До органоидам спеціального призначення відносяться мікроворсинки, війки і джгутики, міофібрили, псевдоподии.
Вії і джгутики - це рухливі цитоплазматичні вирости, в яких знаходиться осьова нитка (або аксонема), а біля основи - базальне тільце. Базальне тільце служить матрицею для організації аксонема. Саме базальное тільце складається з 9 триплетів мікротрубочок, розташовується в підставі вії або джгутики і нагадує за будовою центриоль.
Аксонема складається з 9 периферичних і двох центрально розташованих пар мікротрубочок. Центральна пара оточена центральної оболонкою, від якої до периферичних парам у вигляді променів розходяться радіальні спиці. Периферичні пари мікротрубочок пов'язані між собою білком нексіном. Крім того, від микротрубочек сусідніх пар відходять ручки з білка динеина, що володіє активністю АТФ-ази. Аксонема формується шляхом самосборки білкових субодиниць. Матрицею для самозборки служить базальное тільце.
Мікроворсинки - це цитоплазматичні вирости довжиною близько 1 мкм. Вони багато разів збільшують поверхню клітини. Кожна Мікроворсинки має внутрішній каркас, утворений пучком близько 40 микрофиламентов, розташованих уздовж клітинної осі і фіксуються на внутрішній поверхні плазмолеми.
Міофібрили - органели спеціального призначення м'язових волокон. Вони мають вигляд тонких ниток, витягнутих уздовж м'язових волокон і відділяються одна від одної рядами витягнутих мітохондрій і ендоплазматичної мережі. Самі міофібрили складаються з скоротливих білків актину, міозину і інших.
Псевдоподии (ложноножки) - це тимчасові цитоплазматичні випинання у деяких одноклітинних організмів і деяких клітин (наприклад, лейкоцитів) багатоклітинних тварин. Служать для амебоидние руху і фагоцитозу.
Цитоскелет - це тривимірний цитоплазматический комплекс волокнистих і трубчастих структур, що надає клітині певну форму і виконує інші функції. Він представлений мікротрубочками, микрофиламентами і проміжними филаментами.
Микротрубочки - неветвящійся структурний компонент цитоплазми, присутній практично у всіх типах еукаріотичних клітин. Мають діаметр 24 нм, а в довжину -кілька мкм. Це динамічні структури, що постійно зростають з одного кінця і деполярізуется з іншого. Вони побудовані з білка тубуліну. Мають вигляд порожніх циліндрів.
Їх головна функція полягає в створенні еластичного і стійкого внутрішньоклітинного каркаса, необхідного для підтримки форми клітин. Крім того, вони беруть участь в транспорті макромолекул і органоїдів, забезпечують рухливість джгутиків і війок. Входячи до складу веретена поділу, забезпечують розбіжність хромосом при діленні клітин. Вони можуть бути факторами орієнтованого руху клітини в цілому.
Руйнування микротрубочек колхицином призводить до порушень транспорту речовин (наприклад, до блокади секреції) і механічного перенесення окремих внутрішньоклітинних компонентів. Крім того, при діленні клітин блокується веретено поділу.
Мікрофіламенти - відносяться до фібрилярні компонентів еукаріотів. Вони розташовуються в кортикальному шарі цитоплазми, прямо під плазмолеммой, у вигляді пучків або шарами. В середньому їх довжина становить 6 нм.
Залежно від хімічного складу мікрофіламенти можуть виконувати функції цитоскелету і брати участь в забезпеченні руху. До їх складу входять скоротливі білки: актин, міозин, тропомиозин і ін.
Основні функції мікрофіламентів - це створення внутрішньоклітинного скорочувального апарату, який забезпечує амебоідное рух клітин, більшість рухів органоїдів і поділ клітин.
Проміжні філаменти (мікрофібрили) - це тонкі неветвящиеся, нерідко лежать пучками нитки, які присутні в клітинах різних тканин і складаються з різних речовин, наприклад, з кератину - в епітелії, десмина - в м'язових волокнах і ін. Вони виконують опорно-каркасну функцію.
Включення - це непостійні компоненти, які можуть з'являтися і зникати в залежності від функціонального стану клітини. Їх класифікують на: трофічні, секреторні, екскреторні, пігментні, кристали. Трофічні включення - це, як правило, резервні скупчення гранул білка, глікогену, крапельки жирів. Секреторні гранули і бульбашки містять біологічно активні речовини і надходять по протоках залоз в ті чи інші органи. Екскреторні включення не є біологічно активними речовинами. Зазвичай це продукти метаболізму клітин, що підлягають видаленню. Пігментні включення можуть змінити колір тканини тимчасово або постійно (приклади: гемоглобін, меланін, липофусцин - пігмент зношування, білірубін та ін.). У рослинних клітинах зустрічаються включення кристалів (найчастіше це оксалат кальцію).