Заповідник розташований на північному схилі східної частини Центрального Кавказу в басейні річки Ардон і охоплює всі хребти Північного схилу. В межах річки Ардон з півдня на північ простежуються 5 паралельних хребтів, розділених вузькими поздовжніми долинами: Головний Вододільний, Бічний, Скелястий, Пасовищний, Лісистий і Передгірний.
Головний Вододільний хребет є вододілом між річками Північного Кавказу і Закавказзя. Це найвищий хребет в межах заповідника. Багато його вершини піднімаються вище 4000 метрів над рівнем моря: Бубісхох (4468 м), Адай-Хох (4405 м), Уілпата (4646 м).
Східна частина Головного Вододільного хребта, розташована між Мамісонський (2829 м) і Трусовского (3127 м) перевалами, в верхів'я річки Ардон зміщена на південь і переходить в нижчу гірський ланцюг. Максимальні висоти тут нижче 4000 м - Халаца (3950 м), Зілга-Хох (3883 м), Зекарі (3829 м).
Південна внутрігорние депресія, розташована між Головним (Вододільним) і Боковим хребтами, представлена в верхів'ях річки Ардон Зарамагской (Туальской або Наро-Мамісонський) улоговиною.
Бічний хребет увінчаний сніговими піками тепла (4425 м), Колота (4170 м), Архон (4150 м), Цміакомхох (4117 м). Він складний кристалічними сланцями, гнейсами, гранітами, а також різними вулканічними породами і осадовими відкладеннями. На схід від річки Ардон граніти зустрічаються лише окремими ізольованими в Архонского і Бадском ущелинах.
Північна юрська внутрігорние депресія, що розділяє Бічний і Скелястий хребти, представлена в басейні річки Ардон Садоно-Унальской улоговиною.
Скелястий хребет представлений Каріухохскім масивом. Вища його точка - гора Каріухох (3410м). У гребньовій зоні хребта і на його північному схилі розвинені карстові форми рельєфу: печери, провали, воронки і т.д. Найбільша печера Шуби-Нихасская - вперше досліджена науковцями заповідника. Загальна протяжність її понад 1000 м.
За фізико-географічним районуванням територія заповідника входить в Кримсько-Кавказьку країну, область північного схилу Великого Кавказу, Ельбрус-Казбекський (Центрально-Кавказьку) провінцію, Владикавказький округ, Урух-Ардонський район.
Територія заповідника розташована на північному схилі східної частини Центрального Кавказу, на висотах 650-800-4646 м (гора Уілпата - найвища точка заповідника) на схилах паралельних, субширотно орієнтованих хребтів, розділених поздовжніми долинами пасовищного, Скелястого, Бічного і, частково, Головного Вододільного в басейнах річок Ардон і Фіагдон.
Найбільшим льодовиком заповідника є Цейський. Інший великий льодовик - Сказскій - знаходиться в верхів'ях річки Сказдон, правої притоки Цейдона.
З вершини Зарамагхох спускається Зарамагской льодовик. На тепло-Архонского масиві заледеніння розвинене слабше. Тут переважають карові і висячі льодовики (Цазіу, Халанни, Урусти і ін.), Які харчуються за рахунок снігових лавин і обвалів. Вони зосереджені в верхів'ях річок Архондон, Баддон, Бугультадон.
Головна водна артерія заповідника - річка Ардон - бере початок в Зарамагской улоговині від злиття річок Нардон, Мамісондон, Цміакомдон і Адайкомдон. Звідси Ардон спрямовується на північ по вузькому Касарскому ущелині в Садоно-Унальскую межгорную улоговину. Він приймає ряд приток (Уілсадон, Касайкомдон, Цейдон, Баддон, Архондон, Уналдон, Цахцадкомдон) і через Нихасскую тіснину в скелястому хребті залишає гори. Найбільший свій приплив, річку Фіагдон, Ардон приймає вже за межами заповідника на рівнині. У заповіднику понад ста річок і великих струмків, які утворюють досить густу гідрографічну мережу.
В горах Північної Осетії багато пам'яток історії та архітектури різних часів. Нижче перераховані лише найбільш відомі і характерні:
1. Печерні стоянки і містечка:
- неолітична стоянка «Шаулагат» в Алагирський ущелині
- неолітична стоянка в Кадаргаванском каньйоні Куртатинській ущелини
- середньовічний «Овечий містечко» на південно-східному схилі гори
- Каріу-хох в Куртатинській ущелині
2. Наскельні фортеці:
- над селом Урсдон на південно-західному схилі г. Каріу-хох в Алагирський ущелині
- навпаки села Нуза в Алагирський ущелині
- над селом Дзівгіс на східному схилі гори Каріу-хох в Куртатинській ущелині
3. Загороджувальні стіни:
- Хілакская стіна в Куртатинській ущелині
- зміцнення «Галфандаг» в Алагирський ущелині нижче села Н. Зарамаг;
4. Фортеці на дорогах і митні ворота:
- фортеця «Зилин дуар» в Касарском ущелині
- фортеця навпроти села Бугултикау в Хілакском ущелині Куртатинській ущелини
- митні ворота «Чирамад» в урочищі «Шуби» біля села Зінцар Алагирського ущелини »;
5. Катакомбні могильники:
- в селі Архон Алагирського ущелини
- в селі Зінцар Куртатинській ущелини
- в селі Карца Карцінского ущелини
6. Ськлепової могильники: біля всіх сіл Сонячної долини (між Скелястих і Боковим хребтами.
7. Житлові і сторожові вежі: у всіх селах.
9. Православні церкви:
- Св. Трійці (XI-XIII ст.) В селі Попелюхи Мамісонського ущелини
- каплиця (XI-XIII ст.) в селі Нуза Алагирського церква Успіння
- Богородиці (XIX ст.) В селі Лісрі Мамісонського ущелини,
- Св. Михайла Архангела в селі Тиб Мамісонського ущелини,
- дерев'яна церква в селі Цей Алагирського ущелини і т.д.
Навчальна екологічна стежка природи «До Цейское льодовику»
- Протяжність стежки - 4700 м
- Час проходження з зупинками - 6-7 годин
- Оптимальне число екскурсантів в групі - не більше 15 осіб.
Цейское ущелині склалося на північному схилі Адайхохского кристалічного масиву, утвореного при з'єднанні гірських груп Головного і Бічного хребтів. Відрізок Бічного хребта з абсолютними висотами до 3000-4150 м (Цейський хребет) обмежує долину річки з півночі. З півдня вона відокремлена від сусіднього Касарского ущелини і тепло-Архонского масиву відрізком Головного хребта (Кальперскій хребет), досягаю-ного висоти 4400 м.
Цейський і Кальперскій хребти з'єднані коротким (4 км) відрогом з величними, засніженими, сяючими вершинами Уілпата (4646 м), Адай-Хох (4405 м) та ін. Званим альпіністами «Цейское підковою».
Адайхохскій і тепло-Архонского (розташований на схід від) гірські масиви, складені кристалічними сланцями, гнейсами і іншими елементами палеозойської ери, являють собою центральне підняття на площі Північно-Осетинського державного природного заповідника (СОГПЗ), адміністративно відноситься до Алагирського району РСО-Аланія.
Стежка бере початок на галявинах південній периферії турготель «Горянка» на висоті 1900 м над рівнем моря. Дівоча середу сосняку чернично-чагарникового перетворена тут присутністю людини в куртини-поля комплекс сосняку різнотравного (зупинка 1).
Піший маршрут на Цейський льодовик в минулому був найпопулярнішим із заходів Цейское турбаз. Перші туристи і альпіністи описали і промарковані його ще в кінці 19 століття, і з тих пір екскурсія на Цейський льодовик вважалася головною метою всіх, хто прибуває сюди.
Від турбази «Цей» по автомобільній дорозі необхідно йти вгору по ущелині правим берегом річки Цейдон повз студентського табору СКГМІ, альплагеря «ТОРПЕДО» і турбази «ГОРЯНКА». Далі маршрут йде лівим берегом серед заповідного мореного лісу і через три години призводить на Цейський льодовик. Опинитися влітку на льодовику величезних розмірів - це казка наяву. Екскурсія на Цейський льодовик ознайомить нас зі слідами випахівающей діяльності льоду і інтенсивного морозного вивітрювання з явищами термокарста: крижаними толамі, склянками, млинами, спостерігаємо різні типи льодовикових тріщин, морен та інших форм гляциального рельєфу.
Екостежкою до Цейское льодовику раніше була обладнана аншлагами і висотними відмітками через кожні 50 м перепаду висот. Стежка починається від першої (праворуч по ходу) галявини в сосновому лісі, за турбазою «Горянка». Протяжність її 5-6 км. Час проходження з зупинками 5-7 годин. За РЕКОМ стежка йде по густому лісі. Видно старі морени.
Після переходу через річку Цейдон у колишньої метеостанції, а нині КСС зліва у всій красі з'являється двоголовий вершина Адай-Хох зі сповзаючим з неї Сказскім льодовиком. Попереду чорніють голі схили Уанекпи (Монах), праворуч, від якої піднімається до хмар сніжна вершина Уілпата, стара назва - Елбаттихох ( «присів гора»). Гора Уанех'ба (Уанекпа), нині звана «Чернець», в народі відома як Дзуарбадан, що в перекладі з осетинського буквально означає «Місце проживання (сидіння) дзуар, святилища ангела». Насправді обриси цієї гори, що нагадують обличчя старого, - результат вивітрювання гірських порід - гранітів.
В 400-450 м від турбази «Горянка» на правому березі річки Цейдон в районі існуючого водозабору виходять джерела. Каптаж цих джерел - джерело водопостачання курортної зони «Цей». На майданчику водозабору простежуються два основних виходи підземних вод, розташованих один від одного на відстані двох метрів. З них утворюється струмок, який в 100 м від витоку впадає в річку Цейдон. У заплаві річки - великі брили вивержених порід, простір між ними не заповнено. Ґрунтова поверхня їх покрита мохом і в окремих місцях - грунтово-рослинним шаром. Є й інші виходи підземних вод. Основний їх вихід з корінних порід правого борту долини річки Цейдон простежити неможливо через величезної кількості глибового матеріалу, що приховує його. Вище існуючих виходів підземних вод по схилу в брилах є порожнечі, в яких чути шум руху вод.
Забезпечення безпеки відвідувачів
Маршрут в цілому проходить по десятиліттями формувалася стежці, яка не має крутих підвісів і проходів, тому особливих складнощів при його проходженні не виникає. Є тільки один труднопроходимий ділянку, протяжністю близько 350 м, практично у мови льодовика: серед валунів, що оголилися під час відступу льодовика, донної морени. Обов'язковий інструктаж з техніки проходження небезпечних ділянок.
Рекомендації по рекреаційної ємності маршруту: 10-15 чоловік в групі. Групи виходять на маршрут кожні 3 дні, на місяць - 8 груп.
Екостежкою до подвійних водоспад
На цій стежці класично виражені природні комплекси лавинних конусів виносу і селевих потоків. Рослинність тут періодично страждає від сходу потужних лавин, що сходять з боку Кальперского перевалу. Мови лавин в багатосніжні зими досягали берегів р.Цейдон. При сходженні лавини берези згинаються під вагою снігу і ламаються сосни. У малосніжні зими лавин тут не буває.
1-я зупинка. Початок стежки на правому березі річки Цейдон. Річка Цейдон типово гірська льодовикова річка з максимальним рівнем води в літній період. Взимку вона маловодна, покрита сніжно-льодовими мостами. Русло річки кам'янисте, порожисте з величезними розкиданими по руслу гранітними окатанного валунами. По берегах росте вільховий ліс з домішкою верби. На терасах - соснові і мішані сосново-березові ліси. Підлісок складається з азалії, жимолості кавказької. Тут на терасі річки Цейдон збереглися залишки будівлі функціонують очисних споруд.
2-я зупинка. Поляна з луговий рослинністю. Тут представлена різнотравно-злакова рослинність лісових галявин. Влітку на ній - килим з квітучих рослин (буквиця великоквіткова, горець м'ясо-червоний, змееголовник, слонохоботнік і ін.) Уздовж стежки можна побачити сліди кротовін і мурашників. Стежка місцями проходить через змішаний березово-сосновий ліс з домішкою клена Траутфеттер.
3-тя зупинка. На лівому борту селевий промоїни струмка Кальпердон. Тут добре виражений селевий лоток з незадернованних руслом, сіруватим за кольором від ходу гранітних порід. Лоток врізаний в гігантський конус виносу, створений струмком (селевими потоками) і лавинами, що сходять зі схилів з-під Кальперского перевалу, тут знаходиться потужна стародавня морена льодовика і накопичено багато уламкового матеріалу.
Звідси добре видно Цейський хребет з сосновими лісами, луговими схилами і скельними ділянками в вершинної частини. На виположенной частини схилу розташоване с. Цей, з вежами, житловими спорудами. На гребені відрогу під цим селищем знаходиться святилище Уастирджі (св. Георгія).
Екостежкою по Суадагскому ущелині
Навчальна екологічна стежка природи до водоспадів "Шагацікомдон»
- Протяжність стежки - 712 м
- Час проходження з зупинками - 2 години
- Число екскурсантів в групі - не більше 10 осіб.