Гуртки юннатів - це основна форма організації Юннатський роботи в школах, на станціях юних натуралістів, в будинках і палацах піонерів, піонерських таборах, клубах.
Гуртки юннатів виховують у учнів інтерес і любов до природи, сільського господарства, розширюють і поглиблюють знання з біології, хімії, географії, основ сільського господарства. У хлопців формуються навички по вирощуванню рослин і догляду за тваринами. Юннати вивчають природу і вчаться дбайливо ставитися до неї. Заняття в гуртках юних натуралістів розвивають самостійність, ініціативу, підвищують інтерес дітей до дослідницької роботи, виховують культуру праці.
З огляду на місцеві умови, на станціях юних натуралістів організовують різні гуртки: рільників, садівників, городників, квітникарів, кролівників, акваріумістів, орнітологів, друзів природи, механізаторів сільського господарства, агрохіміків, гуртки біологічного профілю-фізіологів, мікробіологів.
У цих гуртках займаються школярі починаючи з IV класу. Хлопці самі вибирають гурток, в якому будуть займатися під керівництвом досвідченого педагога, фахівця з даної теми. Учні середнього і старшого віку вивчають теми з біології окремих видів рослин і тварин, селекції, насінництва, агрохімії, охорони природи, працюють на шкільних навчально-дослідних ділянках, в учнівських виробничих бригадах, в колгоспах і радгоспах. Заняття в гуртках проводять 1-2 рази на тиждень.
Для молодших юннатів працюють гуртки початкових класів. Там вони отримують основні відомості про природу і сільське господарство, знайомляться з найпростішими прийомами догляду за рослинами і тваринами, ставлять неважкі досліди на навчально-дослідних ділянках, працюють в куточках живої природи.
Хлопці з гуртків юних натуралістів здійснюють екскурсії в природу, бувають в колгоспах, радгоспах, лісових господарствах, на дослідних станціях, в ботанічних садах і зоопарках, в науково-дослідних інститутах, де знайомляться з роботою передовиків сільського та лісового господарства, досягненнями біологічної та сільськогосподарської науки , беруть участь в походах і експедиціях по вивченню рідного краю. Члени гуртків беруть участь в підготовці та проведенні масових заходів-зльотів, виставок, свят врожаю і квітів, Дня лісу, Дня птахів.
Плани занять розраховані зазвичай на один-два роки. Багато тем, завдання гуртки юннатів отримують від вчених і фахівців сільського та лісового господарства. Хлопці проводять спостереження, ставлять експерименти. Підсумки роботи гуртка, кращих юннатів обговорюються на зборах. Матеріали, зібрані юннатами під час походів та екскурсій, результати опитніческой роботи вивчають на заняттях гуртка, оформляють альбоми, гербарії.
Після закінчення роботи в гуртку протягом одного-двох років юннат може працювати під наглядом керівника гуртка по вузькій спеціальності, наприклад займатися селекцією гладіолусів, сортовипробування смородини, історією культурних рослин та іншими темами.
Роботи кращих юних натуралістів демонструються в павільйоні «Юні натуралісти і техніки» ВДНГ СРСР, про них розповідають в журналі «Юний натураліст».