Для дезінфекції підстилкового гною широко використовують біотермічним метод, при якому гній з вологістю не більше 70% складають пухко в бурт і обкладають торфом. соломою або тирсою. Етап дезінфекції 2-3 місяців.
При вологості гною 70-88% розумно компостувати гній з торфом, соломою, тирсою. Вологість компостируемой маси не повинна бути більше 70%. Процес дезінфекції подібного компосту триває півроку за умови формування биотермического процесу при температурних показниках 60-70 ° С.
Для дезінфекції гною шляхом довготривалого зберігання потрібно обладнати 3 траншеї, кожна об'ємом на річний вихід його по фермі. Траншею після заповнення закривають торфом, грунтом (10-15 см) і переносять протягом року при неспорообразующих мікроорганізмах і два роки при наявності туберкульозної палички.
Хімічні способи знаходять своє використання при знезараженні рідкого гною в карантинних або інших ємностях. Для цих цілей використовують безводний аміак - 30 кілограм на один м 3 гною маси, тривалість дії 5 діб.
Знезараженню підлягає гній, який інфікований мікобактеріями туберкульозу, неспороутворюючих мікроорганізмами, яйцями і личинками гельмінтів. Ємності для дезінфекції аміаком повинні бути закритими. Потрібно дотримуватися діючі правила безпечного використання рідкого аміаку в сільському господарстві.
Вживають для дезінфекції та сухе хлорне вапно (незгірш від 25% активного хлору), яку беруть з розрахунку один кілограм при зараженні споровими збудниками і 0,5 кілограма неспороутворюючими мікробами на 20 літрів гною.
Фізичні способи дезінфекції досягаються використанням високих температур (110-120 ° С) при застосуванні пароструминних установок (тиск 0,2 мПа, експозиція 10-25 хвилин); 100-140 ° С при термічній сушці протягом 45-60 хвилин.
В обґрунтованих епізодах (сибірська виразка, емфізематозний карбункул, сказ, чума, енцефаломієліт і ін.) Гній спалюють.