У 1919 році Нойферт, після п'яти років роботи каменярем, стає одним з найперших учнів Bauhaus і вже в 1920 році закінчує навчання. У тому ж 1920 році, під час поїздки в Іспанію, де він вивчав церковну середньовічну архітектуру, Нойферт знайомиться з Антоніо Гауді (Antonio Gaudi). Ця зустріч справила величезне враження на молодого студента і справила великий вплив на подальшу творчість. Згодом Нойферт одним з перших встане на захист Гауді в Німеччині.
Після 1921 р Нойферт знову повертається до спільної роботи з Вальтером Гропіусом і незабаром стає шеф-архітектором (Bueroschef) в найвидатнішою архітектурною школі Веймарської республіки.
У 1923 році Ернст Нойферт зустрічається з художником Алісою Вулмер (Alice Vollmer), дослідником творчості Георга Муше (Georg Muche) і Пауля Клеє (Paul Klee). У 1924 році вони одружаться і у них буде четверо дітей.
У 1925 році Нойферт в тісній співпраці з Гропіусом займається реалізацією нових будівель Баухауз (Bauhaus) в Дессау і завершенням студій, так званих Meisterhaeuser для Кандинського, Георга Муше (Georg Muche) і Пауля Клеє (Paul Klee).
У 1926 році він стає викладачем в Bauhochschule в Веймарі з Отто Бартінгом (Otto Bartning), а в 1929 році будує для нього приватний будинок, сьогодні в цьому будинку знаходяться Фонд Нойферт і невеликий музей Neufert Box зі змінною експозицією.
1928-30 він реалізує різні проекти, наприклад, Mensa am Philosophenweg (1928 - 1930) і Abbeanum (1929 -1930) в Єні.
У 1934 році Нойферт проектує знаменитий будинок з кольоровими скельцями Чарльза Гроделя (Charles Crodel) для директора об'єднаної скляної промисловості в місті Лаузітц (Vereinigte Lausitzer Glaswerke). Також він проектує різні житлові комплекси, заводи і офісні будівлі в багатьох містах Німеччини.
Вже на самому ранньому етапі своєї творчості Нойферт приділяє багато уваги раціоналізаторських процесу в будівництві, а також розробці нормативних правил індустріальної архітектури.
Паралельно з практичною діяльністю Нойферт веде активну роботу по створенню довідника «Будівельне проектування» - Bauentwurfslehre.
Після закриття нацистами Bauhaus, він переїжджає в Берлін, де працює в приватній школі архітектури і мистецтва, яка теж була закрита в 1934 році. І в 1936 році Нойферт пливе в Америку. В цей час Німеччину масово покидають багато чудові фахівці в галузі мистецтва і архітектури. У Нью-Йорку Нойферт зустрічається з Френком Ллойдом Райтом (Frank Lloyd Wright) і розглядає свої шанси на подальшу діяльність в США.
Незважаючи на те, що Bauhaus був ліквідований, офіційна архітектура прийняла важкі регресивні риси неокласицизму, а більшість прогресивних архітекторів покинуло Німеччину, талант Нойферт нагоді і націонал-соціалістам. Велика кількість замовлень для його студії на проектування промислових підприємств призводять Нойферт до вирішення залишитися в Німеччині. У 1939 він стає представником по стандартизації німецької промислової архітектури та співпрацює з Альбертом Шпеером (Albert Speer) по цій темі. У цьому контексті він публікує Bauordnungslehre, як підручник для промислових цілей і раціоналізації.
Після Другої Світової Війни Ернст Нойферт отримує призначення професором в Дармштадті, і відкриває свою власну студію в 1974 році.