Кисень. Збагачення води киснем в основному відбувається за рахунок його інвазії (вторгнення) з атмосфери і виділення фотосинтезуючими рослинами. Спад газу спостерігається в результаті його Еваз (виходу) з води в атмосферу і споживання на окислювальні процеси, зокрема на дихання.
По відношенню до кисню організми діляться на еврі- і стеноксідние форми (еврі- і стеноксібіонти), здатні відповідно жити в межах широких і вузьких коливань розглянутого фактора. З евріоксідних форм можна назвати рачків Cyclops strenuus, черв'яків Tubifex tubifex, молюсків Viviparus viviparus і ряд інших організмів, здатних жити в умовах майже повної відсутності або високий вміст кисню. До стеноксібіонтам відносяться війчасті черви Planaria alpina, рачки Mysis relicta, Bythotrephes, личинки комарів Lauterbornia і інші тварини, які не витримують падіння концентрації кисню нижче 3-4 мл / л.
Вуглекислий газ. Збагачення води С02 відбувається в результаті дихання водних організмів, за рахунок інвазії з атмосфери і виділення з різних з'єднань, в першу чергу з солей вугільної кислоти. Зниження концентрації С02 у воді в основному йде за рахунок його споживання фотосинтезуючими організмами і зв'язування в солі вугільної кислоти.
При високих концентраціях С02 отруйний для тварин, і з цієї причини вони часто відсутні в багатьох джерелах з водою, пересичені вуглекислотою. У невеликих концентраціях С02 потрібен тваринам для регуляції метаболізму і синтезу різних органічних речовин.
Сірководень. У водоймах він утворюється майже виключно біогенних шляхом за рахунок діяльності різних бактерій. Для водного населення він шкідливий як побічно - через зниження концентрації кисню, що йде на окислення S2- до S, так і безпосередньо. Для багатьох гідробіонтів він смертельний навіть в найменших концентраціях. Що мешкають в чистій воді поліхети Nereis zonata, рачки Daphtiia longispina і багато інших організмів не переносять навіть слідів сірководню.
Звільнення води від сірководню відбувається за рахунок окислення, що протікає як абиогенно, так і біогенної, в результаті життєдіяльності бактерій, головним чином сірчаних. Як показали дослідження Ю. І. Сорокіна, в поверхневих шарах води, де багато кисню, окислення сірководню (до сульфату і тіосульфату) здійснюється абиогенно. У верхньої межі сірководневої зони біологічним шляхом окислюється близько третини S2
глибше діяльність сірчаних бактерій пригнічується. Крім сірчаних бактерій H2S окислюють фотосинтезирующие пурпурні і деякі зелені бактерії, що використовують сірководень як донатору водню.
Метан. Подібно сірководню, отруйний для більшості гідробіонтів. Утворюється при мікробної розкладанні клітковини і інших органічних речовин. Зазвичай його обсяг становить близько 30-50% від усіх газів, що виділяються донними відкладеннями в воду. Швидкість утворення метану залежить головним чином від кількості разлагаемого субстрату і температури.