Беруть початок у Древа Гармонії. Колись давно один маг йшов лісом і вирішив відпочити в знайденої печері. Освітивши її, подорожній побачив, що склепіння і стіни печери поцятковані великими, красивими дорогоцінними каменями. Щоб йому було не страшно ночувати, маг зарядив кожен камінь світлом, чому печера стала неймовірно красивою.
Незабаром мандрівник не встояв, щоб знову повернутися до печери. Вона йому так сподобалася, що він вирішив посадити там дерево (ну ось захотілося). Близько лісу подорожній знайшов село, де оселився і знайшов роботу. Час від часу, він навідувався до свого деревця, поливав його, підсипав родючої землі і заряджав кристали, щоб воно отримувало від них світло.
Коли подорожнього не стало, дерево знайшла одна група нерозлучних друзів. Це були маги, і вони були повстанцями, які ховалися від тиранії влади. Вони порахували аномальне дерево чудом, і воно підштовхнуло їх на створення універсальної зброї, яке приносило б лише одну гармонію і дружбу. Для цього вони знайшли в печері шість кристалів, п'ять з яких вплели в галузі дерева, а шостий, - в його стовбур. День за днем шість магів приходили в печеру і заряджали кожен свій кристал. Перший передавав кристалу ефект, який він відчував при радості, другий передавав ефект, який він відчував, коли говорив гірку правду, третій - коли відчував почуття безкорисливої щедрості, четвертий - коли відчував вірність до товаришів, п'ятий - коли відчував співчуття і розуміння. Лише шостий елемент, в стовбурі дерева, заряджався чистої магією. Вірилося, що він з'єднає силу всіх п'яти елементів гармонії і віддасть її землі, щоб на ній запанував мир і порядок.
Через деякий час війна і справді утихомирилася і запанувала гармонія. Після цього дерево було буквально обожнений. Маги одягнули його в кристалів вбрання, на яке нанесли красиві візерунки, а шостий елемент був прихований від очей, щоб ніхто не позбавив древо основного джерела магії. Сила шістки магів все міцніла, і вони продовжували заряджати Елементи Гармонії.
Якось шостий маг припустив, що може повернути всім віддану дереву магію. Товариші спочатку відмовилися, але незабаром все прийшли до висновку, що така потужна сила дозволить їм захистити свої землі майже від будь-якої загрози. Тоді був створений скриню з шістьма замковими щілинами, зачарований і поміщений в корінь дерева. Варто було лише натиснути на шостий, секретний, елемент, як механізми діставали скриню контролю з надр древа гармонії (заховати можна було також). Вони вважали, що лише вони одні зуміють його відкрити. Для цього потрібно нанести на межі скрині той магічний ефект, який вони застосовували для своїх кристалів. В результаті Скриня сам створював ключ з найближчих атомів. Кожен ключ має бути повернений тільки його володарем і тільки тоді скриню відкриється. Ланцюгом проводять кристалів буде спустошений кристал магії, а той виб'є енергію з п'яти інших. Вся міць буде розподілена між шістьма, кожен вбере силу свого елемента і зможе її контролювати.
Відомо, що сестри були з королівської сім'ї і знали про Елементах Гармонії, що їх силу можна звільнити, але як - питання. Коли прийшов ДІСКОРДІЯ, вони просто витягли каміння з дерева. Витягненими елементами може управляти, як виявилося, лише один маг, і тільки коли на елементи Сміху, Щедрості, відданості, Доброти і Чесності будуть накладені відповідні ефекти. Тоді п'ять звільнилися міні - потоків відкриють доступ до Магії, яка відкриє повністю потоки п'яти кристалів і передасть їх силу господареві шостого елемента.
Ймовірно, Селеста пізнала всю «Магію Дружби» і змогла сама передати елементам їх ефекти, а Твайлайт не змогла. Тому їй і потрібні друзі, адже їх тіла випромінюють потрібний ефект. І це чимала везіння - знайти саме п'ять таких поні. Хоча відомо, що саме їм, і нікому більше, Селеста веліла підготувати свято, а потім сказала подружитися з Твайлайт, коли вона прийде їх перевіряти. Стусани Пай начебто навіть переїхала в Понівіль незадовго до свята, адже вона знімала кімнату, а працювати влаштувалася вже після першої серії.
Ймовірно, що заряджені кристали можна розколювати і з'єднувати, не впливаючи на магію, якою вони володіють. Ось можливий список мінералів, які використані в елементах гармонії:
Магія - рожевий рубін (в пролозі - аметист)
Щедрість - аметист (в пролозі - смарагд)
Доброта - рожевий сапфір
Місто в хмарах (Cloudsdale)
Спочатку були придумані спеціальні хмари. Єдиноріг стискали звичайні дощові хмари своєю магією, щоб пегаси легко змогли відбуксирувати їх на місце поливу, де земні поні вирощували продовольство. Однак заклинання було досить складним, тому було вирішено побудувати фабрику з виробництва хмар. В її основу лягли всі ті ж заряджені кристали, які поглинали в величезну трубу потоки влагосодержащих повітря. Зі зворотного боку перебувала ємність, де розміщувалися кристали для «скручування» цього повітря в невелику хмару. Коли хмара досягало певної щільності, керуючий відкривав заслінку, випускаючи її назовні. Але виникла одна проблема - природні хмари не опускалися до рівня фабрики, і Пегас доводилося гнати їх вниз, що дуже незручно. «От би наша фабрика парила в небі» - говорили пегаси. «А чому б і ні» - раптом відповіли їм єдинороги. Вони змайстрували спеціальний каркас, на який була поміщена нова, полегшена фабрика. Каркас левітацією піднімався в повітря, а до його днища прикріплювали спеціальні заряджені вусики (ймовірно з мармуру). Вони були розташовані в спеціальному порядку і штовхали конструкцію в повітря від землі. Вусики були приєднані до кількох змінним кристалів, які підживлювали їх енергією. Коли вітер відхиляв один вус, то протилежний збільшував свою магічну інтенсивність, не даючи будівлі істотно переміщатися.
Пегаси полюбили це місце, адже там накопичувалось багато хмар, де можна було відпочивати і гратися. На прохання трудящих в небо був відправлений невелике промислове містечко, де жили працівники фабрики і їх сім'ї. Невеликий магазинчик, школа, майданчик для ігор - і все серед ніжних, пухнастих хмар. Кожен пегас мріяв про такий будинок, тому всі нові і нові платформи піднімалися вгору. Незабаром утворився місто, який пегаси по праву вважали своїм будинком і гордо його захищали.