Дуже часто в лінолеумних підлогах можна зустріти такі пошкодження, як здуття, пухирі, які утворюються, щілини, хвилястості, знос окремих ділянок, відставання крайок. Бульбашки здатні виникати у випадках, коли товщина мастичного шару більше 1 мм або вона погано сохне. Здуття ж виникають після поганого розгладження самого лінолеуму.
При наявності здуття, позбутися від них допоможе шило, за допомогою якого проколюють пухирі, які утворюються і виводять повітря. Після того, як дана процедура була повністю виконана, місце освіти міхура розгладжують і притискають вантажем. Якщо стався повторний вихід бульбашок, то в такому випадку буде корисним покласти на місце здуття мішок гарячого піску або пропрасувати за допомогою гарячої праски по папері. Ліквідувати хвилястість найкраще, поклавши пристойний вантаж на поверхню лінолеуму і залишивши його на кілька днів в такому стані.
Щілини утворюються лише в тому випадку, коли перед укладанням лінолеуму його забувають винести в тепле приміщення. Найкраще при закладенні щілин користуватися водостійкою шпаклівкою з додаванням пігментів, що підходять за забарвленням лінолеуму.
Погані ділянки матеріалу, які мають неприємний зовнішній вигляд і псують враження від всього лінолеуму, потребують термінової заміни. Для цього непридатний ділянку лінолеуму акуратно вирізують за формою прямокутника або квадрата, зачищаючи від мастики. На очищене місце кладуть новий шматок лінолеуму, який повинен максимально точно підходити за забарвленням і малюнком постеленного матеріалу. Новий шматок лінолеуму може бути за розміром трохи більше. Далі його необхідно наживити маленькими гвоздиками, для того, щоб він не міг зрушити під час проведення прирізки. Прирізка здійснюється за допомогою лінійки. Після того, як буде намазаний новий шар мастики, слід покласти вставку, розгладжуючи її. Коли процедура розгладження буде виконана, вставку накривають листом фанери і зверху кладуть важкий вантаж.
Вм'ятини або дрібні пошкодження на підлозі краще закрити заздалегідь, щоб лінолеум ідеально ліг. Для цього добре підійде спеціальна мастика або шпаклівка. Необхідно взяти 20 частин каніфолі, яку потрібно розчинити в 5 частинах винного спирту і додати 4 частини касторової олії з фарбою, відповідної за кольором. Отриману таким чином суміш ретельно перемішують і наносять на поверхню підлоги. Після цього поверхню підлоги загладжується і зачищається шкіркою.