Київський Іонинський монастир був заснований батьком Іоною. На тому місці, де сьогодні стоїть обитель, колись знаходилися зубожілі хатини, але завдяки працьовитості ченця це місце вдалося перетворити й заснувати тут храм. За життя батька Іони чутка про цей монастир розносився по всій Русі, і паломники приїжджали сюди з усіх округ для того, щоб поклонитися святим місцям.
Історія Іонинського монастиря починається з передбачення Преподобного Серафима Саровського, у якого Іона довгий час був послушником. Він передрік своєму вихованцю долю організатора чоловічого монастиря. Також згідно з переказами, самому Йони неодноразово був образ Матері Божої як знак необхідності устроительства храму.
З благоустроєм монастиря Йони допомогла княгиня Васильчикова, у якій той був духовним батьком. Пожертвувавши велику суму, вона також зайнялася клопотанням про заснування обителі у імператора Олександра II. Після того, як імператор дав свою згоду, на Звіринецькою горі виріс величний кам'яний собор зі школою-притулком для хлопчиків і лікарнею на його території. І хоча нинішній Іонинського монастиря кардинально відрізняється від старого, тут як і раніше вершать добрі справи, допомагають бідним і навчають дітей. Після смерті батька Іони настали досить сумні часи для монастиря і його прихожан, однак храм зумів пережити всі труднощі і продовжив свою роботу.