Нарівні з раніше розглянутими ролями різних Ордос, у Інквізиції є й інше важливе зобов'язання, а саме - організація роботи Чорних кораблів. Ці судна, укомплектовані і керовані за сприяння Адептус Астра Телепатіка. перевозять псайкеров з усього Імперіума на Терру. Імперські світи здають псайкеров як частину своєї десятини. і, безумовно, це один з найважливіших пунктів імперського закону. Чорні Кораблі не можуть ефективно функціонувати без уміння інквізиторів дізнаватися правду про популяцію псайкеров на планеті і без того жаху, який вселяє інквізиторського друк. Деякі з перевезених на Терру псайкеров досить сильні, щоб пройти навчання і стати імперськими псайкеров або астропатов. Решту ж більше ніхто і ніколи не побачить, і те, що з ними стане - таємниця, відома лише кільком лордам-інквізиторам і старшим адептам Телепатікі.
Команди Чорних кораблів формуються з членів Телепатікі і Інквізиції. Адепти Телепатікі перевіряють перевезених псайкеров, відбирають тих, хто досить сильний, щоб захистити себе від одержимості тварюками варпа і почати своє навчання. Завдання Інквізиції - ретельно перевіряти збирається з кожного світу десятину і гарантувати відсутність недостачі псайкеров, стежити за перевозяться псайкеров в тих випадках, коли вони становлять загрозу і (хоча це і не офіційна завдання) відправляти кращих псайкеров на навчання, щоб використовувати їх на благо Інквізиції. І справді, багато аколіти починають свою кар'єру в якості вимушених пасажирів Чорних Кораблів, де вперше розкриваються їхні таланти.
Чорні кораблі - це темні місця відчаю, просто космоплавающіе в'язниці суворого режиму. Багато псайкери, що нудяться в їх трюмах, в повній мірі усвідомлюють похмуру долю, призначену їм після закінчення поїздки.
Чорний корабель Інквізиції