У 1970-х роках на третій майданчику комплексу (с. Молочне) був побудований радіотелескоп РТ-70, який до цього дня один з кращих за технічними характеристиками.
До 1980 року в НІП-16 функціонував Центр управління космічними польотами (ЦУП) пілотованими космічними кораблями. Звідси велося управління 41 кораблем «Союз», 6 орбітальними станціями «Салют», 14 вантажними кораблями «Прогрес».
З 1982 на базі ЦДКС почав функціонувати Запасний центр управління наземної і орбітальної угрупованнями Військово-космічних сил МО СРСР, який паралельно з основним Командним пунктом Головного центру управління та випробувань космічних засобів МО СРСР планував і керував роботою наземних засобів з управління комічними апаратами різного призначення і був готовий в будь-який момент взяти керування на себе.
В кінці 1989 року на базі 98-го окремого науково-вимірювального пункту (НІП-16, в / ч 34436) був сформований один тисяча двісті сімдесят дві-й Центр командно-вимірювальних комплексів (ЦКІК-5) (в / ч 31455), куди крім НІП- 16 організаційно входили НІПи в Червоному селі (НІП-9), Шкільному (79-й ОНВП, НІП-10), Щелково (НІП-14), Дунаївцях (43-й ОНВП, НІП-19), Родниковому (НІП-24) .
У складі незалежної України
Після приєднання Криму до Російської Федерації
У Міністерстві оборони Росії заявили, що на момент входження Криму до складу Росії комплекс перебував у жалюгідному стані - з усіх споруд в робочому стані була лише одна антена для майбутнього управління українським космічним апаратом «Либідь», запуск якого до цих пір не відбувся. За час української експлуатації НЦУВКЗ не знайшов для нього застосування і унікальні майданчики комплексу були розграбовані. У штабі військ ВКО заявили, що практично відразу приступили до оснащення об'єкта новими командно-вимірювальними системами управління космічними апаратами і комплексами системи контролю космічного простору. Оскільки самі антенні системи практично не старіють, то, замінивши застарілу і вийшли з ладу приймально-передавальну апаратуру на сучасну, можна отримати новий інструмент [11].
Центр далекого космічного зв'язку був обладнаний новітньою російською командно-вимірювальної системою «Фазан МТС», що має радіус дії від 100 до 40 000 км. Дана система вирішує завдання з управління всією орбітальної угрупованням Росії. [13] [14]