Рублево лежало при річці Переході і представляло собою гори, прорізані ярами і покриті віковим лісом. Місце це здалося Антонію зручним для відокремленого пустинножітельства. В одній горі він викопав собі тісну печеру і почав в ній рятуватися: праця, молитва, піст і інші подвиги приборкання плоті були для відлюдника засобами порятунку. За заповіддю Божою, преподобний Антоній куштував свій хліб «в поті чола» (Бут. 3. 19). Він розчистив ліс під ріллю і город, сіяв хліб, садив овочі; потім сам прибирав дозрілу ниву, сам і молотив хліб на току, яке влаштував недалеко від печери. Добутий власною працею хліб і служив пустельника їжею; зрідка він додавав до нього трохи овочів. Але і цієї мізерної їжі преподобний куштував лише по стільки, скільки необхідно для підкріплення знемагає плоті, один раз на добу, після заходу сонця. Часто ж преподобний і зовсім відмовлявся від їжі, накладаючи на себе строгий піст. Пив він просту колодязну воду. Спав подвижник на сирій землі, що заміняв в його печері підлогу, причому в головах собі клав нічим не покриту дерев'яну колоду. Неодноразово протягом ночі він залишав своє суворе ложе для молитви. У молитві виливав він перед всевидячим Господом свою душу і нею захищав себе від нападників на нього пустельних страхувань.
Йдучи неухильно скорботним і вузьким шляхом найсуворішого подвижництва, преподобний Антоній, підкріплений благодаттю Божою, досяг настільки високого ступеня досконалості, що остаточно умертвив в собі будь-яку прихильність до миру.
Тим часом таємний догляд його з батьківщини кинув домашніх в скорботу і сльози; вони почали всюди шукати зниклого. Двом сестрам преподобного вдалося дізнатися про місце його подвигів. Прийшли вони в Рубльовському пустель, довго ходили тут по дрімучому лісі, звали подвижника-брата і плакали. Але преподобний Антоній не відображено їм, бо я ради Господа він залишив свій дім. Господь сказав: «всяк, іже залишить будинок імені Мого ради, сторицею прийме» (Матв. 19. 29). На виконання цих слів Він удостоїв Свого угодника великого дару чудотворіння.
Незважаючи на повне усамітнення преподобного Антонія, чутка про його богоугодного життя поширювалася все далі і далі. Почув про нього чернець одного монастиря, на ім'я Нифонт, який і захотів відвідати славного подвижника. Від одного Новгородського купця Нифонт дізнався, де знаходиться Рублевская пустель, і відправився до преподобного Антонія. Побачивши його, чернець спочатку злякався, тому що виснажена подвигами плоть пустельника була чорна і груба. Але преподобний заспокоїв відвідувача словами: «Чадо, не бійся виду мого тіла!» Потім, назвавши по імені Нифонта, з яким зустрічався перший раз в житті, преподобний поцілував його і розділив з ним свою скромну трапезу. Цілий день вели вони спасенну бесіду, перериваючи її за часами спільною молитвою.
Незабаром почали стікатися сюди бажаючі трудитися під керівництвом преподобного Антонія. Приходили в Леохново не тільки люди простого звання, але також і знатні, подібно самому преподобному, люди благородного походження, які, за словами апостола, поставили вся вміти бити, щоб Христа пріобрящут (Філіп 3. 8). Преподобний ні людиною освіченою або навіть начитаним, але для зібралася братії він з'явився мудрим керівником, будується інший ченців і власним прикладом, і хоча простими, але повними глибокого життєвого значення повчаннями. Першим був подвижник в храм і залишав його останнім; за службою Божою він стояв з великим увагою і благоговінням. Час, вільний від церковної молитви, він проводив в працях, сам виконуючи всі чорні монастирські роботи. Іноді преподобний пек для братії хліб або готував страву. Після трудового дня наступала ніч, але і її подвижник нерідко проводив без сну в молитві, не даючи ніякого послаблення плоті, і без того виснаженої невпинним працею і постом.
Наслідуючи сам великим пустельників давнини, преподобний Антоній ставив їх у зразок чернечого життя братії своєї обителі. Він любив нагадувати їм такі слова святого Ісидора Пелусіота: «Для чого ми називаємо батьками перед нами колишніх чорноризців, якщо самі не хочемо, як справжні сини їх, наслідувати їхній батьківським звичаям і прикрашатися їх звичаями? Не можуть нам бути батьками ті, звичаїв яких не наслідуємо. Поревнуем, браття, з житієм батьків наших, які, окрилений любов'ю до Бога, возлетелі від видимого понад усе земного, щоб скуштувати солодощі небесної; бездомовние, безіменні, в пустелях і щілинах земних, вони підкорили плоть свою духу і вже на землі явили себе ні від людей, але ангелами; поревнуем їм, щоб разом з ними прославитися на небесах ». Переконуючи братію йти шляхом, заповіданий святими отцями, преподобний Антоній вказував їм, що для цього потрібно єдино щире бажання і здоровий глузд. Рятівний шлях однаково відкритий і вченому і простаків. На підтвердження цієї істини він повторював братії вислів батька ченців, преподобного Антонія Великого: «Не вимагає інших душа людська, як тільки здорового глузду».
Настанови Леохновского подвижника, підкріплені його прикладом, падали на добрий грунт: братія старанно виконували його настанови. Церковне богослужіння в обителі відбувалося зі строгим благочинністю. У храмі братія з благоговінням слухали церковного співу і читання, не порушуючи молитовної тиші. Охоче виконуючи покладені слухняності, ченці приєднували до них і добровільні подвиги для порятунку душі. Тому монастир преподобного Антонія був дійсним притулком світу, братської любові, взаємного самопожертви і інших християнських чеснот. Бачачи духовне зростання братії, преподобний радів і дякував Господу. Тим часом число братії Леохновской обителі зростала і з плином часу досяглоп'ятдесяти.
Дарунки прозріння і чудотворення, отримані від Господа преподобним Антонієм ще за днів відокремленого подвижництва, подвижник виявляв і в наступні часи свого життя. Так, стоячи один раз на молитві, преподобний Антоній сказав келійнику: «Брате! Сьогодні під Оршею, заради гріхів наших, побито безліч православних ». І через кілька днів до монастиря дійшла сумна звістка про поразку Російських під Оршею в битві з поляками, що сталася в той саме день, в який сказав про неї преподобний. (Орша - нині повітове місто Могилевської губернії, розташований на обох берегах Дніпра, при впадінні в неї річки Оршиця; один з найдавніших міст руських: згадується вже в XI столітті. В описуваний час Орша перебувала в руках литовців і була прикордонною фортецею. Тут зрозуміло, ймовірно, поразка російських військ недалеко від Орші, на річці Уле, 1564 р)
За життя преподобного Антонія в Леохновской обителі сталася пожежа: загорівся дах трапезної, і вогонь, що роздувається і направляється сильним вітром, готовий був перекинутися на сусідні келії. Небезпека загрожувала всьому монастирю. Переляканий келар прибіг до преподобного і, припавши до ніг ігумена, зі сльозами просив його помолитися про порятунок обителі. Тоді преподобний Антоній звернувся до ікони Всемилостивого Спаса, що стояла в келії, і так молився зі сльозами: «Господи! Волієш полюбити це місце, - допусти ж покарання з милістю і сотвори гідне ». Потім, ще з не обсохлу від сліз очима, преподобний сказав келарю: «Не бійся, брат, всемилостивий Господь Бог наш не засмутить нас понад заходи». І тільки що він вимовив ці слова, як вітер змінив свій напрямок. Завдяки цьому пожежа припинилася, заподіявши незначний збиток обителі.
Один юнак, пас овець біля монастиря, був ужалений змією і перебував при смерті. У цей час прийшов до нього преподобний Антоній і сказав: «Іди до джерела поблизу обителі і принеси води». Коли юнак виконав наказ, преподобний влив йому в рот води зі словами: «В ім'я Святої Трійці, силою Христовою зцілює тебе раб Христовий - старець Антоній». Негайно ж у хворого почалася дуже тривала і така сильна блювота, що навіть сам преподобний здивувався. Після цього хлопець відчув себе абсолютно здоровим і хотів уже гнати своє стадо далі. Але святий старець зупинив його таким питанням: «Скажи, навіщо ти вчора клявся бідну вдову, що вовк з'їв її вівцю, тоді як сам ти продав її за три срібняка?» - «Дійсно, збрехав я їй, батько». Юнак зізнався в гріху своєму і потім з подивом запитав подвижника: «Ти, батько, як дізнався про це?» «Коли я сидів в своїй келії, - відповідав преподобний, - приїхав до мене вершник на білому коні і сказав:« Антоній! Встань і йди швидше на південну сторону, де джерело. Побачиш там людини, ужаленого змією, і скажи йому: «Не клянись ім'ям Божим і Його святими, не роби неправди і віддай вдові вівцю, щоб не було тобі гірше». Тоді юнак, впавши до ніг угодника Божого, докладно сповідав перед ним свій гріх: «Точно, - сказав він, - продав я вівцю жінки за три срібняка, а їй сказав, що з'їв вовк. Вдова не повірила мені і говорила: «Хіба ти не знаєш, що я - людина бідна, але роби, як хочеш». Прошу тебе, батько, помолися за мене Господу Богу, щоб Він простив мій гріх. Вдові ж скривдженої я поверну вівцю, а в обитель на свято Преображення Господнього і убогим буду щорічно приділяти до самої смерті своєї десяту частину від стада ».
Давши покаявся повчання уникати поганих справ, щоб не зазнати ще більшого покарання, преподобний знову повелів йому повернути вкрадене. Потім зі світом відпустив юнака; і він пішов, дякуючи за своє зцілення Бога і Його угодника.
Слава про преподобного Антонія, як великого подвижника і чудотворця, поширилася по Руській землі, досягла і до Москви. Цар Іван Васильович Грозний, багато чув про угодника Божого, мав сильне бажання його побачити. Тому, коли преподобний Антоній прибув за потребами обителі в Москву, цар закликав його до себе і просив молитов і благословення. Він вручив преподобному щедру милостиню для його обителі разом з грамотами їй на землі і рибні лови на озері Ільмені.
Як дбайливий господар, преподобний Антоній багато потрудився і подбав про добробут своєї обителі. В 1587 обитель отримала пустки - Рублево і Леохново, потім в кінці XVI століття і початку XVII-го були подаровані їй інші, прилеглі угіддя. У 1606 р преподобний бив чолом про пустки Іваново, причому, скаржився, що «монастирські животини випустіті ніде», а тим часом ця пустка, що не населена, заросла лісом, підійшла до монастиря близько. Пустку дана була обителі з оброку, інші ж угіддя безоброчного.
П'ятдесят шість років трудився преподобний Антоній в чернечому образі і, будучи вже глибоким старцем, наблизився до блаженної кончини, зустріти яку Промисел Божий судив йому поза стінами рідної обителі. У 1611 р шведи вторглися в межі Новгорода і почали спустошувати його околиці. Тоді митрополит Новгородський Ісидор (Ісидор керував Новгородської єпархією з 1603 по 1619 рр.), Щоб уберегти шановного старця від небезпеки, викликав преподобного Антонія з декількома учнями до себе в Новгород. Тут старий подвижник захворів і, відчуваючи наближення своєї смерті, став з радістю готуватися до неї. У день Воздвиження Чесного Хреста Господнього старець долучився святих Христових Таїн і дав останнє благословення оточували його смертний одр. Потім він велів покликати до себе Корнилія, паламаря церкви святого Євангеліста Луки, і звернувся до нього з такими словами: «Брат Корнилію Нехай буде тобі знамення, що я стану покладеним в створеному мною монастирі благоліпного Преображення ».
Урочисте поховання блаженного старця зробив Новгородський митрополит. Трудолюбное тіло преподобного було покладено біля вівтаря Новгородської церкви в ім'я святого Євангеліста Луки на Рядітіне вулиці. (Давня церква в ім'я святого Євангеліста Луки перебувала на Софійській стороні, розташованої на лівому західному березі річки Волхова. В даний час не існує.) Місце свого поховання преподобний Антоній обрав сам, так як навала шведів відрізало доступ до Леохновской обителі.
Після видалення шведів за межі Новгородських, поневірявся по лісах жителі почали повертатися на покинуті місця. (Стара Русса повернута була Швецією Росії в 1617 р по Столбовскому світу.) На місце Леохновской обителі першим прийшов Григорій, улюблений учень преподобного Антонія, який втік з неї під час нападу шведів і потім ховався в лісі. На місці обителі він знайшов лише попелище та непоховані тіла убитих братів. Вороги не пощадили скромною обителі преподобного Антонія: убоге будова монастирське спалили, а не встигли сховатися ченців - смерті. Зі сльозами поховавши тіла вбитих, Григорій поставив на рідному попелищі маленьку келію, а біля неї - каплицю на честь Преображення Господнього. Борючись в пустелі, чернець благав Господа, щоб знову відродилася знищена ворогами обитель. Так минуло кілька років, і ось одного разу преподобний Антоній є учневі своєму уві сні і каже: «Брат Григорій! Піди в Новгород, скажи митрополиту Кіпріану і старшинам міста, щоб поклали мене на місці моєї обителі ». (Кипріан керував Новгородської єпархією з 1626 по 1634 рр.)
Григорій не звернув уваги на явище, прийнявши його за звичайний сон, хоча воно і повторилося. Нарешті, преподобний Антоній з'явився своєму учневі в третій раз і, випускаючи вогняні промені, сказав: «Якщо ти не закінчиш мого голосу, і з'явлюся в іншому місці; ти ж загинеш ».
Пустельний житель і в телеси ангел, Богоносець здався єси, постом і чуванням отче наш Антоніє, небесний дар прийняв ти: ісцеляеші недужния і душі притекающих з вірою до раки чесних мощей твоїх. Слава що дав тобі сила, слава вінчає тя, слава Чинному тобою всім зцілення.
Житія травлення, і заколот Мирський, і пристрасна Взиграніе в нічтоже поставивши, пустельний громадянин здався єси, багатьох бувши наставник, Антоніє преподобний: ченців собратель і молебнік вірний, чистоти дбайливець, моли Христа Бога спастися душам нашим.