5 разів більше, ніж Рим в Братстві крові.
Також буде присутній і кооперативний режим, званий "Вовча зграя". За словами Ubisoft Annecy, для багато режиму був придуманий сюжет.
додатковий контент
Додатковий контент (DLC)
Для Assassin's Creed III вийшло 3 DLC, які додають нових персонажів і локації для Мультіплеер, а також сюжетна компанія. прихований секрет
Доповнення не несе чогось нового, а лише дає доступ для скачування контенту, доступного за попереднім замовленням. У нього входить:
Загартовані в бою
- Карта "Розкішний тропічний Сен-П'єр"
- Карта "Фортеця Сен-Матьє"
- Карта "Охоплений вогнем округ Бостона Чарльзтаун"