Ректор університету очолює Вчена Рада університету.
Освіта ведеться на наступних факультетах:
Факультет продовжує класичну традицію гуманітарної освіти в Росії, в тому числі дореволюційного періоду, коли викладання філологічних та історичних дисциплін велося нерозривно в рамках єдиного історико-філологічного факультету.
- Факультет релігієзнавства, етнокультурології та регіоналістики
У новітній історії Росії Факультет релігієзнавства, етнокультурології та регіоналістики став найбільшою академічної інституцією, бо свідчить про рівень значущості, яку має в житті суспільства знання про релігії і культурних традиціях народів для стабільного, поступального і безпечного розвитку.
- Факультет економіки і права
- Факультет церковного служіння
- Факультет психології
- факультет мистецтв
В університеті діють Інформаційно-технічний центр, створений на базі кафедри журналістики і PR РПУ з метою факультативного навчання студентів, і Прес-служба.
За неповні 20 років існування вузу в його розвитку взяли участь чільні представники світської і церковної науки.
Підготовка філологів та істориків у ВНЗ здійснювалася в рамках відповідних факультетів. В даний час на базі даних вузівських структур створено єдиний історико-філологічний факультет. Історико-філологічний факультет продовжує класичну традицію гуманітарної освіти в Росії, в тому числі дореволюційного періоду, коли викладання філологічних та історичних дисциплін велося нерозривно в рамках єдиного історико-філологічного факультету.
Християнський світогляд членів професорсько-студентської корпорації є відмінною рисою Російського православного університету. Це дозволяє зберігати і розвивати в процесі навчання кращі традиції російської вищої школи, засновані на єдності науки і віри. Поряд з вивченням дисциплін входять до стандартів професійної підготовки студенти вузу мають можливість розширити свої знання в області духовної культури. Богословські та доктринальні предмети в університеті традиційно викладають священнослужителі Руської Православної Церкви, випускники Московської духовної академії.
Випускники університету затребувані в самих різних сферах діяльності - державному і корпоративному управлінні, бізнесі, ЗМІ, науці, освіті. Перед випускником РПУ відкривається необмежений вибір можливостей для початку свого професійного і творчого шляху - від роботи в синодальних відділах і православних організаціях до працевлаштування в комерційних структурах і на федеральних телеканалах.
