Ось тубуса мікроскопа служить орієнтиром для центрировки об'єктива. Завдання центрировки полягає в тому, щоб оптична вісь об'єктива збіглася з вертикальною віссю тубуса. Перевірка центрировки об'єктива особливо необхідна в мікроскопах, забезпечених револьверної насадкою. Для виконання центрировки потрібно взяти окуляр з хрестоподібно пересічними нитками в полі зору. Точка перетину ниток окуляра збігається з віссю тубуса. Щодо точки ведеться центрировки об'єктива.
Якщо мікроскоп забезпечений револьверної насадкою, то її знімають і об'єктив ввинчивают безпосередньо в тубус. Для цього потрібно використовувати додатковий перехідне кільце, висота якого повинна бути дорівнює висоті самої насадки, тобто 15 мм. На предметний столик мікроскопа кладеться препарат з перехресними лініями. Мікроскоп фокусується, і пересуванням предметного столика зображення перехрестя препарату поєднується з хрестом ниток окуляра. Після цього об'єктив вигвинчується з тубуса, ставиться револьверна насадка і об'єктив угвинчується в отвір для нього. Збереження суміщення перехрестя свідчить про правильну установку револьверної насадки з об'єктивом. У разі розбіжності перехрестя, центрировки досягається переміщенням револьверної насадки за допомогою зосереджених гвинтів. Центрировки об'єктива, так само як і центрування конденсора, проводиться при сфальцьованому конденсорі і об'єктиві.
Центрировки діафрагми і конденсора.
Після перевірки центрировки об'єктива необхідно от'юстіровать ірисову діафрагму і конденсор. Ця центрировки проводиться по відношенню до об'єктиву. Видаливши конденсор і закривши діафрагму майже до повного закриття, встановлюється найслабший довгофокусний об'єктив і фокусується безпосередньо на отвір діафрагми. Зображення діафрагми, що спостерігається через окуляр з перехрестям, поєднують з точкою перетину нитки окуляра. Поєднання виробляється за допомогою центріровочнимі гвинтів, а якщо такого пристосування немає, то ексцентричним переміщенням діафрагми.
Центрировки конденсора проводиться після того, як отцентрирована діафрагма.На столик мікроскопа кладеться препарат, частково розсіює проходить через нього світло. Сфокусувавши об'єктив і конденсор, видаляють окуляр і спостерігають зображення діафрагми конденсора через безлинзовий, так званий центріровочнимі окуляр, забезпечений маленьким отвором в центрі. Якщо такого окуляра в комплекті мікроскопа немає, то його можна замінити саморобним ковпачком з чорного паперу. У центрі ковпачка, надягнутого на верхній кінець тубуса, треба проколоти отвір. Отвір з ірисовою діафрагмою має бути відкрито настільки, щоб коло об'єктива був заповнений світловим конусом, що виходять з конденсора. Обертанням центріровочнимі гвинтів конденсора поєднують зображення діафрагми з краями вихідного отвору об'єктива.
Центрировки дзеркала.
З білого паперу вирізається диск, діаметр якого точно відповідає діаметру оправи дзеркала. Центр паперового диска відзначається точкою, після чого диск приклеюється легко змивається клеєм до дзеркала. Конденсор, об'єктив і окуляр видаляються. Отвір діафрагми конденсора закривається до граничної величини. На місце окуляра ставиться центріровочнимі окуляр або паперовий ковпак з проколом. Два отвори - діафрагми і паперового ковпачка - служать прицілом, через який можна відцентрувати третю точку - центр паперового диска, тобто дзеркало.