Щоб у куща перцю були добре розвинені бічні пагони, його верхівку видаляють тоді, коли рослина заввишки сягає 22-26 см. Після того як верхівка рослини видалена, кущик починає гілкуватися. Відбувається це в такий спосіб: з пазухи кожного аркуша виходить нова гілка. Іноді їх кількість може досягати 10-15 штук, в залежності від того, скільки в момент прищипування верхівки залишилося внизу листя. З усіх з'явилися нових пагонів слід залишити 4-6 самих верхніх, а решта видалити і видаляти знову, якщо вони починають рости заново. Надалі до самого збору врожаю слід ретельно стежити за появою внизу пагонів і своєчасно їх видаляти. Залишені на верхівці 4-6 нових пагонів в свою чергу прищипують, як тільки ті досягають довжини 10-15 см.
Оптимальне число пагонів у перцю формується на гілках третього порядку. Ці гілки вже не прищипують, а чекають початку цвітіння і утворення зав'язі. На кожному кущі перцю, в залежності від його розміру, залишають від 10 до 15 плодів, інші вищипують ще на стадії цвітіння, щоб рослина не витрачала занадто багато сил. Якщо залишити все плоди, які сформуються, урожай буде дрібним, а від тісноти дуже велика можливість різних хвороб, в тому числі і гнилі. Для того щоб найкращим чином пройшло запилення перцю і зав'язалися плоди, кущі перцю в суху сонячну погоду добре струшують, так само роблять зазвичай з томатами і баклажанами. Перець відноситься до світлолюбних рослин, і якщо він погано росте, недостатньо гілкується або слабо цвіте, а плоди виходять маленькими, можливо, рослині не вистачає світла. При виборі місця для розміщення кущів перцю слід враховувати цю його потребу.
У тому випадку, якщо перець вирощується не на відкритому повітрі, а вдома, на балконі або в теплиці. слід ретельно стежити за вологістю повітря і температурою. Якщо температура дуже висока, близько 30оС і вище, а вологи в грунті недостатньо, у перцю, як і у томатів і баклажанів. відбувається одревеснение плодів і тріщини на них. Якщо при такій підвищеній температурі і вологість висока, дуже великий ризик зараження рослин і плодів різними сортами гнилі. Найчастіше гниль вражає плоди і листя, після чого перець вже непридатний в їжу. Саме тому в теплицях особливо ретельно потрібно стежити за густотою гілок кожного куща і кількістю плодів на ньому. Без формування куща урожай буде мізерним, але в цьому питанні потрібно знати міру.