Багаті надра Алтаю корисними копалинами.
Відомі Змеіногорского і Золотушінское родовища поліметалів. які мають руди складного складу і містять мідь, свинець, цинк, срібло, золото. Вольфрамомолібденовие родовища знаходяться в кристалічних породах. Іноді вони розташовані в вапняках, перерізаних кварцовими жилами з різноманітними компонентами, що складаються з вольфраму, цинку, міді і рідкісних металів.
Ртутні родовища приурочені до розломів Альпійської епохи горотворення. Основні родовища кіноварі (ртутна руда) знаходяться в долині р. Чуи - Акташське і Чаган-Узунское. У північній частині Чергинського хребта відкрита Сарасінская зона ртуті.
По західних схилах Салаирского кряжа виявлені родовища бокситів і мідної руди. На стику Алтайських гір і Салаира залітають руди магнію.
В озерах Кучукском і Великому Яровому є лікувальні грязі. У передгір'ях Алтаю знайдені радіоактивні джерела, особливо широко відомі Белокуріхінскіе радонові води. на базі яких функціонує курорт.
У Кулундинской низовини на глибині 1200-1400 м знаходяться прісні і мінеральні підземні води. Прісні води придатні для побутових і технічних цілей, що має важливе значення для посушливої Кулунди.
У Кулундинской низовини більше солоних озер, ніж прісних, частина Їхніх розташована на Приобского плато. У Кучукском, Кулундкнском, Мармишанском є мирабилит - сульфат натрію). В ропі Кучукского і Великого Ярового озер міститься хлористий магній. солі брому. Запаси кухонної солі в Кучукском озері становлять 56,8 млн. Т; в Бурлінском - 30 млн. т. У Михайлівському, Танатар 1, в Петуховскій озерах міститься сода. кухонна сіль, мирабилит. Загальні запаси природної соди в краї - понад 6 млн. Т, що становить приблизно 96% запасів Росії (перше місце в світі). За запасами мірабіліту край посідає перше місце в Росії. Мірабіліт міститься в розсолі Кучукского озера і залягає в ньому пластом потужністю до трьох метрів.
Будівельний матеріал є майже у всіх районах краю. Запаси глин для виробництва цегли необмежені. У середній течії Бії знаходиться Ажінское родовище багатобарвних фарбувальних глин - червоного, синього, жовтого, сірого та інших квітів. З них виготовляються мінеральні фарби. Цементні вогнетривкі глини розташовані на західних схилах Салаира. Велике Врублево-Агафоновська родовище в районі ст. Голуха має запаси до 35 млн. Т вапняку і 11 млн. Т глини.
В Алтайському краї широко поширені різні види піску. Кварцові піски використовуються для виробництва силікатної цегли, з чистих кварцових пісків отримують скло. Родовища будівельних пісків розташовані поблизу Барнаула, Каменя-на-Обі. Піщано-гравійні суміші знаходяться в долині Бії, Катуні, в верхів'ях Алея.
Вапняки - найважливіший будівельний матеріал. Запаси їх у краї практично невичерпні. Великими родовищами вапняку для випалу є Тугаінское (м Гірничо-Алтайськ) і Манжерокское.
Мармур - цінний декоративний будівельний матеріал. По долині Чуй на десятки кілометрів тягнуться хребти, основною породою яких є білий, фіолетовий і сірий мармур. У Ороктойском родовищі (середнє протягом Катуні) мармур кількох кольорів і відтінків: палеві і білосніжні мармури змінюються рожевими і золотистими. Ороктойскім мармуром облицьована Таганська станція Московського Метрополітену, а пуштулімскім - колони станції «Парк культури і відпочинку». Пуштулімское родовище знаходиться на Салаира. Відомий Коргонскій мармур по Чариш.
Яшми, кварцити, порфіри і інші вироби камені, багатобарвні і високоякісні, знаходяться в коливанських, Тігірецком, Коргонського і інших хребтах північно-західного Алтаю. Нерідко зустрічаються опали, халцедони, гірський кришталь. У Гірському Алтаї є грифові сланці, на Салаира - графіт.
Гнейси і гіпс використовуються як будівельні матеріали. Основне родовище гіпсу у озера Джиро в Кулундинской степу.
Значні запаси граніту. який застосовується при будівництві міцних споруд; він добре полірується і тому використовується для облицювання будівель і пам'ятників.