Перед тим, як почати користуватися Guitar Pro 6. не потрібно робити ніяких спеціальних налаштувань. Відразу ж після установки програма готова до роботи.
Зліва в головному вікні розташований зручний сайдбар, що дає доступ до абсолютної більшості функцій програми:
Realistic Sound Engine, бібліотека реальних звуків, що вперше з'явилася в Guitar Pro 5, в новій версії була доповнена новими звуковими банками для більш правдоподібного звучання різних інструментів. Щоб змінити стандартне MIDI-звучання нот на реалістичне RSE, потрібно зайти в меню «Звук» і поставити галочку навпроти відповідного пункту. Можливо, для коректної роботи RSE доведеться довантажити нові звукові банки з сервера. Відсутні банки завантажаться автоматично після натискання F2. Поруч, все в тому ж меню «Звук» знаходяться інструменти для настройки пристроїв введення та виведення звуку. Відповідно, «MIDI-введення» для введення, а «Опції аудіо» - для MIDI-виходу та вибору активної звукової карти.
Корисним доповненням до гітар про стане програма MySongBook Player - це зручний додаток для пошуку табулатури, яке інтегрується з «материнським» додатком Guitar Pro 6 і дозволяє шукати таби прямо з вікна програми, що не подорожуючи по просторах інтернету і по сайтам-бібліотекам. Додаток MySongBook Player саме містить велику бібліотеку композицій, розписаних по нотах професійними музикантами.