Фотосинтез може протікати в різних органах рослин (стебла, плоди і ін.), Що мають зелене забарвлення, але основним спеціалізованим органом фотосинтезу є лист.
Лист - це орган рослини, початково спеціалізований для здійснення фотосинтезу, сформувався в ході тривалого еволюційного процесу. Анатомічна будова листа пристосоване до того, щоб забезпечити надходження СО2 до клітин, що містить зелені пластиди, і досягти максимального поглинання енергії світла: 1. Плоска структура листа забезпечує більш щільне загарбання світла для фотосинтезу; 2. Наявність межклетников полегшує доступ СО2 до всіх клітин; 3. Палісадна паренхіма - це основна ассимиляционная тканину листа вуглеводів, особливо багата хлоропластами. Вона примикає до епідермісу, розташованому на верхній стороні листа; 4. Густа мережа жилок забезпечує клітини паренхіми водою і сприяє швидкому відтоку з листа вуглеводів, що утворюються в процесі фотосинтезу.
Процеси зростання зосереджені в нирках, тому вони в першу чергу і вступають в покоїться стан. У стані спокою можуть перебувати не всі нирки, розташовані на даному рослині, а лише окремі. Покояться нирки (вічка) характерні не тільки для всього організму, але і для його окремих частин (бульб, кореневищ). Саме покоїться стан нирок доводиться на період знижених температур, і, отже, зміни, що готують подальше зростання, зазвичай також бувають при знижених температурах. Вступ же в період спокою відбувається ще при досить високих температурах. Мабуть, сигналом для вступу в спокій служить певне співвідношення дня і ночі (певний фотоперіод). Рослини вступають в спокій під впливом укороченого дня і виходять з нього під впливом довгого дня. Фотоперіодичну реакція в разі вступу нирок в спокій подібна до фотоперіодичною реакцією, що обумовлює цвітіння рослин. Так, виявилося, що саме тривалість темнового періоду (довга ніч) визначає вступ рослин у період спокою. Органом, що сприймає Фотоперіодичний стимул, є або листя, або, у деяких рослин, нирки. Під впливом укороченого дня в рослині виробляються інгібітори росту (абсцизовая кислота, етилен, фенольні сполуки), що і викликає уповільнення фізіологічних процесів в нирках. Одночасно відбувається зменшення вмісту таких фітогормонів, як гібереліни. Протилежні зміни характерні для нирок, які переходять з спочиває стану до зростання: нагромадження ауксинов, гиббереллинов і зникнення інгібіторів (В.І. Кефели, Р.Х. Турецька). Оскільки фітогормони і інгібітори мають загальних попередників, то в залежності від умов (довжини дня, температури) може здійснюватися переважне освіту або інгібіторів росту (абсцизовой кислоти, етилену, фенольних сполук), або таких фітогормонів, як ауксин, гібереліни, цитокініни. Тривалість періоду спокою пов'язана зі швидкістю руйнування інгібіторів росту. Покояться нирки рослини характеризуються зниженим метаболізмом. Однак в них йдуть певні процеси обміну, зокрема не припиняється процес дихання.
Є дані, що в цей період відбувається накопичення попередників нуклеїнових кислот, йде певна диференціація клітинних структур. Саме це готує наступну активацію ростових процесів. Одночасно при вступі в період спокою відбувається ряд процесів, що підвищують стійкість клітин до несприятливих умов. Так, за даними П.А. Генкеля, при переході в глибокий спокій в клітинах відбувається процес відокремлення цитоплазми. Це виражається в тому, що плазмодесми втягуються всередину клітин, а плазмалемма відстає від клітинної оболонки. Поверхня цитоплазми часто покривається шаром ліпідів. В'язкість цитоплазми зростає. Завдяки відставання цитоплазми від клітинної оболонки швидкість плазмолізу зростає, незважаючи на те що її в'язкість збільшується. Процес відокремлення цитоплазми викликає порушення зв'язків між клітинами, що, в свою чергу, призводить до зниження інтенсивності процесів обміну. Відставання цитоплазми від клітинних оболонок, а також накопичення ліпідів в поверхневому шарі роблять її більш стійкою.