На початку наступного сезону Конте зіграв 2 матчі в Кубку Італії і отримав важку травму - перелом великої гомілкової кістки правої ноги. Уже в 17 років його кар'єра футболіста могла обірватися. Але величезне терпіння і сила волі дозволили Антоніо відновитися після травми. Він не грав цілий рік. У сезоні 1987/1988 Конте взяв участь лише в трьох матчах Серії В і двох в Кубку Італії. Його команда знову пробилася до еліти, ставши єдиною, хто жодного разу не програв удома.
У першому повноцінному для себе сезоні в Серії А Антоніо провів 19 матчів і допоміг «Лечче» не тільки залишитися в еліті ще на рік, але і піднятися на 9-е місце в чемпіонаті. Це рекордна позиція для клубу за всю історію.
У першому своєму сезоні за «Ювентус» Конте відіграв 20 матчів (14 в Серії А і 6 в Кубку Італії), відзначившись при цьому одним видаленням в фіналі Кубка проти «Парми» (0: 2). За весь сезон Антоніо зіграв всього один повний матч (в Кубку Італії проти «Інтера» - 1: 0). Команда стала двічі другий - в чемпіонаті відстали від «Мілана» на 8 очок, а в Кубку програли в фіналі пармезанцям 1: 0 і 0: 2. Вельми непоганий початок як для 22-річного гравця, який провів перший сезон в команді, за яку вболівав з дитинства.
У наступному сезоні Антоніо Конте разом з Ювентусом виграв всі італійські трофеї і тільки в Європі залишився без нагород, програвши у фіналі Кубка УЄФА Пармі (0: 1, 1: 1). Той сезон можна назвати одним нескінченним матчем з пармезанці. Команди між собою зіграли сім (.) Раз. Крім єврокубковій зустрічі суперники грали в Серії А (3: 1 і 4: 0 на користь «Юве»), в фіналі Кубка Італії (1: 0 і 2: 0 за «Ювентусом»), а також в Суперкубку Італії - 1: 0 перемогла Стара Синьйора.
Оскільки в Серії А "Мілан" відірвався досить далеко, пріоритетом була обрана Ліга чемпіонів. Груповий турнір «Ювентус» пройшов з великим запасом, забезпечивши собі перше місце вже після чотирьох турів. Конте забив ще один переможний гол у ворота шотландського "Рейнджерс". У плей-офф були повалені мадридський «Реал» і французький «Нант».
У фіналі проти «Аякса» Антоніо Конте вийшов в стартовому складі, але через травму не дограв до перерви. «Ювентус» виграв у серії пенальті і завоював свій другий Кубок чемпіонів.
У чемпіонаті Італії навіть серія з 6-ти перемог на фініші не допомогла «Ювентусу» наблизиться до «Мілану», і клуб зайняв друге місце.
За весь сезон Конте зіграв всього 10 матчів (зумів забити один гол). Тим часом «Ювентус» виграв Серію А, Суперкубок УЄФА, Міжконтинентальний кубок. але програв фінал Ліги чемпіонів.
В цілому сезон видався для Антоніо значно краще, ніж попередній. Він зіграв у 44-х матчах і забив в них 6 голів, а "Ювентус" знову став чемпіоном Італії і програв фінал Ліги чемпіонів.
Той сезон вийшов провальним для «Ювентуса». Серйозну травму майже на самому початку отримав Дель П'єро, гра у команди розладналася, і Марчелло Ліппі змушений був подати у відставку. Йому на зміну прийшов Карло Анчелотті. який раніше мало не зробив провінційну «Парму» чемпіоном Італії. З приходом Анчелотті Антоніо Конте повернули капітанську пов'язку. В знак визнання його заслуг перед командою вболівальники з трибуни імені Гаетано Ширеа подарували Антоніо капітанську пов'язку з написом: «Де б ми були без тебе, Антоніо Конте, наш капітан».
За півсезону при Ліппі Антоніо не забив жодного разу, а при Анчелотті в 19-ти матчах відзначився 7-ма голами. Конте забивав в трьох матчах Ліги чемпіонів поспіль, при цьому всі голи були вирішальними. Спочатку переможний гол в Турині в 1/4 фіналу «Олімпіакосу» ( «Юве» виграв 2: 1). У матчі-відповіді команда була в п'яти хвилинах від вильоту з турніру, але Конте після знижки Індзагі забив рятівний гол.
Після закінчення сезону Антоніо Конте отримав запрошення від «Фіорентини», яку тренував Джованні Трапаттоні. Гравці «Юве» пригрозили страйком у разі продажу капітана, і з Конте продовжили контракт ще на три роки. Після цього пішли два сезони, в яких «Ювентус» фінішував другим в Серії А і невиразно виступав в Європі, після чого замість Карло Анчелотті знову прийшов Марчелло Ліппі.
Антоніо Конте - ось вирішення всіх проблем. Коли ситуація стає загрозливою, коли надія тане остаточно, він бере справу в свої руки. (Карло Анчелотті) [1]