Абітурієнти можуть пройти необхідну підготовку до вступу до ВНЗ на проведених підготовчих курсах в складі малокомплектних груп на очною, заочною, очно-заочної основі. Успішно закінчивши курси слухачі при зарахуванні до університету на перший курс за конкурсом користуються пільгами.
Вища освіта в морському університеті можна отримати з присвоєнням ступеня бакалавр, спеціаліст, магістр навчаючись на очній і заочній формах за такими основними напрямками підготовки: економіка, менеджмент, транспортні технології, суднобудування та океанотехніка, морський і річковий транспорт, електромеханіка, комп'ютерні науки, машинобудування, будівництво та ін.
Університет складається з трьох навчальних корпусів, які з'єднані між собою закритими переходами і студенти не витрачають час і фінанси на переїзди з одного корпусу в інший. У них розміщені спортивний, машинний, актовий зали, бібліотека, навчальні майстерні, лабораторії з унікальним досвідченим басейном, а також аеродинамічна лабораторія, друкарня з редакційно-видавничим центром. До складу морського університету входить яхт-клуб з тринадцятьма крейсерськими яхтами.
Іногороднім студентам надаються місця в гуртожитках.
В освітньому процесі студенти користуються комп'ютерною технікою, які об'єднані в локальну мережу, мають вихід в мережу Інтернет.
Студенти ВНЗ можуть пройти заплановані практики за кордоном в Болгарії, Греції, Македонії.
Відповідно до міжнародним проектом студенти університету можуть отримати ступінь магістра в вищих навчальних закладах Іспанії, Італії, Португалії по Морському просторового планування.
Для фахівців з вищою освітою свої послуги пропонує центр підвищення кваліфікації з підвищення кваліфікації та отримання другої вищої освіти за денною та заочною формами.
Випускники університету після закінчення навчання отримують дипломи державного зразка і, як правило, працевлаштовуються за фахом.