Після взяття Бухари тюрками і падіння династії Саманідів в 1002 Ібн Сіна попрямував в Ургенч, до двору правителів Хорезма. Тут його стали називати «князем лікарів». У 1008 році після відмови Ібн Сини вступити на службу до султана Махмуда Газневі благополучне життя змінилася роками поневірянь. Деякі роботи він писав у сідлі під час своїх довгих переїздів.
У 1015-1024 рр. жив в Хамадане, поєднуючи наукову діяльність з вельми активною участю в політичних і державних справах емірату. За успішне лікування еміра Шамс ад-Давла він отримав посаду візира, але нажив собі ворогів у військових колах. Емір відхилив вимогу військових зрадити Ібн Сину страти, але прийняв рішення змістити його з займаної посади і вислати за межі своїх володінь. Через сорок днів з еміром трапився черговий напад хвороби, який змусив його відшукати вченого і знову призначити своїм міністром.
Після смерті еміра за спробу перейти на службу до правителя Ісфахана на чотири місяці він був заточений у фортецю. В останні роки життя служив в Ісфахані при дворі еміра Ала ад-Давла. Перед смертю він наказав відпустити всіх своїх рабів, нагородивши їх, і роздати все своє майно бідним.
Ібн Сіна був учений, одержимий дослідним духом і прагненням до енциклопедичного охоплення всіх сучасних галузей знань. Філософ відрізнявся феноменальною пам'яттю і гостротою думки.
Написаний на арабському енциклопедична праця «Книга зцілення» ( «Кітаб аль-Шифа») присвячений логіці, фізиці, біології, психології, геометрії, арифметиці, музиці, астрономії, а також метафізиці. «Книга знання» ( «Даниш-наме») також є енциклопедією.
Праці з медицини
Основні медичні твори Ібн Сини:
оздоровча фізкультура
Він писав у своїй праці про роль і місце фізичних вправ в оздоровчій і лікувальній практиці. Дав визначення фізичних вправ - довільні рухи призводять до безперервного, глибокого дихання.
Він стверджував, якщо людина помірно і своєчасно займається фізичними вправами і дотримується режиму, то він не має потреби ні в лікуванні, ні в ліках. Припинивши ці заняття він занепадає. Фізичні вправи зміцнюють м'язи, зв'язки, нерви. Він радив при заняттях враховувати вік і здоров'я. Висловлювався про масажі, загартовування холодною і гарячою водою. Рекомендаціями Авіценни могли скористатися тільки феодали.
Оздоровча фізкультура придумана їм жива донині і тисячу років допомагає людям.
У розумінні предмета метафізики Ібн Сіна слідував Аристотеля. Слідом за Аль-Фарабі Ібн Сіна розрізняє можливо суще, існує завдяки іншому, і абсолютно необхідно суще, існує завдяки собі. Ібн Сіна стверджує совечность світу Творця. Творіння у вічності Ібн Сіна пояснював за допомогою неоплатонічної поняття еманації, обгрунтовуючи таким чином логічний перехід від первісного єдиного до множинності створеного світу. Однак на відміну від неоплатонізму він обмежував процес еманації світом небесних сфер, розглядаючи матерію не як кінцевий результат сходження єдиного, а як необхідний елемент будь-якого можливого буття. Космос ділиться на три світи: матеріальний світ, світ вічних нестворених форм, і земний світ у всьому його різноманітті. Індивідуальна душа утворює з тілом єдину субстанцію, що забезпечує цілісне воскресіння людини; носієм філософського мислення виступає конкретне тіло, схильне до прийняття розумної душі. Абсолютна істина може бути осягнута за допомогою інтуїтивного бачення, яке постає кульмінацією процесу мислення.
До кола містичних творів Ібн Сини відносяться «Книга про птахів», «Книга про любов», «Книга про сутність молитви», «Книга про сенс паломництва», «Книга про позбавлення від страху смерті», «Книга про приречення».
Йому ж належать вірші перською мовою, здебільшого у формі рубаї.
Перебуваючи в Гургані, Ібн Сіна написав трактат про визначення довготи цього міста. Ібн Сіна не зміг скористатися тим методом, яким користувалися Абу-л-Вафа і ал-Біруні, і запропонував новий метод, що складається у вимірі кульмінаційної висоти Місяця і її порівнянні з висотою в Багдаді шляхом обчислень за правилами сферичної тригонометрії.
У «Книзі про спосіб, улюбленому іншим способам при конструюванні наглядової інструменту», Ібн Сіна описав винайдений ним наглядова інструмент, який на його думку, повинен був замінити астролябію; в цьому інструменті для уточнення вимірювань вперше застосовувався принцип ноніуса.