Під організацією наукових досліджень мають на увазі систему взаємопов'язаних структур і функцій, що забезпечують оптимальний режим і безперервне вдосконалення наукової праці з метою отримати найкращі результати.
Відповідно до ієрархією структур наукових установ і відомств розрізняють організацію досліджень на різних рівнях:
- праці науковця;
- роботи підрозділів наукової установи;
- діяльності об'єднань наукових установ в системі академій і міністерств.
Важливе місце в підвищенні ефективності наукової діяльності займає наукова організація праці (НОТ), основні положення якої передбачають:
- високу організованість праці науковця;
- суворе дотримання режиму і гігієни розумової праці;
- критику і самокритику;
- контролювання і точне фіксування результатів роботи;
- забезпечення резерву в науковій роботі;
- використання коштів для автоматизації допоміжних операцій;
- систему методів і вправ з удосконалення пам'яті науковця;
- колективність в науковій роботі.
Принципами НОТ повинні володіти всі науковці і особливо важливо, щоб їх засвоїли молоді, початківці дослідники, в тому числі аспіранти і студенти.
Наукова творчість стає все більш колективним, що обумовлено, з одного боку, концентрацією вчених в наукових установах, а з іншого - розширенням спільних наукових пошуків.
Тому особливу увагу набувають питання організації наукових колективів, структура яких повинна забезпечувати можливість кооперації і спеціалізації праці вчених і поглиблення знань в певних напрямках, чіткий розподіл обов'язків і рівномірність завантаження виконавців, проведення робіт з найбільшим ефектом, створення єдиної системи планування, організації та контролю виконання робіт .
Управління науковими дослідженнями є цілеспрямований вплив на колективи науковців для організації та координації їх діяльності в процесі виробництва нових наукових знань і ефективного використання їх на практиці.
Економічні методи управління визначаються виробничими відносинами і рівнем розвитку країни. З одного боку, держава централізовано фінансує з бюджету наукові дослідження, встановлює фонд зарплати, а з іншого - заохочує дослідження на основі господарських договорів і приватних інвесторів.
Управління науковими дослідженнями включає ряд функцій:
- підбір, розстановка, підвищення кваліфікації і виховання наукових кадрів;
- оперативне управління та контроль за виконанням;
- впровадження результатів наукової роботи;
- організація служби науково-технічної інформації;
- розвиток наукового колективу установи;
- вдосконалення організації наукової праці;
- організація фінансової діяльності і зарплати співробітників;
- матеріально-технічне забезпечення наукових досліджень;
- забезпечення обліку та звітності;
- охорона праці, поліпшення побутових умов працівників.
Процес управління НДР багатогранний, має свої специфічні особливості і закономірності. Він включає наступні основні операції: визначення мети управління, збір інформації та її переробку; прийняття рішення; організацію виконання прийнятого рішення; облік і контроль за виконанням рішення. Цей процес безперервний, в ньому задіяний ряд осіб (керівників і виконавців). Коло питань, за якими приймають рішення керівники колективів (група, кафедра і лабораторія, директор або ректор), різний.
Відповідальний виконавець - керівник на робочому місці. Керує технічним персоналом, науковими співробітниками, в першу чергу молодими. Безпосередньо беручи участь в процесі досліджень, він здійснює оперативне управління, контроль за виконанням теми НДР, впровадженням отриманих результатів у виробництво.
Завідувач лабораторією (кафедрою) відповідає за планування НДР, впровадження, вдосконалення НОТ, здійснює виховання і керує підвищенням кваліфікації. Він координує НДР між відповідальними виконавцями. Керівник вирішує перспективні проблеми, керує публікацій результатів, оформленням заявок на винаходи і т.д.
Керівник установи приймає рішення про підбір і розстановку кадрів, решіт питання перспективного розвитку, визначає функції кожного підрозділу. Свої рішення він оформляє в формі наказів.