Одна з головних визначних пам'яток Свято-Михайлівського Афонського монастиря - Святе джерело гори Фізіабго, з вершини якої відкривається вид околиць обителі. Від дороги на джерело знаходиться спуск до монастирських келіях в печері з каплицею преподобного Симеона Нового Богослова. Довгий коридор печери веде в зал куполоподібної форми, з якого ведуть кілька ходів. Кажуть, що раніше підземний шлях з'єднував всі храми монастиря, що стоять на поверхні.
У підземних приміщеннях у ченців були сховище святих мощей, іконописна майстерня та прекрасна бібліотека. За пустинню в тесніне річки Фарс розкинулися монастирські поля зі ставками. Там монахи вирощували виноград і овочі, розводили рибу. На схід від монастиря розташований глибокий каньйон з чотирма водоспадами. Свято-Михайлове-Афонська закубанських пустель - самий високогірний монастир в Росії. Після його повернення в лоно церкви братія приступила до його системного відновлення.
Було розпочато капремонт храму Святої Трійці, келійного корпусу, обладнана пасіка. У цей період вся Кубань молилася за те, щоб Бог дав ченцям сили у відновленні поруганного надбання. І збирала пожертви, тому-то роботи по відродженню проходять досить інтенсивно. На горі Фізіабго побудована свята купіль у джерела святого великомученика Пантелеймона Цілителя. Зроблена внутрішнє оздоблення храму Пресвятої Трійці, на місцях святилищ колишніх храмів поставлені каплиця і поклонний хрест.
Загальне враження від змін в Свято-Михайло-Афонської закубанських пустелі - її явна спрямованість в майбутнє. І це помічають всі туристи, які відвідують обитель. Екскурсії починаються зі загального захоплення панорамою Кавказьких гір по дорозі до монастиря. Як на долоні видно вкриті снігом вершини плато Лаго-Накі. Головного Кавказького Хребта, Тибнінского, Чугумского і Оштеновского гірських вузлів. Сюди постійно приходять тисячі паломників, які мріють зануритися в святу воду, пізнати таїнство сповіді і знайти душевні сили для подальших життєвих випробувань.
Невоцерковлені туристи віддають перевагу екскурсіям до гіпсових печер, які зберігають чимало загадок. Люблять бувати на монастирських ставках, відвідувати стежки до скель Верблюд і Галкін. Підземні печерні ходи Свято-Михайлівського Афонського монастиря - для особливих любителів. На жаль, не скрізь вдається пройти через завали, але там, де це можливо, видно, що всі вони мають продовження. Система цих ходів, на думку фахівців, нагадує систему підземних ходів знаменитої Києво-Печерської лаври. Холодна вода в купальнях не лякає паломників.
Тільки за останній час в Свято-Михайло-Афонської закубанських пустелі сталося чудотворне зцілення кількох онкологічних хворих, від яких вже відмовилися лікарі. На стінах купальні невипадково розміщені молитви святого Пантелеймона. Їх читання посилює цілющу дію святої води. Допомагає страждає, звичайно, і турбота братії про мандрівників. У монастирському подвір'ї їх обов'язково напоять чаєм і пригостять млинцями з колесо до воза.