При своєчасному початку лікування (симптоми обсесивно-компульсивного розладу проявляються менше року на момент початку терапії) досягнення стійкого поліпшення настає в 2 \ 3 випадків. Якщо захворювання триває більше року, то дуже висока ймовірність хронификации. Як правило, в перебігу хвороби спостерігаються коливання - періоди поліпшень перемежовуються з періодами загострень. Ремісії можуть бути стійкими і тривати до декількох років. Якщо в житті хворого постійно відбуваються стресові події, або хвороба має яскраво виражену важку симптоматику на тлі психастенической особистості, прогноз значно гірше. Особливо важкі випадки можуть бути дуже стійкими - наприклад, при дослідженні госпіталізованих пацієнтів з обсесивно-компульсивним розладом було виявлено, що приблизно у 75% з них симптоми зберігалися протягом 15-20 років, практично не змінюючись.
Важкі і складні форми розлади (фобії забруднення, захворювань, гострих предметів, множинні ритуали, контрастні думки) можуть ставати стійкими, не реагувати на терапію або ж виявляти тенденцію до рецидиву. Зазвичай у міру перебіг захворювання клінічна картина поступово ускладнюється.
Спостереження свідчать про те, що мужчи ни схильні до більш раннього прояву симптомів обсесивно-компульсивного розладу і важчою їх вираженості. Навіть при інтенсивної терапії в 30% випадків стан таких хворих не змінюється. Близько 80% хворих з обсесивно-компульсивним розладом протягом життя хворіють будь-яким іншим психічним розладом.