Як успадковуються морфологічні ознаки - саме це питання найчастіше цікавить заводчиків. Адже саме морфологічні особливості, а не забарвлення і не аномальне будова вовни або вушної раковини визначають Характеристику більшості порід. Але. саме для цих особливостей і не можуть бути застосовані закони Менделя. У генетичному сенсі морфологічні характеристики порід є стабільні генні комплекси, сформовані протягом багатьох років шляхом відбору і закріплення вдалих комбінацій. Кожен з таких умовних "ознак" породи - будь то прямий профіль Орієнтал або "стоп" перса - контролюється величезною кількістю взаємодіючих генів. Добре, коли взаємозв'язок просто аддитивна, як для деяких кількісних ознак, наприклад, довжини хвоста або величини вух. Однак частіше взаємний вплив генів в комплексних системах куди складніше відмінності в активності самих генів, властиві їм регуляторні елементи, а також поки невідомі, але, безсумнівно, існуючі зчеплення генів створюють складну картину спадкування, не ту дають швидкий розшифровці.
Особливо наочно представлена роль регуляторних елементі генних комплексів у тих порід, чий вигляд разюче відрізняється від природного. Якщо розглядати з цієї точки зору перську породу, можна відзначити явні риси інфантилізму у дорослих тварин: опуклий звід черепа, укорочена лицьова частина, велика по відношенню до тіла голова, великі очі. Не можна не звернути увагу і на таку фізіологічну особливість, як пізніше заростання тім'яних швів. Створюється враження, що в процес формування породи заводчиками підбиралися комбінації регуляторних елементів, що забезпечують ранню зупинку дії роботи одних генів і збільшення терміну роботи інших, які в нормі, природному середовищі існування кішок, припиняли свою активність на ранніх стадіях розвитку. Зворотні комплекси регуляції сформувалися у сиамо-орієнтальної групи порід. Так, подовження мордочки, тобто зростання лицьового скелета, у орієнталів триває до 2-х років, тоді як у більшості безпородних кішок - тільки до року.
Існує тільки одна загальна для всіх порід тенденція в спадкуванні морфологічних ознак - переважання "дикого типу" над усіма відхиленнями від нього. Це означає, що при схрещуванні двох різнопородних кішок у нащадків будуть домінувати ті риси, які характерні для дикого предка домашніх кішок: широкий лоб і вилиці, загострена морда, профіль з ледь позначеним переходом від чола до носа, округлі косо поставлені очей високо стоять і широко розставлені вуха. Саме таким виявляється вигляд нащадків, наприклад, від схрещування перської кішки Орієнталії. Найбільше вони нагадують європейську кішку найбільш близьку до предковому вигляду породу. Це явище називають "поверненням в дикий тип".
Часткові повернення в дикий тип, або "опрощення типу", можливі і при схрещуванні двох особин однієї породи. Зазвичай це спостерігається в тих випадках, коли ці тварини походять з віддалених і неспоріднених популяцій. Механізм цього явища схожий з описаним вище псевдоаллелізмом.
Припустимо, що розвинений "стоп" у кішок з одного розплідника персів визначається рецесивними алелями двох генів: xxyyzz. У кішок з іншого, незалежного розплідника зовні той же або подібний ознака сформований за рахунок іншого набору генів: nnppqq. Що ж станеться при схрещуванні таких особин? Локуси N, P і Q у першій особини представлені домінантними алелями - так само, як локуси X, Y, Z у другій. Значить, їх нащадки будуть гетерозиготних по всім шести локусам, і ніякого "стопа" у них, природно, не знайдеться.
Зрозуміло, це спрощений приклад, реальна картина успадкування складніше. Саме тому, що визначити точні механізми успадкування морфологічних ознак практично неможливо - і невідомо ще, коли буде можливо - для заводчиків і виявляється настільки важливим знання методів племінної роботи.