Морфологічні мутації (часто їх називають видимими) пов'язані зі зміною в структурі органів, тканин або окремих структур клітини. До них відносяться: жінки з короткими у великої рогатої худоби і овець; безока і безкрилість у комах; безшерстість у ссавців; неопушеними різних органів у рослин; гігантизм. карликовість. альбінізм у людини і ін.
Фізіологічні мутації викликають зміни фізіологічних процесів. Типовий приклад - мутація, що викликає у мишей «Вальсуючі» руху.
До біохімічним відносяться мутації, які змінюють або повністю блокують синтез певних речовин в організмі. Найбільш добре вони вивчені у мікроорганізмів. Багато мутанти (ауксотрофи) не ростуть без введення в середу деяких речовин, на відміну від прототрофов - організмів дикого типу, які здатні синтезувати всі необхідні їм речовини і ростуть на мінімальних середовищах (містять тільки мінеральні солі і вуглеводи).
Класифікація мутацій за фенотипом дуже умовна. В основі будь-яких мутацій завжди лежать зміни біохімічних процесів. Конкретний приклад: спадкове захворювання фенілкетонурія проявляється як розумова неповноцінність, тобто це - фізіологічна мутація. але пов'язана з порушенням синтезу тирозину з фенілаланіну і накопиченням фенилпировиноградной кислоти, яка блокує ланцюга ряду реакцій і в кінцевому рахунку є причиною слабоумства.
Класифікація мутацій Г. Меллера
При гіпоморфних мутаціях змінені аллели діють в тому ж напрямку, що і аллель дикого типу, але дають ослаблений ефект. Наприклад, особини з двома летальними мутаціями в гомозигот виживають, але гемізіготен (особини, у яких одна хромосома несе мутацію, а друга відсутня) гинуть. В даному випадку мутантний аллель діє в напрямку забезпечення життєдіяльності. але його дії не вистачає. Збільшення дози мутантного гена веде до відновлення ознаки дикого типу.
Аморфні мутації проявляються у фенотипі як втрата гена. Приклад - аморфна мутація w. Фенотип - білі очі - обумовлений повною втратою функції гена, який контролює транспорт пігменту в клітини очі.
Антіморфние мутації змінюють фенотип дикого типу на протилежний. Наприклад, у кукурудзи ген А (дикий тип) забезпечує пурпурний колір рослин і насіння через наявність антоциана. Аллель а р (антіморф) діє в протилежному напрямку, що проявляється у формуванні бурого забарвлення і блокуванні освіти антоціанів.
Неоморфние мутації - фенотип мутантів зовсім відмінний від дикого. Наприклад, мутація Antp у дрозофіли призводить до формування ноги на голові, на місці антени.
Гіперморфние мутації - у цих мутантів кількість біохімічного продукту різко збільшується. Приклад: забарвлення очей у дрозофіли:
червона еозіновая темно - червона.