Хламідії представляють велику групу облігатних внутрішньоклітинних паразитів, дуже близьких до грамнегативних бактерій. Їх можна розглядати як грамнегативнібактерії, які втратили здатність синтезувати АТФ, гуанозинтрифосфат (ГТФ) і ряд інших ферментних систем, іншими словами втратили здатність вироблення метаболічної енергії. Цей дефект обумовлює їх внутрішньоклітинний зростання, завдяки якому вони мають доступ до багатих енергією проміжних продуктів метаболізму клітин хазяїна. У сімействі Chlamydiaceae виділено два роду - Chlamydia і Chlamydophila, причому вони відрізняються і по фенотипическим ознаками.
Рід Chlamydia включає три види: Chlamydia trachomatis, Chlamydia muridarum і Chlamydia suis. Chlamydia trachomatis - виключно паразит людини, викликає трахому, урогенітальні захворювання, деякі форми артриту, кон'юнктивіт і пневмонію новонароджених. C. trachomatis має два биовара: trachoma (14 сероварів) і LGV (4 серовара). Інші види Chlamydia захворювань у людини не викликають.
Рід Chlamydophila складають шість видів: C. psittaci, C. pneumoniae, C. pecorum, C. abortus, C. caviae і C. felis.
Chlamydophila pecorum - виключно збудник захворювань тварин. Кілька штамів C. pecorum виділено у сумчастих (коала), жуйних ссавців і свиней.
Chlamydophila pneumoniae - збудник респіраторних інфекцій. Цей вид має три биовара: TWAR (Taiwan acute respiratory), Koala і Equine, їх назви пов'язані з джерелом виділення штамів. Штами TWAR в основному стають збудниками захворювань респіраторного тракту у людини, викликаючи переважно гострі і хронічні бронхіти і пневмонії.
Chlamydophila psittaci включає штами, для яких основними господарями бувають птиці. Всі ці штами можуть передаватися людині, викликаючи пситтакоз. C. psittaci включає вісім сероварів, багато хто з них можуть паразитувати у кількох видів птахів.
Chlamydophila abortus названа по основному станом, що викликається цим збудником. Цей вид поширений серед жуйних тварин і в основному колонізує плаценту. Спорадичні аборти, викликані C. abortus, зареєстровані у жінок, які працювали з вівцями, вони отримали назву «гестаційний пситтакоз».
Chlamydophila felis викликає риніти і кон'юнктивіти у домашніх кішок (Felis catus). Відзначено зоонозних інфекцій, спричинених C. felis, у людей, що проявлялися у вигляді кон'юнктивіту.
Chlamydophila caviae вперше виділена з кон'юнктиви морської свинки (Cavia cobaya) і згодом описана у декількох тварин даного виду.