На сьогоднішній день екологія Чорного моря знаходиться в кризовому стані. Вплив негативних природних і антропогенних чинників неминуче веде до зміни екосистеми. В основному акваторію спіткали ті ж проблеми, що і інші моря.
Розглянемо їх детальніше. Одна з актуальних проблем Чорного моря - це цвітіння води, надлишок водоростей, тобто евтрофікація. Рослини використовують більшу частину кисню, розчинного в воді. Тваринам і рибам його не вистачає, отже вони гинуть. На знімках із супутників можна побачити, як відрізняється колір води Чорного моря від інших.

Чорне море забруднюється промисловими і побутовими відходами. Це і сміття, і хімічні елементи, і важкі метали, і рідкі речовини. Все це погіршує стан води. Різні предмети, які плавають у воді, сприймаються мешканцями моря як їжа. Вони вмирають, поглинаючи їх.
Не меншою проблемою вважається поява у воді Чорного моря чужорідних видів. Найбільш стійкі з них приживаються в акваторії, розмножуються, знищують місцеві види планктону і змінюють екологію моря. Чужорідні види та інші фактори в свою чергу призводять до зменшення біологічного різноманіття екосистеми.

Щоб зберегти екосистему і поліпшити екологію моря, потрібна ефективна діяльність усіх країн, розташованих на чорноморському узбережжі. На законодавчому рівні було підписано Конвенцію про захист Чорного моря від забруднень. Також створені органи координації природоохоронних програм акваторії.
