За допомогою ДНК-зондів, що представляють собою клоновані послідовності мінісателітів і взаємодіючих тільки з одним локусом, можна отримувати інформацію про генотип досліджуваного організму.
Отримано сотні клонів мінісателітних ДНК і на їх основі розроблено комбінації зондів, придатні для визначення батьківства. При виборі зондів керуються такими критеріями: зонди повинні володіти суворої локус-специфічність, а тестовані локуси бути незчеплених і мати достатню, але не надмірною генетичної стабільністю. Серед найбільш широко використовуваних зондів MS1 (D1S7) відповідає генетичному локусу, гетерозиготному в 99% випадків, однак він мутує з дуже високою частотою (0,05 на гамету) і тому не використовується при визначенні батьківства (рис. II.37, а). У той же час для локусу D1S80 зі значно меншою варіабельністю (84% гетерозигот) характерне утворення кластерів в частотах розподілу фрагмента ДНК по довжині (див. Рис. II.37, б). Тому невеликі помилки у визначенні довжини алелей можуть привести до значних помилок в оцінці частоти їх зустрічальності. Такі локуси досить легко змінюються в результаті генетичного дрейфу і інбридингу.
Розроблено теорію, яка вказує, скільки локусів має бути тіпірованних для отримання правильної відповіді про батьківство при відомих значеннях гетерозиготности цих локусів в популяції. Наприклад, якщо використовуються локуси, гетерозиготность яких становить 90%, для встановлення батьківства необхідно проаналізувати шість таких локусів. У США для цих цілей зазвичай використовується набір з трьох-п'яти однолокусних зондів.
Однолокусние зонди мають низьку роздільну здатність щодо братів і сестер (сибсов). Зокрема, за допомогою одного такого зонда можна лише з ймовірністю 75% виявити генетичні відмінності між сибсами, і ця ймовірність збільшується до 99,6% при використанні чотирьох зондів.
Випадковий малюнок з бази знань:
Увага! Інформація на сайті
www.humbio.ru призначена виключно для освітніх
і наукових цілей