У випадках встановлення в акваріумі інфекційних та інвазійних захворювань для їх знищення необхідно проводити дезінфекцію акваріумів, рибоводно інвентарю, що є розповсюджувачами захворювання.
Дезінфекція необхідна, так як збудники хвороб довгий час можуть зберігатися у воді, ґрунті, на водної рослинності. Високі температури (80-100 С) вбивають їх.
Виняток становлять деякі війчасті інфузорії і жгутіконосци (тріходіни, іхтіофтіріуси, оодініуми, кістки), а також моногенетіческіе сосальщики (гіродактілуси, Дактилогирус). Для знищення названих паразитів досить залишити акваріум на 6 7 днів без риб при температурі води 24-26 ° С. Найпростіші і моногенних, не знайшовши основного господаря, гинуть.
Дезінфекцію акваріумів проводять 0,1% -ним розчином перманганату калію (1 г на 1 л води); 5% -ми водними розчинами соляної або сірчаної кислоти, 3% -ним розчином хлораміну.
Акваріум на 12 годин залишають заповненим по самі вінця одним з дезінфікуючих розчинів, після чого кілька разів промивають.
При микобактериозом риб акваріуми і рибоводний інвентар не обробляють розчинами кислот, так як грибок стійкий до них.
Кращим засобом дезінфекції рибоводно інвентарю є обробка його крутим окропом або кип'ятіння протягом 10-15 хвилин.
Термометри знезаражують, повністю занурюючи їх в дезінфікуючі розчини.
Грунт дезінфікують кип'ятінням або прожарювання протягом 30-40 хвилин.
Сачки, які використовуються в карантинному акваріумі, необхідно тримати в посуді з 3% -ним розчином хлораміну. Перед кожним використанням сачок промивають водопровідною водою. Раз в тиждень розчин хлораміну замінюють свіжим.
Неповноцінна дезінфекція акваріумів та рибоводно інвентарю може спровокувати виникнення хвороби.