Потім Вінсент Уорд значився режисером фільму, але через кілька місяців він був звільнений з-за творчих розбіжностей з продюсерами. У сценарії Вінсента Уорда, який отримав зелене світло, дія відбувалася на планетоїді «Арсеон». На цьому планетоїді розташовувався гігантський дерев'яний монастир, побудований Компанією і оточений безмежним морем. У монастирі проживало 350 ченців, які вірили, що вони живуть в пост-апокаліпсичному середньовіччя. Ченці не визнавали ніяких сучасних технологій, і уклад їхнього життя нічим не відрізнявся від середньовіччя. Коли шатл Ріплі приземлився на планетоїді, монахи звинуватили її в тому, що саме вона винна у вторгненні чужих на їх землю. Ріплі була вагітна чужим, так би мовити, традиційним способом. Тому вона була вагітна гібридом чужого-людини. Уорд покинув проект, після того як продюсери наполягли на тому, щоб він замінив ченців ув'язненими і відмовився від ідеї використання дерев'яного монастиря.
Також на пост режисера розглядався сценарист фільму, Уолтер Хілл, але він відмовився від цієї посади, коли Девід Фінчер отримав пропозицію поставити фільм.
За межами знімального майданчика Сігурні Уівер довелося носити перуку, тому що її дворічної доньки вже дуже не подобалася лиса мама.
Для того щоб створити труп Ребекки (Ньют), творці фільму використовували ляльку Керрі Хенн, зроблену в натуральну величину спеціально для зйомок «Чужих» (1986).
У складі ювілейної колекції Alien Quadrilogy вийшло спеціальне видання третьеого фільму +30 хв. Ось деякі додані сцени:
- після того, як Чужий вбиває Клеменса і Ріплі тікає з лікарні, йде великий план обличчя Голика, який захоплюється Чужим і повторює: Чудовий!
- коли намагаються випалити Чужого з тунелів, один з ув'язнених отримує важку рану. Ріплі намагається допомогти йому. Діллон посилає Джуніора розгорнути розбризкувачі. Джуніор направляється до розбризкувачі, але його зупиняє окрик попередження. Повернувшись, він бачить Чужого. Діллон і Ріплі пробують відволікти монстра. Джуніор, жертвуючи собою, біжить до складу токсичних відходів, захоплюючи у себе Чужого. Діллон замикає двері і читає молитву.
- в лікарні Голик благає Морса, щоб той розв'язав його, в той час як Морс голить свою голову. Морс неохоче розв'язує його. Голик запитує його, де тримають спійманого Чужого. Голик б'є Морса по голові і збігає. Потім слід сцена, де 85 і Ріплі посилають повідомлення компанії про затримання стороннього організму. Ріплі, перевіряючи наміри компанії, просить дозволу знищити Чужого. Компанія відмовляє, підтверджуючи підозри Ріплі.
- божевільний Голик добирається до складу токсичних відходів. Він каже укладеним, охороняє двері, що він повинен поговорити з істотою. Ув'язнений проганяє його, тоді Голик перерізає йому горло і відкриває двері, повідомляючи Чужому, що він буде служити йому. Чужий вбиває Голика.
- Ріплі повідомляє Діллону про плани компанії зберегти Чужого живим, але Діллон каже, що це його не турбує. Ріплі наполегливо доводить, що помруть невинні люди, а Діллон відповідає їй, що світ зовні для них не існує.
