Комплектування музейного фонду здійснюється відповідно до наукової концепцією відбору предметів з краєзнавства Прокопьевска, Прокоп'євську району і Кузбасу, побуті жителів регіону, історії промислових підприємств, про знаменні історичні події і т. Д.
Основу колекції «Живопис» складають картини, виконані маслом, гуашшю, аквареллю місцевими професійними і самодіяльними художниками. Серед них роботи художників В. Н. Ковякіна, М. В. Перепечина, Г. В. Стаценко, В. І. Самошкина, В. В. Морозова, О. Д. Комарова, Н. Елесіна. Найпоширеніші сюжети - пейзаж, види Прокопьевска, виробнича тематика, портрет.
До складу колекції «Графіка» входять ліногравюри художників А. С. Холодова, О. Д. Комарова, М. В. Перепечина, Г. В. Стаценко, а також плакатна графіка.
Колекція «Скульптура» представлена 4 предметами. У колекцію входять бюсти відомих земляків - першого стахановця Кузбасу, кавалера Ордена Леніна І. А. Борисова, радянського геолога і палеонтолога В. Я. Яворського, діяча революційного і партизанського руху П. Ф. Сухова, і скульптура Михайла Волкова - першовідкривача ковальських вугілля.
Збори «Предмети побуту, етнографії, декоративно-прикладного мистецтва» включає в себе історико-побутові предмети різної тематики і складається з декількох колекцій: «Етнографія», «Побут», «ДПІ».
Етнографічна колекція представлена предметами, характерними для таких етносів як шорці, телеутами, російські.
Шорська колекція включає предмети побуту і традиційного язичницького культу шорців, одного з корінних народів Кузнецького краю, знаряддя праці та полювання, домашнє начиння, справжній бубон шамана початку ХХ ст.
Телеутская колекція представлена предметами традиційного жіночого одягу телеутов (плаття «кунек», шуба «Телень», пальто «сирмал» та ін.) І прикрасами (святковий нагрудник «тоштёк», пояс «курей», сережки, підвіски).
Російська етнографічна колекція складається з селянських побутових предметів (ткацький верстат, рубелі, праски, вальки, чавунці, самовари, прядки, веретена, рогачі, чесалки, ручний млин, олійниця та ін.), Сільськогосподарських знарядь (вила, граблі, елементи упряжі, плуг і ін.), зразків національного одягу (сорочки жіночі, сорочки), предметів рукоділля (рушники, рушники, скатертини, мережива і т. д.)
Колекція виробів декоративно-прикладного мистецтва включає в себе різноманітні вироби з берести, виконані Прокоп'євськ майстрами.
Колекція «Побут» входить як складова частина в колекцію «Інше» та включає в себе, в основному, предмети побуту радянського періоду - меблі, кухонне начиння, посуд, фарфор, скло, текстиль і т.д.
До складу колекції «Нумізматика» музею входять срібні монети XVIII-XIX ст. нагороди учасників Великої Вітчизняної війни, трудові нагороди і знаки, відомчі і обласні нагороди, значки.
Особливий інтерес представляє набір медалей «Прокоп'євськ - перлина Кузбасу» і срібна медаль імені М. М. Пржевальського «За подорожі».
Численна колекція значків складається з загальнодержавних і відомчих знаків, а також значків, присвячених подіям з життя міста.
Колекція «Археологія» охоплює періоди присутності людини на Коваля землі від епохи каменю до залізного віку.
Археологічні матеріали епохи палеоліту і неоліту представлені артефактами Кузедеевской і Дегтярівській стоянок, предметами Андронівська і ірменская культур.
Епоха бронзи представлена предметами тагарской культури. Про епоху заліза свідчать матеріали, отримані в результаті розкопок курганного групи Ур-Бедарев. Представлені предмети озброєння тюркського воїна IX - XI ст.
Колекція «Рідкісна книга» налічує 39 одиниць зберігання. Серед них богослужбові стародруки кінця XIX - початку XX ст. З книг світського змісту можна виділити видання в 2-х томах «Історична фізика» 1908 р ілюстрований журнал літератури «Нива» 1901 р книга «Від шахти до океану» - про Почесному громадянинові Прокопьевска контр-адмірала Бабушкіна А. С. написана його дочкою, книги, видані до 1939 р а також видані малими тиражами.
У нечисленну колекцію «Зброя» входять зразки холодної та вогнепальної зброї. Вогнепальна зброя не може бути використано за основним призначенням в результаті спеціальної пробивки.
Музейне зібрання «Документи» включає в себе кілька колекцій «Документи», «Фотографії», «Фонодокументи».
Колекція «Документи» представлена документами біографічного характеру, а також документами, що містять історичну інформацію про багатьох суб'єктах міста.
Численні меморіальні фонди включають в себе документи діячів радянського періоду історії. Серед них більшу частину займають фонди вчених В. І. Яворського та Н. А. Чінакала.
Про репресії 1930-1950-х рр. в місті свідчать меморіальні фонди сімей Гауса, Сич-Сичук, Гусєва, Волинського.
Бойовий і трудовий подвиг прокопчан в роки Великої Вітчизняної війни відображений у великому фонді ветеранів ВВв, в тому числі Героїв Радянського Союзу.
Тематична колекція фонду включає в себе архівні матеріали про дивізіях, що формувалися з прокопчан, документи і фотографії бійців, які боролися в складі цих формувань на фронтах Великої Вітчизняної війни.
Трудові заслуги міста у воєнні роки відображені в матеріалах про знаменитих Прокоп'євськ шахтарів, Героїв Соціалістичної Праці, жінок, які замінили чоловіків в шахтах, медичних працівників, самовіддано працювали в госпиталях.
Великий інтерес представляє унікальна колекція документів і фотографій Прокоп'євську аероклубу, ретельно зібраних вдовою інструктора Негріева В. С.
Про бурхливому промисловому розвитку Прокопьевска розповідають великі матеріали з історії підприємств міста. До них відносяться підприємства добувної промисловості, завод «Електромашина», Прокопьевский завод шахтної автоматики, швейна фабрика «горнячки», фарфоровий завод.
Колекція «Фотографія» представлена побутовими, виробничими, пейзажними знімками, а також фотопортретами городян. У Фотофонд зберігається добірка фотознімків діячів партії, комсомолу, колективів промислових підприємств, різних установ міста.
Колекція «Фонодокументи» включає патефонні пластинки і вінілові диски радянського періоду.
Природно-наукова колекція представлена матеріалами по живій і неживій природі.
Палеонтологічний частина колекції складається з кісток і зубів мамонта, шерстистого носорога, бізона, велетенського оленя. Кістки цих тварин були знайдені на території нашого міста під час розробки корисних копалин. Є зразки з відбитками фауни, в тому числі трилобітів, брахіопод, коралів.
Палеоботанічні частина складається з набору скам'янілих стовбурів дерев, відбитків папоротей, плауновідних.
Зоологічна колекція представлена опудалами птахів і звірів, колекцією комах.
В геологічній колекції представлені зразки мінералів Росії, корисних копалин Кузбасу і вугілля Прокоп'євську району.
Колекція «Предмети історії техніки» включає в себе різні види годин (настінні, настільні, кишенькові годинники XX в.), Фотоапаратів і фототехніки радянського виробництва, звуковідтворювальної апаратури (патефони, радіоли, електрофони, приймачі і ін.), Запису та відтворення звуку, швейних машин, шахтарських світильників, відбійних молотків і ін.
Ряд музейних колекцій входить в загальні збори під назвою «Інше». Сюди включені музейні колекції: «Побут», «Вироби Прокоп'євську фарфорового заводу», «Одяг», «Ікони», «Сувеніри» і ін.
Активно формується музейна колекція «Вироби Прокоп'євську фарфорового заводу». як унікального єдиного підприємства такого роду в Західному Сибіру.
Колекція «Одяг» досить обширна. У неї входять мундири і костюми Почесних шахтарів міста, кітелі контр-адмірала А. С. Бабушкіна і льотчика-космонавта двічі Героя Радянського Союзу Б. В. Волинова і ін.
У колекції «Ікони» присутні мальовничі ікони, ікони, виконані на бересті, а також бронзові ікони в техніці металопластики і ін.
Колекція «Сувеніри» складається з предметів, отриманих від різних делегацій в зв'язку зі знаменними датами міста і промислових підприємств, а також сувенірів, які свідчать про широкі міжнародні зв'язки Прокопьевска.
Також в колекцію «Інше» входить збори поддужние дзвіночків середини XIX в.