Крім серозного покриву, селезінка володіє власною сполучнотканинною капсулою, tunica fibrosa, з домішкою еластичних і неісчерченних м'язових волокон. Капсула триває в товщу органу у вигляді перекладин, утворюючи остов селезінки, що розділяє її на окремі ділянки. Тут між трабекулами знаходиться пульпа селезінки, pulpa lienis. Пульпа має темно-червоний колір. На свежесделанном розрізі в пульпі видно більш ясно пофарбовані вузлики - folliculi lymphatici lienales. Вони являють собою лімфоїдні освіти круглої або овальної форми, близько 0,36 мм в діаметрі, сидять на стінках артеріальних гілочок. Пульпа складається з ретикулярної тканини, петлі якої наповнені різними клітинними елементами, лімфоцитами і лейкоцитами, червоними кров'яними тільцями, в більшості вже розпадаються, з зернятками пігменту.
В селезінці, як і в лімфовузлах, є Т-залежні і В-залежні зони. Періартеріолярние лімфоїдні скупчення представляють собою Т-залежні області, в яких 75% складають CD4 + клітини, а 25% складають CD8 + клітини.
По-залежними є фолікули з зародковими центрами. Весь цей шар, насичений лімфоцитами, отримав назву білої пульпи селезінки. Артеріоли закінчуються судинними синусами, навколо яких зосереджені макрофаги, дендритні клітини, окремі лімфоцити і плазматичні клітини, що відповідає поняттю - червона пульпа селезінки.
Селезінка є місцем розпізнавання антигена, антігензавісімого проліферації і диференціювання Т- і В-лімфоцитів, їх активації, а також продукції і секреції специфічних антитіл імуноглобулінів.
Основна відмінність селезінки від лімфовузлів полягає в тому, що селезінка є місцем специфічної імунної відповіді на антигени, що циркулюють в крові, а в лімфовузлах розігруються процеси специфічної імунної відповіді на антигени, що потрапляють в лімфу. Крім того, селезінка з її багатою мережею макрофагів в червоній пульпі виконує функції фільтра крові, що видаляє з крові потрапляють туди чужорідні частинки і молекули, а також постарілі еритроцити, або еритроцити, навантажені імунними комплексами.
Селезінка погано репаруючу в разі пошкоджень, тому після травм її доводиться видаляти. Крім того, видалення селезінки (спленектомія) є одним з методів лікування анемії. Селезінка не є органом, необхідним для життя. Її функції можуть частково брати на себе інші периферичні органи імунної системи. Однак люди, які перенесли спленектомія, відрізняються підвищеною чутливістю до інфекцій, викликаним капсульними бактеріями (пневмокок та ін.). Корекція такого селективного імунодефіциту досягається за допомогою імунізації таких людей вакцинами, що містять бактеріальні капсульні полісахариди.